目的基于网络药理学和分子模拟对接技术探究苦黄颗粒治疗自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis,AIH)的活性成分和作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and a...目的基于网络药理学和分子模拟对接技术探究苦黄颗粒治疗自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis,AIH)的活性成分和作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取苦黄颗粒中5味药材的化学成分和作用靶点,并重新纳入药典标记的关键成分;通过PubChem数据库和String平台获得活性化合物的作用靶点,同时采用GeneCards和DisGeNET数据库获得AIH相关基因,两者取交集获得共有靶点,并经Cytoscape软件将结果可视化,通过网络拓扑算法获得核心化合物和核心靶点;通过String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络获得苦黄颗粒治疗AIH的重要靶点,通过DAVID平台对重要靶点进行GO富集及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;使用Autodock Vina软件进行分子对接,验证网络分析结果。结果苦黄颗粒的主要活性成分84个,其中羽扇豆碱、梨果仙人掌基质以及槐胺碱等可能是苦黄颗粒治疗AIH的核心化合物。筛选出苦黄颗粒治疗AIH的7个核心靶点,即IL-6、IL-10、CXCL8、IL-4、ICAM1、HMOX1和IL-2。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析显示,苦黄颗粒主要对细胞凋亡进程、炎症反应以及机体免疫等生物过程进程调控。结论苦黄颗粒可通过多组分-多靶点-多通路调控机体炎症,调节免疫反应,从而发挥治疗AIH的作用,其中7个主要核心靶点可能为苦黄颗粒发挥作用的关键靶点,TNF信号通路、T细胞受体信号通路及Toll样受体信号通路可能是苦黄颗粒参与调控机体炎症和免疫的关键信号通路,可成为后续探究苦黄颗粒治疗AIH作用机制的潜在研究方向。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子模拟对接技术探究苦黄颗粒治疗自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis,AIH)的活性成分和作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取苦黄颗粒中5味药材的化学成分和作用靶点,并重新纳入药典标记的关键成分;通过PubChem数据库和String平台获得活性化合物的作用靶点,同时采用GeneCards和DisGeNET数据库获得AIH相关基因,两者取交集获得共有靶点,并经Cytoscape软件将结果可视化,通过网络拓扑算法获得核心化合物和核心靶点;通过String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络获得苦黄颗粒治疗AIH的重要靶点,通过DAVID平台对重要靶点进行GO富集及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;使用Autodock Vina软件进行分子对接,验证网络分析结果。结果苦黄颗粒的主要活性成分84个,其中羽扇豆碱、梨果仙人掌基质以及槐胺碱等可能是苦黄颗粒治疗AIH的核心化合物。筛选出苦黄颗粒治疗AIH的7个核心靶点,即IL-6、IL-10、CXCL8、IL-4、ICAM1、HMOX1和IL-2。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析显示,苦黄颗粒主要对细胞凋亡进程、炎症反应以及机体免疫等生物过程进程调控。结论苦黄颗粒可通过多组分-多靶点-多通路调控机体炎症,调节免疫反应,从而发挥治疗AIH的作用,其中7个主要核心靶点可能为苦黄颗粒发挥作用的关键靶点,TNF信号通路、T细胞受体信号通路及Toll样受体信号通路可能是苦黄颗粒参与调控机体炎症和免疫的关键信号通路,可成为后续探究苦黄颗粒治疗AIH作用机制的潜在研究方向。
