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题名杜仲ABC转运蛋白基因家族成员鉴定与分析
被引量：4
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作者
蔡方阳
赵懿琛
李义
赵德刚
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机构
贵州大学生命科学学院/茶学院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室
美国康涅狄格大学转基因植物研究中心
贵州省农业科学院农业农村部植物新品种测试贵阳分中心
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出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第9期1581-1591,共11页
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基金
国家自然科学基金(31660076)
贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教科KY〔2016〕126)
贵州省生物学一流学科建设项目(GYNY〔2017〕009)。
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文摘
ABC转运蛋白(ATP—binding cassette transpoter)是一类庞大而古老的跨膜运输蛋白家族,在生物体内参与多种物质的转运积累、有害物质解毒、气孔调节、植物防御等生理活动。杜仲(Eucommia ulmoides Oliv)作为重要的中药材,其药用成分主要为次生代谢产物,次生代谢物转运与积累过程需要ABC转运蛋白的参与。利用生物信息学手段对杜仲ABC转运蛋白基因家族进行鉴定,并分析该家族蛋白质性质和结构、跨膜结构、亚细胞定位、系统进化关系。研究表明,EuABC家族生物信息学预测有76个成员,含有1~7个保守基序;编码蛋白多为稳定蛋白,主要分布于细胞质膜上,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主要构成元件;进化树分析表明,杜仲ABC转运蛋白家族可分为8个亚家族(A~G;I),每组成员数量分别为3、19、14、1、1、1、29、8。研究结果可为进一步研究杜仲次生代谢物质转运与积累奠定基础,也为其他植物ABC转运蛋白家族的研究提供了参考依据。
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关键词
杜仲
ABC转运蛋白
基因家族
跨膜结构
亚细胞定位
进化树
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Keywords
Eucommia ulmoides Oliv
ATP-binding cassette transporters
gene family
transmembrane structure
subcellular localization
phylogenetic tree
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分类号
S567.19
[农业科学—中草药栽培]
Q78
[农业科学—作物学]
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