摘要
评估单分子实时测序(single molecule real-time sequencing,SMRT)技术与传统方法检测地贫基因变异的一致性及准确性,分析SMRT对地贫基因罕见变异的检测效能。 方法 根据临床学科通过病史询问和血液学检测初筛出的疑似地中海贫血携带者,先进行传统检测方法的跨越断裂点(Gap-PCR)和反向斑点杂交(RDB)检测,筛选出检测结果为阴性无异常的91例病例,再用SMRT技术进行回顾性检测分析,并用Sanger测序验证两种方法不一致结果的正确性。结果 在经传统方法检测结果为阴性的91病例中,SMRT技术新增检测出3例(3/91)地中海贫血阳性病例,均为罕见型地中海贫血基因型,分别为HBA2 c.-59C>T,HBB c.193G>A和HBB c.341T>A,SMRT检测其他88名受检者的结果和传统方法一致均为阴性;Sanger测序结果证实SMRT检测的准确性。两种方法的检测结果一致性为96.71%,其中SMRT技术检测准确性为100%,SMRT技术比传统方法多增加3.29%的地中海贫血基因型检出率,且均为罕见型。结论 SMRT技术具备全面覆盖传统基因检测结果的能力,同时提高罕见基因型的确诊率,避免漏检发生,显现出在地中海贫血基因诊断分析中高效率、高精准的优势效能。
