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经口六价铬暴露毒作用模式中关键毒性通路的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
蒋欣航
王紫微
+5 位作者
彭慧
徐驰
于典科
靳远
陈丽萍
陈雯
《环境与职业医学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1333-1339,共7页
[背景]经口六价铬[Cr(Ⅵ)]暴露可导致小鼠消化道肿瘤发生,而目前机制尚未明确。通过网络数据挖掘和计算毒理学的分析预测化学物的暴露风险已成为毒理学研究的重要研究手段,可助于阐述毒作用模式(MOA)和识别关键毒性通路。[目的]识别并...
[背景]经口六价铬[Cr(Ⅵ)]暴露可导致小鼠消化道肿瘤发生,而目前机制尚未明确。通过网络数据挖掘和计算毒理学的分析预测化学物的暴露风险已成为毒理学研究的重要研究手段,可助于阐述毒作用模式(MOA)和识别关键毒性通路。[目的]识别并评价经口Cr(Ⅵ)暴露MOA中的关键事件。[方法]通过比较毒理基因组数据库(CTD)和基因表达综合数据库(GEO),分别构建基因集,并导入Ingenuity^(■)Pathway Analysis(IPA)软件进行通路富集分析及生物学功能分析,识别经口Cr(Ⅵ)暴露靶器官毒效应的潜在关键毒性通路。基于改良Bradford Hill原则,对Cr(Ⅵ)经口暴露MOA的潜在关键毒性通路进行证据权重(WOE)评价。[结果] CTD中筛选出与经口Cr(Ⅵ)暴露相关文献共54篇,其中肝脏及肠道相关文献分别有18篇和9篇,对应125个和272个相关基因。通路富集及生物学功能分析显示,肝脏及肠道扰动通路主要与细胞应激和损伤、细胞周期调控和凋亡相关。核因子E2相关因子2(Nrf2)通路及芳香烃受体(AHR)通路或为关键毒性通路,参与Cr(Ⅵ)细胞毒性介导的MOA。Nrf2通路激活与小鼠隐窝细胞增殖的染毒剂量(≥170 mg·L^(-1)重铬酸钠)及出现时间点(90 d)相似,提示Nrf2通路激活或为细胞毒性介导的MOA关键事件。WOE评价结果显示这一假设的证据效力为中等,其中生物学合理性及剂量-反应关系的证据效力较高。[结论] Nrf2通路激活或为Cr(Ⅵ)经口暴露引起小肠肿瘤发生细胞毒性介导的MOA中启动或维持隐窝细胞增殖的关键事件。
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关键词
六价铬
毒作用模式
小肠
生物信息学分析
证据权重评价
原文传递
STAT4 rs7574865GG基因型与GT+TT基因型肝癌患者相关危险因素对比分析
被引量:
10
2
作者
朴金梅
刘梦
+1 位作者
李成成
崔莲花
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2017年第2期84-86,92,共4页
目的一项全基因组关联性研究提出STAT4 rs7574865基因多态性与中国人群乙肝相关肝癌患病风险存在关联。而STAT4 rs7574865基因多态性与环境因素在肝癌发生中是否存在交互作用,鲜见相关报道。本研究探讨旨在STAT4 rs7574865基因多态性与...
目的一项全基因组关联性研究提出STAT4 rs7574865基因多态性与中国人群乙肝相关肝癌患病风险存在关联。而STAT4 rs7574865基因多态性与环境因素在肝癌发生中是否存在交互作用,鲜见相关报道。本研究探讨旨在STAT4 rs7574865基因多态性与环境因素交互作用对肝癌患病风险的影响。方法采用单纯病例研究方法,收集2010-01-08-2014-12-23就诊于青岛大学附属医院347例肝癌患者的临床资料和外周血。实时定量PCR检测STAT4 rs7574865基因多态性。结果 STAT4 rs7574865基因多态性与乙型肝炎家族史、乙肝e抗体的交互作用经年龄和性别校正后仍存在交互作用。校正后与乙型肝炎家族史相比OR=2.59,95%CI为1.11~6.04;与乙肝e抗体相比OR=1.56,95%CI为1.01~2.41。STAT4 rs75748646基因多态性与吸烟史、饮酒史、肝癌家族史、HBV感染、HBV表面抗体、HBVe抗原和HBV核心抗体等无明显交互作用。结论 STAT4 rs7574865基因多态性与乙肝家族史及乙肝e抗体可能存在交互作用,可增加肝癌的发病风险。
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关键词
肝细胞癌
STAT4基因rs7574865多态性
环境交互作用
原文传递
题名
经口六价铬暴露毒作用模式中关键毒性通路的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
蒋欣航
王紫微
彭慧
徐驰
于典科
靳远
陈丽萍
陈雯
机构
中山
大学
公共卫生
学院
卫生
毒理学
系
青岛大学
公共卫生
学院
卫生
毒理学
系
出处
