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家蚕表皮蛋白基因的生物信息学分析
被引量:
9
1
作者
梁九波
刘碧朗
+1 位作者
占智高
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期405-416,共12页
家蚕的表皮蛋白(cuticular protein)是家蚕重要的结构蛋白,与几丁质一同作为家蚕表皮的重要组成部分。运用生物信息学的方法对家蚕表皮蛋白进行了广泛分析。通过保守的基序检索家蚕基因组,得到163条候选的表皮蛋白序列,包括RR、Tweedle...
家蚕的表皮蛋白(cuticular protein)是家蚕重要的结构蛋白,与几丁质一同作为家蚕表皮的重要组成部分。运用生物信息学的方法对家蚕表皮蛋白进行了广泛分析。通过保守的基序检索家蚕基因组,得到163条候选的表皮蛋白序列,包括RR、Tweedle、CPF&CPFL等家族,并且发现具有确定的保守基序的表皮蛋白基因在染色体上都是以串联集群形式分布。氨基酸组成分析表明,这些表皮蛋白富含甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、组氨酸等。运用Sig-nalP server预测这部分蛋白质有85%都具有信号肽。进化分析显示,负选择是家蚕表皮蛋白基因进化的主要驱动力。采用TFSEARCH等在线服务软件分析发现,在70%含有RR基序的家蚕表皮蛋白基因的核心启动子区具有通用的TATAAA序列。
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关键词
家蚕
表皮蛋白
基序
基因簇
生物信息学分析
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职称材料
家蚕脂肪体细胞原代培养及其细胞分化的研究
被引量:
3
2
作者
潘敏慧
刘敏
+3 位作者
蔡秀娟
洪开丽
许湲
鲁成
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期403-408,共6页
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有繁殖和再分化能力的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列,可在体外...
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有繁殖和再分化能力的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列,可在体外培养条件下繁殖,分化成新的脂肪组织,形成的脂肪细胞分泌大量脂肪油滴后破裂死亡。研究结果可为进一步探讨家蚕脂肪体细胞的分化及脂类代谢调节机制提供实验条件。
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关键词
家蚕
脂肪体细胞
原代培养
分化
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职称材料
家蚕脂肪体原代培养中各种形态细胞的观察
被引量:
3
3
作者
刘敏
潘敏慧
+1 位作者
吴克军
鲁成
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第1期247-250,共4页
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。结果表明,家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有各种形态的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列等,...
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。结果表明,家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有各种形态的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列等,可在体外培养条件下繁殖。最后这些细胞充满油滴后陆续死亡。该观察结果可为进一步探讨家蚕脂肪体细胞的分化及脂类代谢调节机制提供实验条件。
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关键词
家蚕
脂肪体细胞
原代培养
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职称材料
家蚕表皮基因BmGCP2的克隆及表达谱分析
被引量:
1
4
作者
李智
甘进锋
+4 位作者
蒙炳超
黄科
李春峰
何宁佳
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期494-498,共5页
从家蚕(Bombyxmori)表皮中克隆了一个高丰度表达的基因,根据其编码的氨基酸序列特征,发现是一个富含甘氨酸的表皮蛋白,将该基因命名为BmGCP2(GenBank登录号:EU980611)。进一步对BmGCP2基因进行了组织表达谱和发育时期表达谱分析,发现该...
从家蚕(Bombyxmori)表皮中克隆了一个高丰度表达的基因,根据其编码的氨基酸序列特征,发现是一个富含甘氨酸的表皮蛋白,将该基因命名为BmGCP2(GenBank登录号:EU980611)。进一步对BmGCP2基因进行了组织表达谱和发育时期表达谱分析,发现该基因在家蚕表皮中特异高表达,并且这种高表达一直从家蚕的胚胎发育后期持续到蛾期,表明BmGCP2基因编码的表皮蛋白是家蚕外骨骼的重要组成成分之一。
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关键词
家蚕
表皮基因BmGCP2
克隆
表达分析
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职称材料
家蚕Bmtdh基因的克隆与序列分析
5
作者
李春峰
范晓东
+2 位作者
刘文明
黄科
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期553-561,共9页
克隆了家蚕苏氨酸脱氢酶基因(Bmtdh),其cDNA长1 310 bp(No.ABA43639.1),包括227 bp 5′-UTR和1 026 bp的完整开放读码框(ORF)。Bmtdh在家蚕基因组上以单拷贝形式存在,编码342个氨基酸,其Ile29-Val322区域是一个完整的表面异构酶功能域...
