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题名烟草NtMLO家族全基因组序列鉴定及表达分析
被引量：2
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作者
张孝廉
张吉顺
余世洲
余婧
赵德刚
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机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院
贵州省烟草科学研究院
西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室
贵州省农业科学院国家dus中心贵阳分中心
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出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1705-1720,共16页
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基金
中国烟草总公司贵州省公司科技项目(201605、201902和201903)
国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX-08010003009)
+1 种基金
贵州省高层次创新型人才培养项目[黔科合人才(2016)4003号]
贵州特色植物种质资源利用与创新人才基地(RCJD2018-14).
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文摘
为系统鉴定普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中白粉病感病基因NtMLO,通过构建已知拟南芥(Arabidopsis thaliana)和番茄(Solanum lycopersicum)MLO蛋白保守结构域的隐马尔可夫模型,获得烟草MLO家族候选序列共29个,对序列进行了基础理化性质、亚细胞定位和系统发育等分析。基础理化性质分析结果显示,NtMLO蛋白序列长度范围为479~605个氨基酸,理论等电点在7.02~9.50之间,富含碱性氨基酸,跨膜结构域数量为5~7个。亚细胞定位结果显示,该家族蛋白均定位于细胞膜上。通过对拟南芥、番茄、普通烟草、林烟草(N.sylvestris)和绒毛状烟草(N.tomentosiformis)等物种的共计90个MLO蛋白构建系统发育树,显示烟草中的MLO基因可分为5个亚组。通过定量PCR分析了不同亚组的19个NtMLO基因的组织表达特异性,发现除NtMLO3和NtMLO5两个基因在花中没有表达、NtMLO26在叶中没有表达外,其余NtMLO基因在根、茎、叶片和花组织中均有表达。本研究为全面了解烟草基因组中MLO基因提供相关信息。
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关键词
烟草
MLO蛋白
生物信息学
表达模式
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Keywords
Nicotiana tabacum
MLO protein
bioinformatics
expression pattern
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分类号
S572
[农业科学—烟草工业]
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题名花烟草NaD1基因的表达及其启动子序列分析
被引量：1
- 2
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作者
龚伟伟
赵懿琛
罗显麟
杨玲玲
赵德刚
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机构
贵州大学茶学院
贵州大学药学院
贵州大学生命与科学学院
贵州省农业科学院国家dus中心贵阳分中心
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出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期232-239,共8页
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基金
中国烟草总公司贵州省公司科技项目(201608)
贵州省高层次创新型人次培养(黔科合人才〔2016〕4003号)。
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文摘
花烟草(Nicotiala alata)的花中存在的植物防御素Nicotiala alata defensin 1(NaD1),对多种致病性真菌具有防御活性,在天然防御免疫系统中发挥着重要作用。本研究分别对花烟草根、茎、叶、花组织部分以及伸根期、旺长期、成熟期发育阶段叶片中NaD1基因的表达量进行qRT-PCR定量检测,结果显示,NaD1基因在花中表达量显著高于其他组织,在叶片中的表达量随着植物的生长发育先增加后降低。此外,通过热不对称交错PCR克隆得到NaD1基因5′端上游644 bp的片段,利用BDGP和Plant CARE在线软件分析启动子的转录起始位点及motif元件,发现其含有基本启动子元件和其他顺式作用元件,如光反应元件BOX-Ⅰ、乙烯反应元件ERE以及真菌诱导响应元件TGACG-motif等。通过对花烟草进行光胁迫处理,发现NaD1基因在花中的表达量随着暗处理时间的增长而显著增加,随着光处理时间的增长而显著降低,这与其启动子中存在的光反应元件BOX-Ⅰ相对应。通过启动子5′端缺失分析,构建了pCAMBIA1391z-pNaD1-644∶∶GUS与pCAMBIA1391z-pNaD1-310∶∶GUS两个植物表达载体,利用遗传转化获得包含-644~-1 bp和-310~-1 bp启动子片段的转基因烟草,GUS染色结果表明,NaD1基因启动子的核心区域在-310~-1 bp中,为进一步研究NaD1基因的功能和转录调控机制奠定了基础。
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关键词
花烟草
NaD1基因
防御素
启动子
表达分析
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Keywords
Nicotiala alata
NaD1 gene
defensin
promoter
expression analysis
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分类号
S572
[农业科学—烟草工业]
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题名3个贵州薏苡品种农艺性状及光合特性研究
被引量：5
- 3
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作者
徐剑
李建容
赵懿琛
赵德刚
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机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/贵州省农业生物工程重点实验室/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室
贵州大学茶学院/贵州省山地生态与农业生物工程
贵州省农业科学院/国家dus中心贵阳分中心
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出处
《山地农业生物学报》
2019年第5期65-69,共5页
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基金
贵州省农业委员会“薏苡分子育种技术研究与示范”
贵州省高层次创新人才培养项目(黔科合人才(2016)4003号)
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文摘
为探究贵州薏苡农艺性状及光合生理特性,以兴仁小白壳、黔薏苡1号、黔薏苡2号进行田间小区试验,测量其农艺性状并测定光合特性日变化,以期为发掘高产的薏苡品种提供理论依据。结果表明:黔薏苡1号的茎粗、分蘖数、单株产量、主茎产量均显著高于黔薏苡2号和兴仁小白壳;黔薏苡2号的株高、茎节数、分蘖数显著低于兴仁小白壳。3个薏苡品种之间的净光合速率、气孔导度及胞间CO2浓度日变化趋势均不同,兴仁小白壳和黔薏苡1号各自在13:00、14:00出现午休现象,表现为黔薏苡1号、黔薏苡2号净光合速率显著高于兴仁小白壳,黔薏苡1号净光合速率、气孔导度、胞间CO2浓度及蒸腾速率均显著低于其它两个品种,此后逐渐升高,16:00时达到峰值并显著高于其它两个薏苡品种。蒸腾速率兴仁小白壳在10:00~11:00、14:00~15:00时间段高于黔薏苡1号、黔薏苡2号。
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关键词
薏苡
农艺性状
光合作用
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Keywords
Job’s Tears ( Coix Lachryma-jobi L.)
agronomic traits
photosynthesis
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分类号
S5
[农业科学—作物学]
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