《环境与职业医学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1333-1339,共7页
基金
科技部重点研发计划项目(2017YFC1600200)
国家自然科学基金(82073580)。
文摘
[背景]经口六价铬[Cr(Ⅵ)]暴露可导致小鼠消化道肿瘤发生,而目前机制尚未明确。通过网络数据挖掘和计算毒理学的分析预测化学物的暴露风险已成为毒理学研究的重要研究手段,可助于阐述毒作用模式(MOA)和识别关键毒性通路。[目的]识别并评价经口Cr(Ⅵ)暴露MOA中的关键事件。[方法]通过比较毒理基因组数据库(CTD)和基因表达综合数据库(GEO),分别构建基因集,并导入Ingenuity^(■)Pathway Analysis(IPA)软件进行通路富集分析及生物学功能分析,识别经口Cr(Ⅵ)暴露靶器官毒效应的潜在关键毒性通路。基于改良Bradford Hill原则,对Cr(Ⅵ)经口暴露MOA的潜在关键毒性通路进行证据权重(WOE)评价。[结果] CTD中筛选出与经口Cr(Ⅵ)暴露相关文献共54篇,其中肝脏及肠道相关文献分别有18篇和9篇,对应125个和272个相关基因。通路富集及生物学功能分析显示,肝脏及肠道扰动通路主要与细胞应激和损伤、细胞周期调控和凋亡相关。核因子E2相关因子2(Nrf2)通路及芳香烃受体(AHR)通路或为关键毒性通路,参与Cr(Ⅵ)细胞毒性介导的MOA。Nrf2通路激活与小鼠隐窝细胞增殖的染毒剂量(≥170 mg·L^(-1)重铬酸钠)及出现时间点(90 d)相似,提示Nrf2通路激活或为细胞毒性介导的MOA关键事件。WOE评价结果显示这一假设的证据效力为中等,其中生物学合理性及剂量-反应关系的证据效力较高。[结论] Nrf2通路激活或为Cr(Ⅵ)经口暴露引起小肠肿瘤发生细胞毒性介导的MOA中启动或维持隐窝细胞增殖的关键事件。
关键词
六价铬
毒作用模式
小肠
生物信息学分析
证据权重评价
Keywords
hexavalent chromium
mode of action
small intestinal
bioinformatics analysis
weight of evidence
分类号
R114 [医药卫生—卫生毒理学]
原文传递
题名
STAT4 rs7574865GG基因型与GT+TT基因型肝癌患者相关危险因素对比分析
被引量:
10
2
作者
朴金梅
刘梦
李成成
崔莲花
机构
青岛大学
医学部
公共卫生
学院
卫生
毒理学
教研室
青岛
市中心医院医务科
莒县人民医院内科
出处
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2017年第2期84-86,92,共4页
基金
青岛市产学研合作引导计划应用基础研究-青年专项(13-1-4-192-jch)
山东省医药卫生科技发展计划(2013WS0264)
山东省教育厅联合基金(ZR2014JL053)
文摘
目的一项全基因组关联性研究提出STAT4 rs7574865基因多态性与中国人群乙肝相关肝癌患病风险存在关联。而STAT4 rs7574865基因多态性与环境因素在肝癌发生中是否存在交互作用,鲜见相关报道。本研究探讨旨在STAT4 rs7574865基因多态性与环境因素交互作用对肝癌患病风险的影响。方法采用单纯病例研究方法,收集2010-01-08-2014-12-23就诊于青岛大学附属医院347例肝癌患者的临床资料和外周血。实时定量PCR检测STAT4 rs7574865基因多态性。结果 STAT4 rs7574865基因多态性与乙型肝炎家族史、乙肝e抗体的交互作用经年龄和性别校正后仍存在交互作用。校正后与乙型肝炎家族史相比OR=2.59,95%CI为1.11~6.04;与乙肝e抗体相比OR=1.56,95%CI为1.01~2.41。STAT4 rs75748646基因多态性与吸烟史、饮酒史、肝癌家族史、HBV感染、HBV表面抗体、HBVe抗原和HBV核心抗体等无明显交互作用。结论 STAT4 rs7574865基因多态性与乙肝家族史及乙肝e抗体可能存在交互作用,可增加肝癌的发病风险。
关键词
肝细胞癌
STAT4基因rs7574865多态性
环境交互作用
Keywords
hepatoeellular earcinoma
STAT4 rs7574865
environmental factors
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
经口六价铬暴露毒作用模式中关键毒性通路的生物信息学分析
蒋欣航
王紫微
彭慧
徐驰
于典科
靳远
陈丽萍
陈雯
《环境与职业医学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
原文传递
2
STAT4 rs7574865GG基因型与GT+TT基因型肝癌患者相关危险因素对比分析
朴金梅
刘梦
李成成
崔莲花
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2017
10
原文传递
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