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短短芽孢杆菌GZDF3中PilZ结构域基因的挖掘和糖基转移酶的原核表达
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作者 贾化可 张功友 +3 位作者 陶小买 吴东明 隆耀航 刘红美 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2944-2951,共8页
【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的... 【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的】挖掘短短芽孢杆菌GZDF3菌株中的PilZ结构域蛋白基因,并进行重组表达,为研究其功能奠定基础。【方法】从Pfam数据库中下载PilZ结构域模型,HMMScan软件扫描GZDF3全基因组序列,在保守结构域数据库(Conserved domain database,CDD)中分析蛋白保守结构域,Protein BLAST比对分析;采用ExPASy在线软件预测蛋白的基本理化性质;构建重组表达载体进行蛋白重组表达。【结果】GZDF3基因中存在5个含有PilZ结构域的蛋白编码基因,其中命名为Gene4836的基因经Protein BLAST比对分析显示其编码糖基转移酶,Gene1423为YcgR超家族蛋白编码基因,Gene1723编码透明质酸合成酶,属于糖基转移酶超家族2,其余Gene2571、Gene2956编码假定蛋白;Gene4836的编码产物分子量为24.08 kD,等电点为6.39,为酸性亲水性蛋白;C端有一个PilZ结构域;0.5 mmol/L乳糖诱导、30°C培养20 h,表达出一大小约为25kD的重组蛋白,与生物信息学预测结果相符。【结论】首次对短短芽孢杆菌含有PilZ结构域蛋白编码基因进行原核表达,并成功纯化出重组蛋白,为后续研究其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 短短芽孢杆菌 PilZ结构域 糖基转移酶 原核表达 重组蛋白
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重楼中一株产纤维素酶内生真菌的分离及鉴定 被引量:9
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作者 张功友 王一涵 +3 位作者 郭敏 张婷婷 王兵 刘红美 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期95-104,共10页
从重楼根茎中分离、鉴定具有产纤维素酶活性的内生真菌。采用表面消毒法从重楼块茎中分离内生真菌;用纤维素酶活性CMC平板检测分离菌株的产纤维素酶活性;对高产菌株进行形态学观察和分子生物学测序鉴定;探究影响纤维素酶活力的因素;利... 从重楼根茎中分离、鉴定具有产纤维素酶活性的内生真菌。采用表面消毒法从重楼块茎中分离内生真菌;用纤维素酶活性CMC平板检测分离菌株的产纤维素酶活性;对高产菌株进行形态学观察和分子生物学测序鉴定;探究影响纤维素酶活力的因素;利用平板法检测该株菌产其他胞外水解酶的活性。从3个来源的重楼中分离出41株内生真菌,通过平板检测发现AS-5、AS-7、AS-9和AS-18菌株能产生纤维素酶,其中AS-9菌株活性最强;通过形态学观察和ITS、LSU序列分析将AS-9菌株鉴定为Setophoma terrestris;该菌在pH值为7.0和温度为28℃时表现出最大纤维素酶活性,紫外线照射对产纤维素酶活性无明显作用;检测发现AS-9菌株同时具有产酪蛋白酶、脂肪酶、天冬酰胺酶、谷氨酰胺酶和脲酶活性。首次在重楼中发现内生真菌Setophoma terrestris,且具有较好的产纤维素酶能力,值得深入研究。 展开更多
关键词 纤维素酶 重楼 分离鉴定 Setophoma terrestris 胞外水解酶
