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FKBP12与其抑制剂作用的结合自由能计算 被引量:2

FREE ENERGY CALCULATION OF FKBP12 AND IT'S INHIBITOR
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摘要 FKBP12(FK506-binding proteins-12)是一种具有神经保护和促神经再生作用的蛋白.文中采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了FKBP12-TST复合物的绝对结合自由能.通过能量分解的方法考察了FKBP12分子主要残基与配体TST之间的相互作用. FKBP12 plays important roles in the treatment of nerve injuries and neurodegenemtive disorders. The absolute binding free energy of FKS06 - binding proteins - 12 with a potent inhibitor TST was calculated by molecular dynamics simulation with MM- PBSA method, and reasonable results were obtained. Furthermore, the interaction between FKBP12 and TST was evaluated by energy decomposition analysis.
出处 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第2期34-35,38,共3页 Journal of Shandong Normal University(Natural Science)
基金 国家自然科学基金资助项目(10474060 10504017) 山东省自然科学基金资助项目(Q2006A06)
关键词 分子动力学 MM-PBSA 结合自由能 FKBP12 抑制剂 molecular dynamics MM - PBSA binding free energy FKBP12 inhibitor
  • 相关文献

参考文献5

二级参考文献41

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共引文献18

同被引文献10

引证文献2

二级引证文献4

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