克隆了家蚕苏氨酸脱氢酶基因(Bmtdh),其cDNA长1 310 bp(No.ABA43639.1),包括227 bp 5′-UTR和1 026 bp的完整开放读码框(ORF)。Bmtdh在家蚕基因组上以单拷贝形式存在,编码342个氨基酸,其Ile29-Val322区域是一个完整的表面异构酶功能域。表达谱分析与EST数据的分析表明,Bmtdh在丝腺和卵巢中的转录水平高于其它组织,并且Bmtdh在家蚕4龄眠期、5龄早期的转录水平也很高,而在卵期(G2胚胎)和1龄早期没有检测到其转录表达,表明Bmtdh基因可能参与了蚕丝蛋白的合成过程。
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关键词
家蚕
苏氨酸脱氢酶基因
丝腺
克隆
序列分析
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职称材料
题名
家蚕表皮蛋白基因的生物信息学分析
被引量:
9
1
作者
梁九波
刘碧朗
占智高
何宁佳
机构
西南大
学
蚕
学
与
系统
生物学
研究所
农业部
蚕桑
学
重点
开放
实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期405-416,共12页
基金
国家高技术研究发展计划"863"项目(编号2006AA10A-118)
文摘
家蚕的表皮蛋白(cuticular protein)是家蚕重要的结构蛋白,与几丁质一同作为家蚕表皮的重要组成部分。运用生物信息学的方法对家蚕表皮蛋白进行了广泛分析。通过保守的基序检索家蚕基因组,得到163条候选的表皮蛋白序列,包括RR、Tweedle、CPF&CPFL等家族,并且发现具有确定的保守基序的表皮蛋白基因在染色体上都是以串联集群形式分布。氨基酸组成分析表明,这些表皮蛋白富含甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、组氨酸等。运用Sig-nalP server预测这部分蛋白质有85%都具有信号肽。进化分析显示,负选择是家蚕表皮蛋白基因进化的主要驱动力。采用TFSEARCH等在线服务软件分析发现,在70%含有RR基序的家蚕表皮蛋白基因的核心启动子区具有通用的TATAAA序列。
关键词
家蚕
表皮蛋白
基序
基因簇
生物信息学分析
Keywords
Bombyxmori
Cuticular protein
Motif
Gene cluster
Bioinformation analysis
分类号
S881 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
家蚕脂肪体细胞原代培养及其细胞分化的研究
被引量:
3
2
作者
潘敏慧
刘敏
蔡秀娟
洪开丽
许湲
鲁成
机构
西南大
学
蚕
学
与
系统
生物学
研究所
农业部
蚕桑
学
重点
开放
实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期403-408,共6页
基金
国家重点基础研究发展计划"973"项目(编号2005CB121-000)
国家高技术研究计划"863"项目(编号2006AA10A-117)
国家自然科学基金项目(编号30471312)
文摘
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有繁殖和再分化能力的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列,可在体外培养条件下繁殖,分化成新的脂肪组织,形成的脂肪细胞分泌大量脂肪油滴后破裂死亡。研究结果可为进一步探讨家蚕脂肪体细胞的分化及脂类代谢调节机制提供实验条件。
关键词
家蚕
脂肪体细胞
原代培养
分化
Keywords
Bombyx mori
Fat body cell
Primary culture
Differentiation
分类号
Q813.11 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
家蚕脂肪体原代培养中各种形态细胞的观察
被引量:
3
3
作者
刘敏
潘敏慧
吴克军
鲁成
机构
云南省
农业
科
学
院
蚕桑
蜜蜂
研究所
西南大
学
蚕
学
与
系统
生物学
研究所
农业部
蚕桑
学
重点
开放
实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第1期247-250,共4页
基金
国家重点基础研究发展计划"973"项目(2005CB121-000)
国家高技术研究计划"863"项目[20(OAA10A-117)]
国家自然科学基金项目(30471312)
文摘
取家蚕4~5龄幼虫背部脂肪体,采用胰蛋白酶消化和组织块贴壁法进行离体培养,观察脂肪体细胞在体外培养过程中的变化。结果表明,家蚕脂肪体细胞在原代培养过程中出现了一批具有各种形态的脂肪前体细胞,细胞间呈管道状或网状排列等,可在体外培养条件下繁殖。最后这些细胞充满油滴后陆续死亡。该观察结果可为进一步探讨家蚕脂肪体细胞的分化及脂类代谢调节机制提供实验条件。