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原核表达家蝇抗菌肽Phormicin A,B蛋白对大肠杆菌标准株的影响 被引量:2
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作者 王兵 杜兵 +6 位作者 王代琴 覃海 韦鹏威 姚杨 万珊 王涛 吴建伟 《生物加工过程》 CAS 2019年第6期623-629,共7页
抗菌肽是近年来新型的抗菌剂药物候选者。以家蝇防御素家族Phormicin A、B抗菌肽为研究对象,探究了其对大肠杆菌的作用效果。采用原核表达法获得二者蛋白,将其作用于大肠杆菌标准株,通过微量液体稀释法测定其最小抑菌浓度分别为20和7.5 ... 抗菌肽是近年来新型的抗菌剂药物候选者。以家蝇防御素家族Phormicin A、B抗菌肽为研究对象,探究了其对大肠杆菌的作用效果。采用原核表达法获得二者蛋白,将其作用于大肠杆菌标准株,通过微量液体稀释法测定其最小抑菌浓度分别为20和7.5 mmol/L,并绘制了二者作用于大肠杆菌标准株的时间生长曲线。结果显示:家蝇Phormicin A、B原核表达蛋白对于大肠杆菌标准株的生长具有一定的抑制作用,此研究为应用于抗临床大肠杆菌感染药物的研发提供了一定的参考。 展开更多
关键词 Phormicin 家蝇 抗菌肽
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抗菌肽Cecropin4与抗生素联合的体外抗菌效果 被引量:3
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作者 彭建 吴兆颖 +3 位作者 刘巍巍 赵海 朱贵明 曾柱 《贵州医科大学学报》 CAS 2019年第10期1151-1155,共5页
目的:探究抗菌肽Cecropin4(Cec4)分别与3种抗生素联合使用对鲍曼不动杆菌(AB)的体外抗菌效果。方法:采用微量肉汤稀释法测定抗菌肽Cec4、注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠(SCF)、注射用亚胺培南西司他丁钠(IMP)及注射用硫酸多黏菌素B(PB)单用时... 目的:探究抗菌肽Cecropin4(Cec4)分别与3种抗生素联合使用对鲍曼不动杆菌(AB)的体外抗菌效果。方法:采用微量肉汤稀释法测定抗菌肽Cec4、注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠(SCF)、注射用亚胺培南西司他丁钠(IMP)及注射用硫酸多黏菌素B(PB)单用时对AB的最小抑菌浓度(MIC),运用棋盘法检测抗菌肽Cec4分别与这3种抗生素联用时对AB的抑菌效果,用部分抑菌浓度指数(FICindex)反映抗菌肽Cec4分别与这3种抗生素联用对AB的用药效果。结果:抗菌肽Cec4、SCF、IMP及PB对标准、多重耐药和泛耐药AB时菌株的MIC分别为4、16~64、16~64及0.625mg/L;抗菌肽Cec4与PB联合作用于标准AB时、FICindex为0.50,抗菌肽Cec4分别与3种抗生素联合作用于多重耐药和泛耐药AB时,FICindex范围均在0.5~1.0。结论:抗菌肽Cec4与PB联合使用对标准AB表现为协同作用,抗菌肽Cec4分别与3种抗生素联合对多重耐药和泛耐药AB表现为相加作用。 展开更多
关键词 抗菌肽Cec4 鲍曼不动杆菌 抑菌活性 联合用药 耐药菌 多黏菌素B
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不同花色白芨四种DNA条形码的序列分析 被引量:3
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作者 曾丽娜 刘显义 +5 位作者 石建龙 梁大勇 张洁 张婷婷 任建国 刘红美 《湖北农业科学》 2018年第17期106-110,共5页
