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检出虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的体长和体重关系
被引量:
20
1
作者
刘雅梅
邱亮
+3 位作者
程东远
张庆利
万晓媛
黄倢
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017年第4期96-103,共8页
对采自天津、浙江和山东等养殖场5个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的442尾个体进行虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)的Taq Man探针荧光定量PCR检测,并测量各群体每尾对虾的生物学体长和体重。引入医学上的劳累尔(Ro...
对采自天津、浙江和山东等养殖场5个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的442尾个体进行虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)的Taq Man探针荧光定量PCR检测,并测量各群体每尾对虾的生物学体长和体重。引入医学上的劳累尔(Rohrer)体重指数(Ponderal index,PI,W/L3)关系建立对虾体重(W)和体长(L)关系函数。结果显示,4个凡纳滨对虾的EHP阳性群体[平均体长为(5.37±1.19)cm]的体重指数PI平均值为(5.19±0.26)×10^(–3) g/cm^3,EHP阴性群体的凡纳滨对虾群体[平均体长为(2.49±0.21)cm]为(7.96±0.51)×10^(–3) g/cm^3,根据PI=a·L^((b–3))的函数矫正EHP阴性和阳性群体的体长差异引起的PI差值后,同等体长EHP阳性群体的PI值为阴性群体的(70.5±8.7)%,表明同样大小的个体,EHP阳性群体的平均体重比阴性群体平均体重低30%;EHP阳性群体中凡纳滨对虾体长和体重的变异系数是EHP阴性群体的(2.39±0.93)和(2.05±0.86)倍,表现为对虾EHP阳性群体个体大小不均匀;EHP阳性群体体重偏差率是EHP阴性群体的2.34–3.45倍,体长相同时,EHP阳性的体重波动变大。
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关键词
凡纳滨对虾
体长
体重
劳雷尔体重指数
虾肝肠胞虫
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职称材料
2016年中国部分地区白斑综合征病毒高变异区序列的分析比较
被引量:
4
2
作者
蔡苗
孙新颖
+2 位作者
刘庆慧
万晓媛
黄倢
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018年第4期454-464,共11页
为探究中国白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的分子流行病学变异情况,选取2016年1-7月从我国3省9市采集到的47份WSSV阳性样本,提取WSSV核酸后,使用特定引物对目的片段进行扩增,继而进行测序并分析比较不同地区样本的ORF1...
为探究中国白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的分子流行病学变异情况,选取2016年1-7月从我国3省9市采集到的47份WSSV阳性样本,提取WSSV核酸后,使用特定引物对目的片段进行扩增,继而进行测序并分析比较不同地区样本的ORF14/15和ORF23/24序列缺失情况,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR及SNPs变化情况。结果显示,在ORF14/15的扩增中,有4种缺失片段,分别是6 540 bp、6 530 bp、5 950 bp和5 140 bp,而在ORF23/24扩增中则有3种大片段缺失,分别是12 073 bp、12 070bp和11 945 bp,在所有样本中ORF75的RUs数目分别为11、8、10、3,ORF94的RUs数目分别为5、7、8、11、14,ORF125的RUs数目为4、5、6。SNPs分析结果表明,ORF94片段中含有5个和8个RUs的在48位的碱基均为T,含有7个RUs的在48位的碱基为T、G、G、G、G、T、T,含有11个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、T、T、G、T、G、T、T,含有14个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、G、G、T、G、G、T、T、T、T、T,含有所有RUs数目的ORF125片段在8、18、25、66和69位置的碱基均为G、G、G、G和A,,而在9、50、53、61和63位的碱基则出现了4种变异。研究结果表明,2016年的样本中,WSSV毒株存在一定程度的变异情况。主要表现在ORF14/15和ORF23/24均出现了新的缺失片段,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR以及SNPs变异情况也存在明显差异。
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关键词
白斑综合征病毒
变异
缺失
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
检出虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的体长和体重关系
被引量:
20
1
作者
刘雅梅
邱亮
程东远
张庆利
万晓媛
黄倢
机构
青岛
海洋
科学
与
技术
国家
实验室
海洋渔业
科学
与
食物
产出
过程
功能
实验室
农业部
海水
养殖
病害
防治
重点
实验室
青岛市
海水
养殖
流行病学
与
生物安保
重点
实验室
中国
水产
科学
研究院
黄
海水
产
研究所
上海
海洋
大
学
水产
与
生命
学
院
