摘要
PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型。本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析。统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构。
出处
《池州学院学报》
2007年第5期57-60,共4页
Journal of Chizhou University
基金
安徽省高校青年教师科研资助项目(2006jql244)