采用CTAB法提取2种花色白芨基因组DNA,选用trnH-psbA、rbcL、ITS、LSU D1-D3 4种植物DNA条形码通用引物进行PCR扩增,分析黄花、紫花白芨(Bletilla striata)4种DNA条形码的序列,扩增产物纯化后连接T载体并测序,用DNAMAN软件对测序结果进... 采用CTAB法提取2种花色白芨基因组DNA,选用trnH-psbA、rbcL、ITS、LSU D1-D3 4种植物DNA条形码通用引物进行PCR扩增,分析黄花、紫花白芨(Bletilla striata)4种DNA条形码的序列,扩增产物纯化后连接T载体并测序,用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对分析。再根据SNP位点设计引物,利用位点特异性PCR扩增进行鉴定。结果表明,4对植物DNA条形码通用引物均能进行扩增,其中trnH-psbA序列没有发现SNP位点、rbcL序列出现2个SNP位点、ITS序列出现62个SNP位点、LSU D1-D3序列出现3个SNP位点。根据LSU D1-D3序列上的2个SNP位点设计的引物DUAN5(5′-TAGTAACGGCGAGCGAAC-3′)和JDHH(5′-TTATCAGCTTCCTTGCGCCCG-3′)能准确鉴定出黄花白芨,成功获得鉴定黄花白芨的引物序列。 展开更多
关键词 白芨(Bletilla striata) DNA条形码 PCR SNP
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食物中多不饱和脂肪酸在家蝇幼虫体内的富集与代谢及对其生长的影响 被引量:2
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作者 杨阳 罗坤 +2 位作者 江超 吴建伟 朱贵明 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期578-585,共8页
【目的】阐明家蝇 Musca domestica 幼虫对食物中各种多不饱和脂肪酸的富集能力以及代谢转化情况,并探究各种多不饱和脂肪酸对家蝇幼虫生长的影响。【方法】在基础饲料中添加不同浓度(3%, 6%和12%)的多不饱和脂肪酸(亚油酸、α-亚麻酸... 【目的】阐明家蝇 Musca domestica 幼虫对食物中各种多不饱和脂肪酸的富集能力以及代谢转化情况,并探究各种多不饱和脂肪酸对家蝇幼虫生长的影响。【方法】在基础饲料中添加不同浓度(3%, 6%和12%)的多不饱和脂肪酸(亚油酸、α-亚麻酸、花生四烯酸和二十二碳六烯酸)饲养经过脱脂传代培养的家蝇幼虫;提取家蝇幼虫的总脂肪酸,利用气相色谱仪进行检测和分析;测定统计幼虫体重,以分析多不饱和脂肪酸对家蝇幼虫生长的影响。【结果】亚油酸、α-亚麻酸和花生四烯酸在家蝇幼虫体内均能被富集,且它们的富集程度随着食物中多不饱和脂肪酸的添加浓度的升高而增加,其中亚油酸、α-亚麻酸和花生四烯酸在幼虫体内富集的最高含量(占体内总脂肪酸的比例)分别为21.93%, 16.13%和9.68%,而二十二碳六烯酸不能在家蝇幼虫体内富集,提示家蝇幼虫食物中添加的各种多不饱和脂肪酸经过代谢后并没有在其体内产生新的脂肪酸,而食物中添加的二十二碳六烯酸在家蝇幼虫体内被分解代谢后消除。饲喂α-亚麻酸及花生四烯酸后家蝇幼虫体重增长较为明显,其中6%α-亚麻酸添加组的幼虫体重显著高于对照组(取食脱脂饲料)和3%和12%α-亚麻酸添加组,3%和6%花生四烯酸添加组的幼虫体重显著高于对照组和12%花生四烯酸添加组。【结论】家蝇幼虫体内能够从食物中富集部分多不饱和脂肪酸,多不饱和脂肪酸碳链越长其富集程度越低直至不能富集,富集的多不饱和脂肪酸对家蝇幼虫生长有不同程度的影响。 展开更多
关键词 家蝇 多不饱和脂肪酸 气相色谱 富集 代谢转化 生长发育
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家蝇Phormicin蛋白表达及对白色念珠菌的抑菌活性分析 被引量:1
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作者 王兵 杜兵 +4 位作者 韦鹏威 黄伟康 李道远 万珊 朱贵明 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1553-1560,共8页