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017年第4期96-103,共8页
基金
公益性行业科研专项经费项目(201103034)
现代农业产业技术体系(CARS-47)
+1 种基金
山东省泰山学者建设工程专项经费
青岛海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新项目(2015ASKJ02)共同资助~~
文摘
对采自天津、浙江和山东等养殖场5个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的442尾个体进行虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)的Taq Man探针荧光定量PCR检测,并测量各群体每尾对虾的生物学体长和体重。引入医学上的劳累尔(Rohrer)体重指数(Ponderal index,PI,W/L3)关系建立对虾体重(W)和体长(L)关系函数。结果显示,4个凡纳滨对虾的EHP阳性群体[平均体长为(5.37±1.19)cm]的体重指数PI平均值为(5.19±0.26)×10^(–3) g/cm^3,EHP阴性群体的凡纳滨对虾群体[平均体长为(2.49±0.21)cm]为(7.96±0.51)×10^(–3) g/cm^3,根据PI=a·L^((b–3))的函数矫正EHP阴性和阳性群体的体长差异引起的PI差值后,同等体长EHP阳性群体的PI值为阴性群体的(70.5±8.7)%,表明同样大小的个体,EHP阳性群体的平均体重比阴性群体平均体重低30%;EHP阳性群体中凡纳滨对虾体长和体重的变异系数是EHP阴性群体的(2.39±0.93)和(2.05±0.86)倍,表现为对虾EHP阳性群体个体大小不均匀;EHP阳性群体体重偏差率是EHP阴性群体的2.34–3.45倍,体长相同时,EHP阳性的体重波动变大。
关键词
凡纳滨对虾
体长
体重
劳雷尔体重指数
虾肝肠胞虫
Keywords
Litopenaeus vannamei Biological length Body weight Rohrer's ponderal index Enterocytozoon hepatopenaei
分类号
S945 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
2016年中国部分地区白斑综合征病毒高变异区序列的分析比较
被引量:
4
2
作者
蔡苗
孙新颖
刘庆慧
万晓媛
黄倢
机构
青岛
海洋
科学
与
技术
国家
实验室
海洋渔业
科学
与
食物
产出
过程
功能
实验室
农业部
海水
养殖
病害
防治
重点
实验室
青岛市
海水
养殖
流行病学
与
生物安保
重点
实验室
中国
水产
科学
研究院
黄
海水
产
研究所
水产
科学
国家
级
实验
教
学
示范中心上海
海洋
大
学
济南大
学
前沿交叉
科学
研究院
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018年第4期454-464,共11页
基金
国家自然科学基金(31672679)
国家重点基础研究发展计划(2012CB114401)
文摘
为探究中国白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的分子流行病学变异情况,选取2016年1-7月从我国3省9市采集到的47份WSSV阳性样本,提取WSSV核酸后,使用特定引物对目的片段进行扩增,继而进行测序并分析比较不同地区样本的ORF14/15和ORF23/24序列缺失情况,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR及SNPs变化情况。结果显示,在ORF14/15的扩增中,有4种缺失片段,分别是6 540 bp、6 530 bp、5 950 bp和5 140 bp,而在ORF23/24扩增中则有3种大片段缺失,分别是12 073 bp、12 070bp和11 945 bp,在所有样本中ORF75的RUs数目分别为11、8、10、3,ORF94的RUs数目分别为5、7、8、11、14,ORF125的RUs数目为4、5、6。SNPs分析结果表明,ORF94片段中含有5个和8个RUs的在48位的碱基均为T,含有7个RUs的在48位的碱基为T、G、G、G、G、T、T,含有11个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、T、T、G、T、G、T、T,含有14个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、G、G、T、G、G、T、T、T、T、T,含有所有RUs数目的ORF125片段在8、18、25、66和69位置的碱基均为G、G、G、G和A,,而在9、50、53、61和63位的碱基则出现了4种变异。研究结果表明,2016年的样本中,WSSV毒株存在一定程度的变异情况。主要表现在ORF14/15和ORF23/24均出现了新的缺失片段,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR以及SNPs变异情况也存在明显差异。
关键词
白斑综合征病毒
变异
缺失
单核苷酸多态性
Keywords
WSSV
variation
deletion
SPNs
分类号
S945.4 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
检出虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体的体长和体重关系
刘雅梅
邱亮
程东远
张庆利
万晓媛
黄倢
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017
20
下载PDF
职称材料
2
2016年中国部分地区白斑综合征病毒高变异区序列的分析比较
蔡苗
孙新颖
刘庆慧
万晓媛
黄倢
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018
4
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