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猪繁殖与呼吸综合征病毒GZZJ201711株全基因组序列分析
被引量:
2
1
作者
陈广
张升波
+8 位作者
温贵兰
李昌红
徐丽
田浪
张喜懿
龚新勇
陈彦希
文明
王开功
《动物医学进展》
北大核心
2020年第1期20-26,共7页
为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体...
为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体上进行测序,拼接后得到PRRSV GZZJ201711株全基因组长15 322 bp (去除polyA尾),包括5’UTR、ORFla-ORF7、3’UTR。序列分析表明,GZZJ201711株与欧洲型Lelystad virus(LV)株核苷酸同源性为60.3%,与美洲型毒株代表株ATCC VR-2332核苷酸同源性为89.2%,与HP-PRRSV(HUN4、JXA1、TJ)等毒株同源性在98.8%~98.9%之间。GZZJ201711株与高致病性毒株JXA1、HUN4、TJ属于同一小分支,其中与XJu-1、GDHY毒株遗传关系最近。GZZJ201711毒株的NSP2基因有30个氨基酸缺失,与JXA1、HUN4、TJ等HP-PRRSV毒株缺失位置一致。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
全基因组
序列分析
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职称材料
题名
猪繁殖与呼吸综合征病毒GZZJ201711株全基因组序列分析
被引量:
2
1
作者
陈广
张升波
温贵兰
李昌红
徐丽
田浪
张喜懿
龚新勇
陈彦希
文明
王开功
机构
贵州大学
动物
科学
学院
预防
兽医
实验室
/
贵州省
动物
生物制品
工程技术
研究
中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2020年第1期20-26,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31460668)
贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2015]2046号)
+3 种基金
贵州省高层次创新型人才培养项目(黔财教[2017]号)
贵州大学博士基金项目(贵大人基合字[2013]12号)
贵州省科技平台及人才团队计划项目(黔科合平台人才[2018]5253)
贵州省研究生工作站计划项目(GZZ2017002)
文摘
为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体上进行测序,拼接后得到PRRSV GZZJ201711株全基因组长15 322 bp (去除polyA尾),包括5’UTR、ORFla-ORF7、3’UTR。序列分析表明,GZZJ201711株与欧洲型Lelystad virus(LV)株核苷酸同源性为60.3%,与美洲型毒株代表株ATCC VR-2332核苷酸同源性为89.2%,与HP-PRRSV(HUN4、JXA1、TJ)等毒株同源性在98.8%~98.9%之间。GZZJ201711株与高致病性毒株JXA1、HUN4、TJ属于同一小分支,其中与XJu-1、GDHY毒株遗传关系最近。GZZJ201711毒株的NSP2基因有30个氨基酸缺失,与JXA1、HUN4、TJ等HP-PRRSV毒株缺失位置一致。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
全基因组
序列分析
Keywords
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus
whole genome
sequence analysis
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
S858.28 [农业科学—兽医学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
猪繁殖与呼吸综合征病毒GZZJ201711株全基因组序列分析
陈广
张升波
温贵兰
李昌红
徐丽
田浪
张喜懿
龚新勇
陈彦希
文明
王开功
《动物医学进展》
北大核心
2020
2
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