防御素是一类具有广普抗菌活性的阳离子抗菌肽,而家蝇(Musca domestica)的Phormicin属于防御素超家族。白色念珠菌(Candida albicans)是临床上常见的引起人体感染的条件致病真菌。随着免疫缺陷病、糖尿病等疾病发生率的增加,在病人体内... 防御素是一类具有广普抗菌活性的阳离子抗菌肽,而家蝇(Musca domestica)的Phormicin属于防御素超家族。白色念珠菌(Candida albicans)是临床上常见的引起人体感染的条件致病真菌。随着免疫缺陷病、糖尿病等疾病发生率的增加,在病人体内植入设备的白色念珠菌残留及附带感染日益成为临床感染的常见类型。本研究制备了家蝇Phormicin A、Phormicin B的原核表达蛋白,将其作用于白色念珠菌。微量液体稀释法测定了其最小抑菌浓度为2.5mmol/L和1.875mmol/L。进一步绘制了其对白色念珠菌的时间杀菌曲线。结果显示,二者对白色念珠菌都具有一定的抑菌效果。本研究为进一步探索Phormicin参与家蝇天然免疫和揭示家蝇抗真菌防御中的机制提供理论参考,为开发多肽类抗真菌药物提供线索。 展开更多
关键词 Phormicin 抗菌肽 阳离子肽 家蝇
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家蝇天蚕素Cec4的原核表达与纯化 被引量:2
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作者 彭建 刘巍巍 +3 位作者 吴兆颖 杨燕琴 尚小丽 吴建伟 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期182-185,共4页
目的构建家蝇天蚕素(Cecropin)Cec4原核表达质粒,表达及纯化Cec4蛋白。方法从家蝇cDNA文库中筛选家蝇天蚕素基因Cec4,设计并合成特异性引物,PCR扩增Cec4基因,连接克隆载体后转入DH5α感受态细胞,通过重组子鉴定及测序完成目的基因的克... 目的构建家蝇天蚕素(Cecropin)Cec4原核表达质粒,表达及纯化Cec4蛋白。方法从家蝇cDNA文库中筛选家蝇天蚕素基因Cec4,设计并合成特异性引物,PCR扩增Cec4基因,连接克隆载体后转入DH5α感受态细胞,通过重组子鉴定及测序完成目的基因的克隆。用限制性内切酶BamHI和HindⅢ双酶切目的基因和质粒,构建GST表达载体pGEX 4T-1-Cec4,转化到大肠埃希菌BL-21中,利用IPTG诱导表达重组Cec4蛋白,经亲和层析纯化后进行SDS-PAGE电泳分析。结果 PCR扩增获得的Cec4基因全长为192 bp,连接到表达载体pGEX 4T-1获得重组质粒pGEX 4T-1-Cec4,转化大肠埃希菌BL-21后经30℃、0.6 mmol/L的IPTG诱导18 h,表达相对分子质量约为26×10~3上清表达的融合蛋白,亲和层析纯化后的蛋白浓度为0.117 mg/ml。结论成功构建重组质粒pGEX 4T-1-Cec4并表达和纯化获得Cec4蛋白,为其进一步研究奠定了实验基础。 展开更多
关键词 家蝇 CEC4 克隆 原核表达
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黄曲霉细胞壁蛋白AFLMP1的基因克隆与原核表达 被引量:2
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作者 周静 赵雪 +6 位作者 夏雪 王赟 蒙富雪 黄江涛 郭婷 曾柱 胡祖权 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期3054-3059,共6页
