目的了解hefA外排基因表达与贵阳市幽门螺杆菌(Hp)多重耐药的关系。方法提取耐3种抗生素的多重耐药菌株(10株)、敏感菌株(6株)及质控菌株SS1的基因组DNA,PCR扩增hefA基因片段,PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测后测序,将测序基因片段序列输...目的了解hefA外排基因表达与贵阳市幽门螺杆菌(Hp)多重耐药的关系。方法提取耐3种抗生素的多重耐药菌株(10株)、敏感菌株(6株)及质控菌株SS1的基因组DNA,PCR扩增hefA基因片段,PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测后测序,将测序基因片段序列输入NCBI中进行BLAST比对;利用TRIzol试剂提取上述细菌的RNA并逆转录成cDNA,以16sRNA为内参基因,通过实时荧光定量PCR(Real time PCR)检测hefA基因和内参基因的CT值,通过比较2-ΔΔCT判断多重耐药菌株和敏感菌株hefA基因表达的差异,以两小样本t检验进行统计学分析。结果 2%琼脂糖凝胶电泳显示,6株敏感菌和10株多耐药菌及SS1hefA基因PCR产物均约140bp,测序显示受试菌hefA基因序列与SS1菌株序列的一致性大于96%;RT-PCR检测hefA外排基因的表达,敏感菌株的2-ΔΔCT为0.895±0.540,多重耐药菌株的2-ΔΔCT为3.387±1.597,差异无统计学意义(t=9.399,P<0.05)。结论 hefA外排基因高表达是贵阳地区Hp多重耐药的机制之一。展开更多
文摘目的了解hefA外排基因表达与贵阳市幽门螺杆菌(Hp)多重耐药的关系。方法提取耐3种抗生素的多重耐药菌株(10株)、敏感菌株(6株)及质控菌株SS1的基因组DNA,PCR扩增hefA基因片段,PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测后测序,将测序基因片段序列输入NCBI中进行BLAST比对;利用TRIzol试剂提取上述细菌的RNA并逆转录成cDNA,以16sRNA为内参基因,通过实时荧光定量PCR(Real time PCR)检测hefA基因和内参基因的CT值,通过比较2-ΔΔCT判断多重耐药菌株和敏感菌株hefA基因表达的差异,以两小样本t检验进行统计学分析。结果 2%琼脂糖凝胶电泳显示,6株敏感菌和10株多耐药菌及SS1hefA基因PCR产物均约140bp,测序显示受试菌hefA基因序列与SS1菌株序列的一致性大于96%;RT-PCR检测hefA外排基因的表达,敏感菌株的2-ΔΔCT为0.895±0.540,多重耐药菌株的2-ΔΔCT为3.387±1.597,差异无统计学意义(t=9.399,P<0.05)。结论 hefA外排基因高表达是贵阳地区Hp多重耐药的机制之一。
