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火龙果UQT和18s rRNA内参基因片段的克隆及表达分析
被引量:
6
1
作者
罗霞
文晓鹏
《山地农业生物学报》
2015年第2期23-26,共4页
本文基于植物UQT和18s rRNA基因的保守区设计简并引物,克隆了UQT基因和18s rRNA基因,分别命名为Hu UQT和Hu18s rRNA。生物信息学分析表明,Hu UQT基因c DNA序列为271 bp,编码87个氨基酸;Hu18s rRNA基因c DNA序列为209 bp。Hu UQT基因片...
本文基于植物UQT和18s rRNA基因的保守区设计简并引物,克隆了UQT基因和18s rRNA基因,分别命名为Hu UQT和Hu18s rRNA。生物信息学分析表明,Hu UQT基因c DNA序列为271 bp,编码87个氨基酸;Hu18s rRNA基因c DNA序列为209 bp。Hu UQT基因片段与其他植物UQT基因核苷酸序列的同源性均在78%以上;Hu18s rRNA基因片段与其他植物Hu18s rRNA基因核苷酸序列的同源性均在98%以上。RT-PCR结果显示,Hu UQT基因和Hu18s rRNA基因不仅在火龙果不同种质之间表达稳定,而且在干旱胁迫不同时期的样品中表达稳定。因此,UQT基因和Hu18s rRNA基因可以作为内参基因用于火龙果抗逆性和生长发育过程中基因表达规律研究。
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关键词
火龙果
克隆
内参基因
表达分析
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职称材料
唇形科植物——苏麻和紫苏亲缘关系鉴定
被引量:
3
2
作者
罗霞
陶金
+1 位作者
危克周
文晓鹏
《山地农业生物学报》
2014年第5期28-31,共4页
为了探讨苏麻的种质特性,揭示其与紫苏的亲缘关系,本文采用形态学鉴定结合ISSR标记技术,对苏麻与紫苏的亲缘关系进行分析。形态学鉴定表明,紫苏为野生紫苏,而苏麻为紫苏(原变种),苏麻与3份紫苏属于紫苏属紫苏,但属于紫苏的不同变种。...
为了探讨苏麻的种质特性,揭示其与紫苏的亲缘关系,本文采用形态学鉴定结合ISSR标记技术,对苏麻与紫苏的亲缘关系进行分析。形态学鉴定表明,紫苏为野生紫苏,而苏麻为紫苏(原变种),苏麻与3份紫苏属于紫苏属紫苏,但属于紫苏的不同变种。从20个引物中筛选出的10个ISSR引物中扩增出69条清晰谱带,其中51条为多态性带,多态性比例为73.9%;采用M05、M06或856等3个引物扩增出的标记,能将4份种质区分开来;聚类分析表明,4份供试材料间的相似系数为0.35~0.53,3份紫苏的亲缘关系很近,而与苏麻的亲缘关系较远。
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关键词
苏麻
形态学标记
ISSR标记
亲缘关系
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职称材料
从江香猪RYR1基因2个SNP位点的多态性
被引量:
1
3
作者
王龙龙
冉雪琴
王嘉福
《贵州农业科学》
CAS
2015年第4期153-157,共5页
兰尼定受体1(Ryanodine Receptor1,RYR1)基因的n等位基因是导致猪应激综合征的主效基因。为探明主产区从江香猪群体中是否存在n等位基因的污染,采用PCR-RFLP和AS-PCR方法对贵州从江香猪群体中n等位基因的多态性进行了检测。结果表明:从...
