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生物信息学方法分析锌指蛋白605在肝癌中的免疫作用及预后价值
1
作者
罗天新
陈晓梅
+3 位作者
吴湘怡
龙治燕
张姝
黄健
《中西医结合肝病杂志》
CAS
2024年第8期713-719,共7页
目的:探讨锌指蛋白605(ZNF605)在肝细胞癌(HCC)中的免疫作用及预后价值。方法:应用TCGA、GEO等数据库分析ZNF605在HCC中的表达情况,并分析ZNF605表达水平与HCC患者临床病理特征的相关性;应用UALCAN数据库探讨ZNF605在HCC中的甲基化表达...
目的:探讨锌指蛋白605(ZNF605)在肝细胞癌(HCC)中的免疫作用及预后价值。方法:应用TCGA、GEO等数据库分析ZNF605在HCC中的表达情况,并分析ZNF605表达水平与HCC患者临床病理特征的相关性;应用UALCAN数据库探讨ZNF605在HCC中的甲基化表达水平;应用受试者操作特征(ROC)曲线分析ZNF605在HCC中的诊断价值并绘制诺模图,预测HCC患者1、3和5年总生存率;单因素及多因素Cox回归分析ZNF605在HCC中的预后价值;对ZNF605的高低水平表达进行了基因富集分析(GSEA);应用R包-GSVA分析ZNF605的表达水平与肿瘤微环境中免疫细胞的相关性。结果:ZNF605在多种癌症中异常表达,在HCC中高表达并呈低甲基化;ZNF605高表达与患者T分期、临床分期、组织学分级总生存期和甲胎蛋白相关;单因素及多因素Cox回归分析显示ZNF605表达及T分期为HCC的独立预后风险因素;GSEA分析显示ZNF605高表达主要富集在细胞周期;免疫细胞浸润分析提示,ZNF605在HCC中的表达水平与Th2细胞和T辅助细胞呈显著正相关;与树突状细胞细胞、Th17细胞、细胞毒性细胞、中性粒细胞、浆细胞样树突状细胞、B细胞、Tgd细胞和肥大细胞等呈负相关。结论:生物信息学分析结果表明,在HCC中高表达的ZNF605可能是HCC的诊断及预后生物标志物,可能成为潜在的治疗靶点。
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关键词
肝细胞癌
锌指蛋白605
生物信息学
免疫浸润
诊断
预后
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题名
生物信息学方法分析锌指蛋白605在肝癌中的免疫作用及预后价值
1
作者
罗天新
陈晓梅
吴湘怡
龙治燕
张姝
黄健
机构
贵州
医科大学
医学
检验
学院
临床
检验
生化
教研室
织金县中医医院
贵州
医科大学
医学
检验
学院
临床
检验
基础与血液学
教研室
出处
《中西医结合肝病杂志》
CAS
2024年第8期713-719,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.81960589)。
文摘
目的:探讨锌指蛋白605(ZNF605)在肝细胞癌(HCC)中的免疫作用及预后价值。方法:应用TCGA、GEO等数据库分析ZNF605在HCC中的表达情况,并分析ZNF605表达水平与HCC患者临床病理特征的相关性;应用UALCAN数据库探讨ZNF605在HCC中的甲基化表达水平;应用受试者操作特征(ROC)曲线分析ZNF605在HCC中的诊断价值并绘制诺模图,预测HCC患者1、3和5年总生存率;单因素及多因素Cox回归分析ZNF605在HCC中的预后价值;对ZNF605的高低水平表达进行了基因富集分析(GSEA);应用R包-GSVA分析ZNF605的表达水平与肿瘤微环境中免疫细胞的相关性。结果:ZNF605在多种癌症中异常表达,在HCC中高表达并呈低甲基化;ZNF605高表达与患者T分期、临床分期、组织学分级总生存期和甲胎蛋白相关;单因素及多因素Cox回归分析显示ZNF605表达及T分期为HCC的独立预后风险因素;GSEA分析显示ZNF605高表达主要富集在细胞周期;免疫细胞浸润分析提示,ZNF605在HCC中的表达水平与Th2细胞和T辅助细胞呈显著正相关;与树突状细胞细胞、Th17细胞、细胞毒性细胞、中性粒细胞、浆细胞样树突状细胞、B细胞、Tgd细胞和肥大细胞等呈负相关。结论:生物信息学分析结果表明,在HCC中高表达的ZNF605可能是HCC的诊断及预后生物标志物,可能成为潜在的治疗靶点。
关键词
肝细胞癌
锌指蛋白605
生物信息学
免疫浸润
诊断
预后
Keywords
Hepatocellular carcinoma
zinc finger protein 605
bioinformatics
immune infiltration
diagnosis
prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
生物信息学方法分析锌指蛋白605在肝癌中的免疫作用及预后价值
罗天新
陈晓梅
吴湘怡
龙治燕
张姝
黄健
《中西医结合肝病杂志》
CAS
2024
0
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