关键词
家蚕
脂肪体细胞
原代培养
Keywords
Bombyx mori
Fat body cell
Primary culture
分类号
S435.622.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
Q512.6 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
家蚕表皮基因BmGCP2的克隆及表达谱分析
被引量:
1
4
作者
李智
甘进锋
蒙炳超
黄科
李春峰
何宁佳
周泽扬
机构
西南大
学
蚕
学
与
系统
生物学
研究所
农业部
蚕桑
学
重点
开放
实验室
重庆师范大
学
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期494-498,共5页
基金
国家高技术研究发展计划"863"项目(编号2006AA10A-118)
西南大学博士基金项目(编号SWUB2008061)
文摘
从家蚕(Bombyxmori)表皮中克隆了一个高丰度表达的基因,根据其编码的氨基酸序列特征,发现是一个富含甘氨酸的表皮蛋白,将该基因命名为BmGCP2(GenBank登录号:EU980611)。进一步对BmGCP2基因进行了组织表达谱和发育时期表达谱分析,发现该基因在家蚕表皮中特异高表达,并且这种高表达一直从家蚕的胚胎发育后期持续到蛾期,表明BmGCP2基因编码的表皮蛋白是家蚕外骨骼的重要组成成分之一。
关键词
家蚕
表皮基因BmGCP2
克隆
表达分析
Keywords
Bombyx mori
Epidermal gene (BmGCP2)
Cloning
Expression analysis
分类号
S881.2 [农业科学—特种经济动物饲养]
Q78 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
家蚕Bmtdh基因的克隆与序列分析
5
作者
李春峰
范晓东
刘文明
黄科
周泽扬
机构
西南大
学
蚕
学
与
系统
生物学
研究所
农业部
蚕桑
学
重点
开放
实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期553-561,共9页
基金
国家自然科学基金项目(编号30400328)
国家重点基础研究发展计划"973"项目(编号2004AA2Z1020)
重庆市自然科学基金项目(编号9067)
文摘
克隆了家蚕苏氨酸脱氢酶基因(Bmtdh),其cDNA长1 310 bp(No.ABA43639.1),包括227 bp 5′-UTR和1 026 bp的完整开放读码框(ORF)。Bmtdh在家蚕基因组上以单拷贝形式存在,编码342个氨基酸,其Ile29-Val322区域是一个完整的表面异构酶功能域。表达谱分析与EST数据的分析表明,Bmtdh在丝腺和卵巢中的转录水平高于其它组织,并且Bmtdh在家蚕4龄眠期、5龄早期的转录水平也很高,而在卵期(G2胚胎)和1龄早期没有检测到其转录表达,表明Bmtdh基因可能参与了蚕丝蛋白的合成过程。
关键词
家蚕
苏氨酸脱氢酶基因
丝腺
克隆
序列分析
Keywords
Bombyx mori
L-threonine 3-dehydrogenase gene
Silk gland
Clone
Sequence analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家蚕表皮蛋白基因的生物信息学分析
梁九波
刘碧朗
占智高
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
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职称材料
2
家蚕脂肪体细胞原代培养及其细胞分化的研究
潘敏慧
刘敏
蔡秀娟
洪开丽
许湲
鲁成
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
3
下载PDF
职称材料
3
家蚕脂肪体原代培养中各种形态细胞的观察
刘敏
潘敏慧
吴克军
鲁成
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010
3
下载PDF
职称材料
4
家蚕表皮基因BmGCP2的克隆及表达谱分析
李智
甘进锋
蒙炳超
黄科
李春峰
何宁佳
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
下载PDF
职称材料
5
家蚕Bmtdh基因的克隆与序列分析
李春峰
范晓东
刘文明
黄科
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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职称材料
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