为系统研究竹根七根际土及内生细菌菌群结构信息,本研究利用Illumina MiSeq平台,采用高通量测序方法对野生竹根七根际土和内生细菌进行序列测定及生物信息学分析。结果表明,从竹根七根际土、根和叶共获得分类单元(OTUs)1148个,其中14个...为系统研究竹根七根际土及内生细菌菌群结构信息,本研究利用Illumina MiSeq平台,采用高通量测序方法对野生竹根七根际土和内生细菌进行序列测定及生物信息学分析。结果表明,从竹根七根际土、根和叶共获得分类单元(OTUs)1148个,其中14个OUT为三者共有,竹根七根际土、根及叶各自特有的OTUs分别为337个、171个和308个,根际土的细菌多样性高于竹根七内生细菌的多样性。根际土细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria,47.5%)和放线菌门(Actinobacteria,20.6%),内生细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria,84.3%)。热度图分析表明,竹根七根际土及内生的细菌在属分类水平呈现显著差异。代谢预测分析显示,竹根七根际土中聚酮类化合物和萜类化合物代谢(Metabolism of Terpenoids and Polyketides)功能的细菌菌群丰度高于植物内生组织的。本研究可为竹根七根际及内生环境菌群功能的阐明和特定微生物的挖掘提供重要参考。展开更多
文摘为系统研究竹根七根际土及内生细菌菌群结构信息,本研究利用Illumina MiSeq平台,采用高通量测序方法对野生竹根七根际土和内生细菌进行序列测定及生物信息学分析。结果表明,从竹根七根际土、根和叶共获得分类单元(OTUs)1148个,其中14个OUT为三者共有,竹根七根际土、根及叶各自特有的OTUs分别为337个、171个和308个,根际土的细菌多样性高于竹根七内生细菌的多样性。根际土细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria,47.5%)和放线菌门(Actinobacteria,20.6%),内生细菌主要分布在变形菌门(Proteobacteria,84.3%)。热度图分析表明,竹根七根际土及内生的细菌在属分类水平呈现显著差异。代谢预测分析显示,竹根七根际土中聚酮类化合物和萜类化合物代谢(Metabolism of Terpenoids and Polyketides)功能的细菌菌群丰度高于植物内生组织的。本研究可为竹根七根际及内生环境菌群功能的阐明和特定微生物的挖掘提供重要参考。
