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基于k-means聚类算法的兴义维蚋幼虫龄数的估算
1
作者 赵娜 王毅 +4 位作者 杨曜铭 吴慧 修江帆 寻慧 杨明 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第8期1120-1127,共8页
目的探讨基于k-means聚类算法估算兴义维蚋幼虫的龄数,以明确虫龄与日龄及鳃斑发育阶段的关系。方法采集贵州青岩河流中兴义维蚋虫卵,于实验室的蚋类饲养系统中培育至幼虫,每日收集幼虫至大量化蛹,持续20 d;收集到幼虫1112头,于体视显... 目的探讨基于k-means聚类算法估算兴义维蚋幼虫的龄数,以明确虫龄与日龄及鳃斑发育阶段的关系。方法采集贵州青岩河流中兴义维蚋虫卵,于实验室的蚋类饲养系统中培育至幼虫,每日收集幼虫至大量化蛹,持续20 d;收集到幼虫1112头,于体视显微镜下测量头壳长(HCW)、后颊长(PGL)、上颚基横骨长(MPL)及体长(BL),观察不同虫龄幼虫的破卵器、鳃斑及性腺的形态学特征,并判断其龄期、分析虫龄与日龄和鳃斑发育关系;选取具有明显腮斑发育的兴义维蚋幼虫10头、制作石蜡切片,采用HE染色鉴定精巢和卵巢、辅助确认性别鉴定结果;采用k-means聚类方法划分形态计量学数据、利用Brooks-Dyar定律检测k-means聚类结果,R语言下行聚类与Brooks-Dyar定律检验、t检验等,根据拟合度分析判断兴义维蚋幼虫龄数。结果1112头兴义维蚋幼虫中有破卵器89头,出现鳃斑发育334头,6~7龄幼虫320头,有预蛹特征34头;Brooks-Dyar定律与破卵器、鳃斑形态特征显示7龄幼虫假设符合昆虫幼虫生长规律;组织学观察见幼虫精巢为椭圆形、体积大、外有几丁质层包裹,卵巢为长条形、体积小、后端有色素细胞包裹;鉴定6、7龄幼虫性别结果,仅7龄幼虫雌雄性PGL有差异(P<0.05);幼虫虫龄与日龄、鳃斑发育关系结果显示,约2~3 d对应1个幼虫生长龄期,第17天首见幼虫蛹化,6龄幼虫出现明显的鳃斑。结论兴义维蚋幼虫具7龄,实验室下幼虫发育约需3周,最短17 d;腮斑发育起始于6龄,7龄出现明显形态学特征。 展开更多
关键词 蚋科 组织学 性腺 龄数 形态计量学 K-MEANS聚类
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装饰短蚋线粒体全基因组序列测定与分析
2
作者 孙谦 杨明 温小军 《贵州医科大学学报》 CAS 2023年第8期881-887,共7页
目的测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列,并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系。方法采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测序,应... 目的测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列,并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系。方法采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测序,应用邻接法重建装饰短蚋与其近缘物种的系统发育关系。结果装饰短蚋线粒体基因组序列全长为15640 bp,包括13个蛋白质编码基因(PCGs)、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个控制区(CR),A、T、C、G碱基含量分别为38.1%、36.4%、14.7%、10.8%;基于13个PCGs序列构建的系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.maculatum]+S.aureohirtum}+S.quinquestriatum,基于DNA条码序列构建系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.quinquestriatum]+S.maculatum}+S.aureohirtum。结论短蚋亚属与蚋亚属杂色蚋组(variegatum group)的亲缘关系最近,利用线粒体全基因组进行系统发育分析DNA条码序列具有更高的分辨率。 展开更多
关键词 装饰短蚋 线粒体基因组 密码子 蛋白质编码基因 系统发育关系 DNA条码 控制区
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兴义维蚋实验室饲养条件探索
3
作者 杨晨 寻慧 +5 位作者 赵娜 张洪卫 李世美 高晗 修江帆 杨明 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1626-1632,共7页
【目的】旨在探索兴义维蚋Simulium xingyiense实验室饲养方法,使其能在实验室内连续饲养2代。【方法】设计制作羽化杯、交配管、喂血装置和产卵管,并改造市售小型鱼缸供蚋卵孵化及后续饲养。第1代饲养:将野外采集得到的兴义维蚋蛹置于... 【目的】旨在探索兴义维蚋Simulium xingyiense实验室饲养方法,使其能在实验室内连续饲养2代。【方法】设计制作羽化杯、交配管、喂血装置和产卵管,并改造市售小型鱼缸供蚋卵孵化及后续饲养。第1代饲养:将野外采集得到的兴义维蚋蛹置于羽化杯中饲养获得成虫;在交配管中诱导成虫交配(30 min);将雌蚋转移至喂血装置中喂养(90 min);将饱腹雌蚋置于产卵管中产卵;将产出的卵置于改造过的小型鱼缸中孵化,并饲养至幼虫化蛹。第2代饲养:除蛹来源于第1代饲养外,所有步骤同第1代饲养。全部实验在温度20℃、相对湿度70%下进行,但在喂血环节分别测试喂血培养基不同温度和成分对饱腹率和产卵率的影响。【结果】添加ATP的血清培养基更能吸引雌蚋吸血;在喂血培养基温度为34℃时雌蚋饱腹率最高;兴义维蚋雌虫喜食牛血清培养基;喂血培养基内血清含量越高,饱腹雌蚋产卵率越高;在最适喂养条件下雌蚋饱腹率为25.3%,产卵率为29.4%,平均每只雌蚋产163.5个卵,蚋卵孵化率为85.5%。幼虫生长周期为13-15 d,结蛹率为10.7%;蛹经4-6 d可羽化为成虫,羽化率为95.2%。【结论】兴义维蚋可在实验室内连续饲养2代,能够满足后续分子生物学实验要求,但幼虫结蛹率较低,提示改善幼虫饲养、提高结蛹率可能是最终建立兴义维蚋实验室品系的关键所在。 展开更多
关键词 蚋科 兴义维蚋 饲养方法 产卵
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