根据NCBI数据库中的黄曲霉细胞壁蛋白AFLMP1的基因序列设计特异引物,以黄曲霉菌总RNA逆转录获得的c DNA为模板,PCR扩增目的基因后分别克隆到p GEX-6p-1和p ET-22b原核表达载体中,转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞。重组大肠杆菌经IPTG... 根据NCBI数据库中的黄曲霉细胞壁蛋白AFLMP1的基因序列设计特异引物,以黄曲霉菌总RNA逆转录获得的c DNA为模板,PCR扩增目的基因后分别克隆到p GEX-6p-1和p ET-22b原核表达载体中,转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞。重组大肠杆菌经IPTG诱导表达后超声波破碎提取可溶性蛋白,SDS-PAGE电泳和Western杂交检测表达产物,结果表明GST-AFLMP1和AFLMP1-His融合蛋白能够在大肠杆菌中大量可溶性表达,可分别作为制备AFLMP1特异抗体的免疫抗原和筛选抗原。 展开更多
关键词 黄曲霉 细胞壁蛋白 基因克隆 可溶性表达
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家蝇Phormicin A多克隆抗体的制备及效价检测
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作者 王兵 覃海 +7 位作者 赵杰琼 姚杨 韦鹏威 宋朝蓉 李道远 张其柱 朱贵明 吴建伟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1040-1046,共7页
家蝇Phormicin作为防御素家族的成员,是一类具有广普抗菌活性的抗菌肽。本研究采用原核表达法表达并纯化获得了家蝇Phormicin A蛋白。将家蝇Phormicin A原核表达蛋白与完全佐剂和不完全佐剂乳化混匀,先后免疫新西兰白兔获得其多克隆抗... 家蝇Phormicin作为防御素家族的成员,是一类具有广普抗菌活性的抗菌肽。本研究采用原核表达法表达并纯化获得了家蝇Phormicin A蛋白。将家蝇Phormicin A原核表达蛋白与完全佐剂和不完全佐剂乳化混匀,先后免疫新西兰白兔获得其多克隆抗体。通过原核表达蛋白中和吸附实验,以及Western blot实验验证了抗体的特异性。进一步用金黄色葡萄球菌刺激家蝇三龄幼虫样品,进行内源性验证并测定抗体的效价。结果显示,该多克隆抗体既可以识别家蝇Phormicin A原核表达蛋白,也可以识别金黄色葡萄球菌刺激家蝇三龄幼虫产生的内源性Phormicin A蛋白。本研究为进一步探索Phormicin在家蝇天然免疫和防御中的机制等后续工作打下基础。 展开更多
关键词 Phormicin 多克隆抗体 家蝇 抗菌肽
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雪上一枝蒿化学成分及其生物活性的研究进展 被引量:1
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作者 韦鹏威 杨宇婷 +2 位作者 王聪 刘红美 王兵 《生物加工过程》 CAS 2022年第6期637-650,共14页
雪上一枝蒿为云南、四川等地民间常用药材,被用于治疗风湿疼痛、跌打损伤等症,主要成分为生物碱。其毒性剧烈,但在镇痛方面有显著疗效,具有重要的药用价值。主要从雪上一枝蒿的化学成分、炮制减毒、抗肿瘤、抗炎及抗菌作用等方面对其进... 雪上一枝蒿为云南、四川等地民间常用药材,被用于治疗风湿疼痛、跌打损伤等症,主要成分为生物碱。其毒性剧烈,但在镇痛方面有显著疗效,具有重要的药用价值。主要从雪上一枝蒿的化学成分、炮制减毒、抗肿瘤、抗炎及抗菌作用等方面对其进行综述,以期为雪上一枝蒿的深入研究及其应用提供一定的理论基础和研究方向。 展开更多
关键词 雪上一枝蒿 化学成分 抗菌 毒性 生物活性
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中医药类学术论文编辑加工中的常见问题分析 被引量:1
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作者 周晓薇 唐樑 王兵 《天津科技》 2019年第1期84-87,共4页
