目的:运用网络药理学和分子对接研究桂枝汤治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis, AS)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)...目的:运用网络药理学和分子对接研究桂枝汤治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis, AS)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取桂枝汤组方中药的活性成分及相关靶点,通过Cytoscape 3.9.1构建“桂枝汤-活性成分-作用靶点”网络并进行拓扑分析,筛选桂枝汤治疗AS的关键活性成分。借助GeneCards、DisGeNET、DrugBank数据库筛选AS疾病靶点;将中药活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny 2.1.0软件,获取交集靶点,即为桂枝汤治疗AS的潜在靶点。将潜在靶点导入到STRING 11.0数据库构建蛋白质互作(protein-protein interaction, PPI)网络并进行拓扑分析筛选核心靶点。使用R软件对潜在靶点进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。利用AutoDock_Vina软件对关键活性成分和核心靶点进行分子对接。结果:基于TCMSP得到146种活性成分及240个相关靶点,“桂枝汤-活性成分-作用靶点”网络拓扑分析筛选得到槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇、β-胡萝卜素等为桂枝汤治疗AS的关键活性成分。通过GeneCards、DisGeNET、DrugBank数据库筛选得到AS相关靶点333个。通过Venny 2.1.0获得62个桂枝汤治疗AS的潜在靶点。PPI网络拓扑分析得到基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)、前列腺素内过氧化物合成酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule-1,ICAM-1)等9个核心靶点。GO富集分析共获得1 595个条目,其中分子功能91个条目,细胞组分31个条目,生物学过程1 473个条目;KEGG富集分析共得到119条通路。分子对接结果显示,槲皮素与MMP-9结合活性最高。结论:桂枝汤治疗AS的作用机制复杂,主要通过槲皮素、β-谷甾醇、展开更多
