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用磁珠富集法分离亚麻基因组微卫星分子标记
被引量:
16
1
作者
邓欣
陈信波
+5 位作者
龙松华
王孝纯
高原
何东锋
王进
王玉富
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2099-2105,共7页
应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(CT)15与亚麻基因组DNA酶切片段杂交,捕获300~1500bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。利用接头引物和根据微卫星核心序列设计的引物VRV(CT)15...
应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(CT)15与亚麻基因组DNA酶切片段杂交,捕获300~1500bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。利用接头引物和根据微卫星核心序列设计的引物VRV(CT)15使用PCR方法直接对文库筛选,从422个转化子中获得了104个阳性克隆,对其进行测序分析,获得了97个微卫星序列,微卫星序列的富集效率达到22.99%,PCR扩增筛选效率93.27%。对97个微卫星序列进行比对分析,其中51个重复序列的两端序列高度相似,据其设计的特异引物对阳性克隆进行2次筛选,能淘汰相似度高的同类序列,提高筛选亚麻微卫星标记的效率。
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关键词
亚麻
微卫星
磁珠富集
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职称材料
题名
用磁珠富集法分离亚麻基因组微卫星分子标记
被引量:
16
1
作者
邓欣
陈信波
龙松华
王孝纯
高原
何东锋
王进
王玉富
机构
中国农业科学院麻类
研究
所/农业部麻类遗传改良
与
工程微生物重点实验
室
湖南农业
大学
/作物基因工程湖南省重点实验
室
黑龙江
大学
资源
与
环境
研究室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2099-2105,共7页
基金
中国农业科学院杰出人才科研启动经费资助
文摘
应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(CT)15与亚麻基因组DNA酶切片段杂交,捕获300~1500bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。利用接头引物和根据微卫星核心序列设计的引物VRV(CT)15使用PCR方法直接对文库筛选,从422个转化子中获得了104个阳性克隆,对其进行测序分析,获得了97个微卫星序列,微卫星序列的富集效率达到22.99%,PCR扩增筛选效率93.27%。对97个微卫星序列进行比对分析,其中51个重复序列的两端序列高度相似,据其设计的特异引物对阳性克隆进行2次筛选,能淘汰相似度高的同类序列,提高筛选亚麻微卫星标记的效率。
关键词
亚麻
微卫星
磁珠富集
Keywords
Flax
Microsatellite
Enrichment by magnetic beads
分类号
S563.2 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用磁珠富集法分离亚麻基因组微卫星分子标记
邓欣
陈信波
龙松华
王孝纯
高原
何东锋
王进
王玉富
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
16
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职称材料
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参考文献
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