摘要
采用网络药理学联合分子对接,探究喉癌含化方II治疗喉癌的分子作用机制。方法 经过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Batman-tcm对喉癌含化方II中12味药材进行活性成分筛选,利用SwissTargetPrediction及pharmmapper数据库进行靶点预测;在GeneCards数据库中进行疾病靶点检索,对药物靶点和疾病靶点进行交集映射,绘制相应的维恩图,运用Cytoscape构建药物-成分-靶点基因网络图和PPI图,并对交集靶点基因进行GO和KEGG富集分析,最后运用AutoDuck Tools将核心靶点与成分进行分子对接验证。结果 通过网络药理学分析确定了276个潜在的LC治疗靶点。GO和KEGG富集分析表明生物学过程中的RNA聚合酶II启动子的转录正调控、凋亡过程的负反馈和基因表达的正反馈。分子学过程中的蛋白质结合,识别蛋白的结合ATP的结合以及细胞组分中膜相关功能。KEGG生物学过程主要包括:癌症通路,脂质和动脉粥样硬化通路,糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路,前列腺癌通路等信号通路。分子对接表明喉癌含化方II对SRC、TP53、HSP90AA1、AKT1、STAT3、JUN、SRC的靶点具有较强的结合能力。其中结果显示曲克芦丁和HSP90AA对接活性最好。结论 该研究通过构建喉癌含化方II成分-靶点-疾病网络,挖掘喉癌含化方II抗肿瘤的关键成分与靶点,并模拟靶点蛋白和活性成分的分子对接,为喉癌含化方II在临床应用及机制研究等方面提供了相应的思路。
基金
海南省自然科学基金(819MS121)
海南省自然科学基金(822RC831)。