对当前的中药类学术期刊中论文存在的问题进行了归纳和分析,包括对药材名称的规范化、药用部位的不明确、药材来源的模糊性以及药材计量单位的差异性等方面进行阐述和举例说明,倡导中医药类科技期刊编辑在不断提高期刊量化指标的同时,... 对当前的中药类学术期刊中论文存在的问题进行了归纳和分析,包括对药材名称的规范化、药用部位的不明确、药材来源的模糊性以及药材计量单位的差异性等方面进行阐述和举例说明,倡导中医药类科技期刊编辑在不断提高期刊量化指标的同时,进一步对论文的学术规范和科研性水平做到更好的管理和优化,以期将我国中医药期刊的编辑出版水平提升到一个更高的层次。 展开更多
关键词 中医药类论文 科技期刊 药材名称 药材计量单位 规范化
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兴义维蚋蚋卵(胚胎)原代细胞培养及鉴定 被引量:1
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作者 周静 刘占钰 +4 位作者 徐旭 崔立秋 吴慧 陈汉彬 杨明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1945-1951,共7页
【目的】筛选出最适宜兴义维蚋蚋卵(胚胎)原代细胞的培养条件和最佳培养基组合,并对其原代细胞进行鉴定,为蚋类细胞系的建立打下基础。【方法】采用组织块和单细胞法对兴义维蚋蚋卵(胚胎)进行原代细胞培养,分析培养基、温度、pH... 【目的】筛选出最适宜兴义维蚋蚋卵(胚胎)原代细胞的培养条件和最佳培养基组合,并对其原代细胞进行鉴定,为蚋类细胞系的建立打下基础。【方法】采用组织块和单细胞法对兴义维蚋蚋卵(胚胎)进行原代细胞培养,分析培养基、温度、pH、CO2和培养器皿对细胞培养的影响;并测定蚋卵(胚胎)及原代细胞的rDNA-ITS区序列,通过构建基于ITS区序列的蚋类系统发育进化树鉴定其种属来源。【结果】兴义维蚋蚋卵(胚胎)原代细胞最适宜的培养方法为组织块法,培养基为改良型Shields and Sang M3,pH 6.0-6.5,培养温度28℃,恒温生化培养箱和5% CO2培养箱对原代细胞培养无明显差异,培养器皿为经多聚赖氨酸(PLL)处理的一次性塑料培养皿/板。由基于ITS区序列构建的蚋类系统发育进化树可知,蚋卵(胚胎)及其原代培养细胞均来源于兴义维蚋。【结论】成功建立的兴义维蚋蚋卵(胚胎)原代细胞培养方法可在科研生产中进一步推广应用。 展开更多
关键词 兴义维蚋 蚋卵(胚胎) 原代细胞 培养 鉴定
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贵州产灯盏细辛组织培养快速繁殖体系的建立 被引量:1
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作者 张洁 毛春燕 +2 位作者 刘利利 曾丽娜 刘红美 《贵州医科大学学报》 CAS 2020年第3期310-314,320,共6页
目的:探讨贵州灯盏细辛组织培养快速繁殖体系的建立。方法:贵州灯盏细辛种子为外植体获得无菌苗后,以无菌苗的叶片和叶柄作为外植体,添加不同浓度6-苄基腺嘌呤(6-BA)、奈乙酸(NAA)于Murashige&Skoog(MS)培养基中,筛选出最适愈伤组... 目的:探讨贵州灯盏细辛组织培养快速繁殖体系的建立。方法:贵州灯盏细辛种子为外植体获得无菌苗后,以无菌苗的叶片和叶柄作为外植体,添加不同浓度6-苄基腺嘌呤(6-BA)、奈乙酸(NAA)于Murashige&Skoog(MS)培养基中,筛选出最适愈伤组织诱导和芽分化增殖的培养基;再采用添加不同浓度的奈乙酸(NAA)和吲哚丁酸(IBA)于MS或1/2 MS中,筛选出最适生根培养基。结果:叶片不适合作为诱导愈伤的外植体,最适宜叶柄愈伤组织诱导的培养基为MS+1.0 mg/L 6-BA+0.3 mg/L NAA;最适宜不定芽分化增殖的培养基为MS+2.0 mg/L 6-BA+0.3 mg/L NAA,增殖倍数可达到12;最适宜生根的培养基为1/2MS+0.5 mg/L NAA+0.8 mg/L IBA,生根率可达100%。结论:本研究建立了贵州灯盏细辛的组织培养快速繁殖体系,为规模化生产奠定基础。 展开更多
关键词 组织培养技术 灯盏细辛 快速繁殖体系 激素配比 愈伤诱导 分化增殖 生根
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