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颠茄精氨酸脱羧酶基因的克隆与表达分析
被引量:
5
1
作者
王中平
秦白富
+5 位作者
强玮
邱飞
侯艳玲
陈敏
兰小中
廖志华
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第15期2734-2740,共7页
目的克隆颠茄Atropa belladonna精氨酸脱羧酶(arginine decarboxylase,ADC)基因并进行生物信息学、组织表达谱和诱导谱分析。方法以颠茄总RNA反转录的cDNA为模板,采用RACE技术克隆颠茄ADC基因的全长cDNA序列,利用BLAST和PBIL等在线工具...
目的克隆颠茄Atropa belladonna精氨酸脱羧酶(arginine decarboxylase,ADC)基因并进行生物信息学、组织表达谱和诱导谱分析。方法以颠茄总RNA反转录的cDNA为模板,采用RACE技术克隆颠茄ADC基因的全长cDNA序列,利用BLAST和PBIL等在线工具进行生物信息学分析,采用实时定量PCR(q RT-PCR)技术对ADC基因进行组织表达谱和诱导谱分析。结果克隆到2个ADC基因,分别命名为AbADC1(登录号KT802752)和AbADC2(登录号KT802751)。AbADC1基因cDNA全长为2 817 bp,编码712个氨基酸残基;AbADC2基因cDNA全长为2 992 bp,编码715个氨基酸残基。蛋白质序列比对表明,AbADC1与马铃薯Solanum tuberosum ADC的相似性较高,为89%;AbADC2与曼陀罗Datura stramonium ADC的相似性较高,为90%。q RT-PCR检测结果表明,AbADC1在须根中的表达量最高,而AbADC2在主根中的表达量最高;AbADC1和AbADC2均不受盐胁迫响应,AbADC2受低温胁迫响应。结论首次克隆并获得了2条颠茄ADC基因全长序列,为进一步研究颠茄托品烷类生物碱的代谢合成奠定了基础。
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关键词
颠茄
精氨酸脱羧酶
基因表达
托品烷类生物碱
总RNA
CDNA
原文传递
题名
颠茄精氨酸脱羧酶基因的克隆与表达分析
被引量:
5
1
作者
王中平
秦白富
强玮
邱飞
侯艳玲
陈敏
兰小中
廖志华
机构
西南大
学
生命科学
学院
三峡库区
教育部
生态环境
教育部
重点
实验室
西南大
学
西藏农牧
学院
药用植物联合研发中心
中山大
学
生命科学
学院
西南大
学
药
学
学院
西藏大
学
农牧
学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第15期2734-2740,共7页
基金
教育部新世纪人才支持计划(NCET-12-0930)
国家自然科学基金项目(31370333)
+1 种基金
重庆市科技攻关项目(CSTC2012GGYYJS80013)
西南大学中央高校基本科研业务费专项(XDJK2013A024)
文摘
目的克隆颠茄Atropa belladonna精氨酸脱羧酶(arginine decarboxylase,ADC)基因并进行生物信息学、组织表达谱和诱导谱分析。方法以颠茄总RNA反转录的cDNA为模板,采用RACE技术克隆颠茄ADC基因的全长cDNA序列,利用BLAST和PBIL等在线工具进行生物信息学分析,采用实时定量PCR(q RT-PCR)技术对ADC基因进行组织表达谱和诱导谱分析。结果克隆到2个ADC基因,分别命名为AbADC1(登录号KT802752)和AbADC2(登录号KT802751)。AbADC1基因cDNA全长为2 817 bp,编码712个氨基酸残基;AbADC2基因cDNA全长为2 992 bp,编码715个氨基酸残基。蛋白质序列比对表明,AbADC1与马铃薯Solanum tuberosum ADC的相似性较高,为89%;AbADC2与曼陀罗Datura stramonium ADC的相似性较高,为90%。q RT-PCR检测结果表明,AbADC1在须根中的表达量最高,而AbADC2在主根中的表达量最高;AbADC1和AbADC2均不受盐胁迫响应,AbADC2受低温胁迫响应。结论首次克隆并获得了2条颠茄ADC基因全长序列,为进一步研究颠茄托品烷类生物碱的代谢合成奠定了基础。
关键词
颠茄
精氨酸脱羧酶
基因表达
托品烷类生物碱
总RNA
CDNA
Keywords
Atropa belladonna L.
arginine decarboxylase
gene expression
tropane alkaloids
total RNA
cDNA
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
颠茄精氨酸脱羧酶基因的克隆与表达分析
王中平
秦白富
强玮
邱飞
侯艳玲
陈敏
兰小中
廖志华
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
原文传递
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参考文献
引证文献
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