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天然氨基酸中氢键的量子化学研究 被引量:6

Quantum Chemical Study on Hydrogen Bonds of Crude Amino Acids
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摘要 用从头计算法优化了 2 0种天然氨基酸正、负、偶极离子 .计算结果表明 ,α- NH2 上的氮原子可以和羧基氧原子形成氢键 ,通过 N1— H2… O3氢键的生成 ,原子 N1、H3、O4、C4、C5形成了五元环 .从正离子、负离子到偶极离子 ,氢键强度逐渐减小 .侧链原子对氢键也有影响 :正离子的侧链除苏氨酸和丝氨酸外 ,其它氨基酸不对氢键构成影响 ;负离子氢键受侧链的影响较大 ;而偶极离子中氢键基本不受侧链的影响 . The hydrogen bond structure is calculated by optimizing the 20 crude amino acids positive ions, negative ions and dipole ions with ab initio calculation.It is proved that hydrogen bond forms between the nitrogen atom of α-NH 2 and the oxygen atom of the carboxyl .With the N1-H2…O3 hydrogen bond , N1,H3,O4,C4,C5 form a five-numbered ring . The intensity of the hydrogen bonds become weak gradually from positive ions, negative ions to dipole ions. Apart from threonine and serine , the hydrogen bonds of the other positive ions are not affected by the side chain.The hydrogen bonds of the negative ions are mostly affected by the side chain, and the hydrogen bonds of the dipole ions are not affected by the side chain.
机构地区 郑州大学化学系
出处 《郑州大学学报(理学版)》 CAS 2004年第3期59-63,共5页 Journal of Zhengzhou University:Natural Science Edition
基金 国家自然科学基金资助项目 编号 2 0 2 72 0 5 4
关键词 天然氨基酸 氢键 量子化学 从头计算法 立体结构 ab initio calculation crude amino acids hydrogen bond
  • 相关文献

参考文献6

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  • 3Navarrete J T,Lopez V,Hernandez F J. Solvent effects on the structure and spectra of glutamine studied by the SCRF theory. Journal of Molecular Structure,1997, 410-411 : 353-356. 被引量:1
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  • 6尹玉英,刘春蕴,程纪原.天然氨基酸的结构和旋光性[J].中国科学院研究生院学报,1996,13(2):154-162. 被引量:7

二级参考文献8

共引文献17

同被引文献39

引证文献6

二级引证文献10

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