兰尼定受体1(Ryanodine Receptor1,RYR1)基因的n等位基因是导致猪应激综合征的主效基因。为探明主产区从江香猪群体中是否存在n等位基因的污染,采用PCR-RFLP和AS-PCR方法对贵州从江香猪群体中n等位基因的多态性进行了检测。结果表明:从江香猪血液基因组DNA经扩增得到659bp的DNA片段,200头从江香猪的基因型均为纯合NN型,N等位基因频率为100%;对659bp扩增片段克隆测序发现1个新的变异位点(T1922C),导致成熟肽V641A替换。T1922C位点基因型均为TC杂合型,T等位基因和C等位基因频率均为50%。经三维结构预测,V641A替换位于RYR1蛋白SPRY1结构域的上游,T1922C变异对猪的兰尼定受体功能可能没有直接影响。
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关键词
从江香猪
应激综合征
兰尼定受体1基因
SPRY1
贵州
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职称材料
题名
火龙果UQT和18s rRNA内参基因片段的克隆及表达分析
被引量:
6
1
作者
罗霞
文晓鹏
机构
贵州大学
贵州省
农业
生物工程
研究院
贵州大学
生命科学学
院
贵州大学
山地植物资源保护与种质创新
省
部共建教育部重点实验室
出处
《山地农业生物学报》
2015年第2期23-26,共4页
基金
贵州省留学人员科技活动项目经费资助
文摘
本文基于植物UQT和18s rRNA基因的保守区设计简并引物,克隆了UQT基因和18s rRNA基因,分别命名为Hu UQT和Hu18s rRNA。生物信息学分析表明,Hu UQT基因c DNA序列为271 bp,编码87个氨基酸;Hu18s rRNA基因c DNA序列为209 bp。Hu UQT基因片段与其他植物UQT基因核苷酸序列的同源性均在78%以上;Hu18s rRNA基因片段与其他植物Hu18s rRNA基因核苷酸序列的同源性均在98%以上。RT-PCR结果显示,Hu UQT基因和Hu18s rRNA基因不仅在火龙果不同种质之间表达稳定,而且在干旱胁迫不同时期的样品中表达稳定。因此,UQT基因和Hu18s rRNA基因可以作为内参基因用于火龙果抗逆性和生长发育过程中基因表达规律研究。
关键词
火龙果
克隆
内参基因
表达分析
Keywords
Pitaya
Cloning
Housekeeping gene
Expression analysis
分类号
Q949.9 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
唇形科植物——苏麻和紫苏亲缘关系鉴定
被引量:
3
2
作者
罗霞
陶金
危克周
文晓鹏
机构
贵州大学
贵州省
农业
生物工程
研究院
贵州大学
生命科学学
院
出处
《山地农业生物学报》
2014年第5期28-31,共4页
基金
贵州省留学人员科技活动项目(201304)
文摘
为了探讨苏麻的种质特性,揭示其与紫苏的亲缘关系,本文采用形态学鉴定结合ISSR标记技术,对苏麻与紫苏的亲缘关系进行分析。形态学鉴定表明,紫苏为野生紫苏,而苏麻为紫苏(原变种),苏麻与3份紫苏属于紫苏属紫苏,但属于紫苏的不同变种。从20个引物中筛选出的10个ISSR引物中扩增出69条清晰谱带,其中51条为多态性带,多态性比例为73.9%;采用M05、M06或856等3个引物扩增出的标记,能将4份种质区分开来;聚类分析表明,4份供试材料间的相似系数为0.35~0.53,3份紫苏的亲缘关系很近,而与苏麻的亲缘关系较远。
关键词
苏麻
形态学标记
ISSR标记
亲缘关系
Keywords
Perilla frutescens
morphological traits
ISSR markers
genetic relationship
分类号
Q949 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
从江香猪RYR1基因2个SNP位点的多态性
被引量:
1
3
作者
王龙龙
冉雪琴
王嘉福
机构
贵州大学
贵州省
农业
生物工程
研究院
贵州大学
生命科学学
院
贵州大学
动物科学学
院
出处
《贵州农业科学》
CAS
2015年第4期153-157,共5页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)"中国地方猪种优异特色性状的功能基因组学研究"(2013AA102503)
贵州省农业科技攻关项目"猪繁殖性状候选基因的分离克隆与功能鉴定"[黔科合NY(2013)073]
+1 种基金
贵州省科技创新人才团队建设专项"贵州省动物遗传育种与生物技术科技创新人才团队"(黔科合人才团队2009-4006)
贵州大学本科教学工程项目"基础兽医学教学团队"(BKJX2012007)
文摘
兰尼定受体1(Ryanodine Receptor1,RYR1)基因的n等位基因是导致猪应激综合征的主效基因。为探明主产区从江香猪群体中是否存在n等位基因的污染,采用PCR-RFLP和AS-PCR方法对贵州从江香猪群体中n等位基因的多态性进行了检测。结果表明:从江香猪血液基因组DNA经扩增得到659bp的DNA片段,200头从江香猪的基因型均为纯合NN型,N等位基因频率为100%;对659bp扩增片段克隆测序发现1个新的变异位点(T1922C),导致成熟肽V641A替换。T1922C位点基因型均为TC杂合型,T等位基因和C等位基因频率均为50%。经三维结构预测,V641A替换位于RYR1蛋白SPRY1结构域的上游,T1922C变异对猪的兰尼定受体功能可能没有直接影响。
关键词
从江香猪
应激综合征
兰尼定受体1基因
SPRY1
贵州
Keywords
Congjiang Xiang pig
stress syndrome
Guizhou
分类号
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
火龙果UQT和18s rRNA内参基因片段的克隆及表达分析
罗霞
文晓鹏
《山地农业生物学报》
2015
6
下载PDF
职称材料
2
唇形科植物——苏麻和紫苏亲缘关系鉴定
罗霞
陶金
危克周
文晓鹏
《山地农业生物学报》
2014
3
下载PDF
职称材料
3
从江香猪RYR1基因2个SNP位点的多态性
王龙龙
冉雪琴
王嘉福
《贵州农业科学》
CAS
2015
1
下载PDF
职称材料
已选择
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