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一株木质素降解菌的鉴定及其降解特性
被引量:
10
1
作者
胡笑峰
张朵朵
+2 位作者
周云横
卫亚红
陈少林
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期172-177,共6页
为丰富木质素降解优良菌株种质资源,以碱木质素为唯一生长碳源并采用苯胺蓝和考马斯亮蓝脱色法从落叶覆盖的土壤中分离和筛选具有木质素降解能力的细菌。通过 16S rRNA 基因序列分析对菌株进行鉴定。使用紫外分光光度法测定其木质素过...
为丰富木质素降解优良菌株种质资源,以碱木质素为唯一生长碳源并采用苯胺蓝和考马斯亮蓝脱色法从落叶覆盖的土壤中分离和筛选具有木质素降解能力的细菌。通过 16S rRNA 基因序列分析对菌株进行鉴定。使用紫外分光光度法测定其木质素过氧化物酶(LiP)、锰过氧化物酶(MnP)及漆酶(Lac)活力以及变化趋势。使用扫描电镜观察木质素样品在降解过程中的形貌变化。筛选得到 1 株木质素降解细菌 QL-Z3,经鉴定命名为 Erwinia sp. QL-Z3。在以碱木质素为唯一碳源的液体碱木质素培养基中发酵 48 h,菌体生长达到稳定期,OD600 达到 0.31,发酵 72 h,木质素降解率为 14.23%。木质素降解相关酶活力在发酵 48 h 和60 h 达到峰值:发酵 60 h Mnp 达到 263.83 U/L;发酵 48 h Lip 和 Lac 分别达到 104.11 U/L 和 77 U/L。扫描电镜观察到菌株能够对木质素样品进行解聚,破坏木质素结构,使其裂解成细小的碎片。较为系统地揭示了菌株 Erwinia sp. QL-Z3 的木质素降解性能,该菌株可作为木质素降解的优良备选菌株。
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关键词
碱木质素
木质素降解菌
欧文氏菌属
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职称材料
玉米长链酰基辅酶A合成酶1基因鉴定及其蛋白磷酸化位点检测
被引量:
1
2
作者
陈莹
王晓峰
陈少林
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2020年第4期49-55,共7页
【目的】对玉米中长链酰基辅酶A合成酶1(ZmLACS1)基因及其蛋白磷酸化位点进行鉴定,为研究玉米脂肪酸的降解及其利用机制奠定基础。【方法】通过结构域分析查找质谱鉴定到蛋白中的长链酰基辅酶A合成酶1,通过系统发育树分析判断玉米中长...
【目的】对玉米中长链酰基辅酶A合成酶1(ZmLACS1)基因及其蛋白磷酸化位点进行鉴定,为研究玉米脂肪酸的降解及其利用机制奠定基础。【方法】通过结构域分析查找质谱鉴定到蛋白中的长链酰基辅酶A合成酶1,通过系统发育树分析判断玉米中长链酰基辅酶A合成酶1与拟南芥超家族中长链酰基辅酶A合成酶的同源性,通过质谱分析鉴定该蛋白的磷酸化修饰位点。通过3D建模模拟长链酰基辅酶A合成酶1的结构以及磷酸化位点所在位置。【结果】玉米长链酰基辅酶A合成酶1(ZmLACS1)与拟南芥中的长链酰基辅酶A合成酶1(AtLACS1)具有高度同源性;通过质谱分析鉴定到3个该蛋白的磷酸化位点分别为S360、Y365和S366,同时鉴定到的磷酸化位点位于长链酰基辅酶A合成酶的保守结构域(AMP-binding domain)中,3个磷酸化位点位置一致,位于两个α螺旋中间,处于蛋白结构的关键位置。【结论】磷酸化修饰可能是调节长链酰基辅酶A合成酶1功能的关键性方式之一,ZmLACS1可能与AtLACS1在功能上具有相似性。
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关键词
玉米
长链酰基辅酶A合成酶
磷酸化修饰
蛋白结构
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职称材料
题名
一株木质素降解菌的鉴定及其降解特性
被引量:
10
1
作者
胡笑峰
张朵朵
周云横
卫亚红
陈少林
机构
西北农林科技大学
生命科学
学院
旱区
生物质能
研究
中心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期172-177,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31770207)
科技部“十二五”农村领域国家科技计划支撑项目(2015BAD15B0503)
文摘
为丰富木质素降解优良菌株种质资源,以碱木质素为唯一生长碳源并采用苯胺蓝和考马斯亮蓝脱色法从落叶覆盖的土壤中分离和筛选具有木质素降解能力的细菌。通过 16S rRNA 基因序列分析对菌株进行鉴定。使用紫外分光光度法测定其木质素过氧化物酶(LiP)、锰过氧化物酶(MnP)及漆酶(Lac)活力以及变化趋势。使用扫描电镜观察木质素样品在降解过程中的形貌变化。筛选得到 1 株木质素降解细菌 QL-Z3,经鉴定命名为 Erwinia sp. QL-Z3。在以碱木质素为唯一碳源的液体碱木质素培养基中发酵 48 h,菌体生长达到稳定期,OD600 达到 0.31,发酵 72 h,木质素降解率为 14.23%。木质素降解相关酶活力在发酵 48 h 和60 h 达到峰值:发酵 60 h Mnp 达到 263.83 U/L;发酵 48 h Lip 和 Lac 分别达到 104.11 U/L 和 77 U/L。扫描电镜观察到菌株能够对木质素样品进行解聚,破坏木质素结构,使其裂解成细小的碎片。较为系统地揭示了菌株 Erwinia sp. QL-Z3 的木质素降解性能,该菌株可作为木质素降解的优良备选菌株。
关键词
碱木质素
木质素降解菌
欧文氏菌属
Keywords
alkali lignin
lignin degrading bacteria
Erwinia
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
X793
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职称材料
题名
玉米长链酰基辅酶A合成酶1基因鉴定及其蛋白磷酸化位点检测
被引量:
1
2
作者
陈莹
王晓峰
陈少林
机构
西北农林科技大学
生命科学
学院
旱区
生物质能
研究
中心
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2020年第4期49-55,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31770207)
科技部“十二五”农村领域国家科技计划项目(2015BAD15B0503)。
文摘
【目的】对玉米中长链酰基辅酶A合成酶1(ZmLACS1)基因及其蛋白磷酸化位点进行鉴定,为研究玉米脂肪酸的降解及其利用机制奠定基础。【方法】通过结构域分析查找质谱鉴定到蛋白中的长链酰基辅酶A合成酶1,通过系统发育树分析判断玉米中长链酰基辅酶A合成酶1与拟南芥超家族中长链酰基辅酶A合成酶的同源性,通过质谱分析鉴定该蛋白的磷酸化修饰位点。通过3D建模模拟长链酰基辅酶A合成酶1的结构以及磷酸化位点所在位置。【结果】玉米长链酰基辅酶A合成酶1(ZmLACS1)与拟南芥中的长链酰基辅酶A合成酶1(AtLACS1)具有高度同源性;通过质谱分析鉴定到3个该蛋白的磷酸化位点分别为S360、Y365和S366,同时鉴定到的磷酸化位点位于长链酰基辅酶A合成酶的保守结构域(AMP-binding domain)中,3个磷酸化位点位置一致,位于两个α螺旋中间,处于蛋白结构的关键位置。【结论】磷酸化修饰可能是调节长链酰基辅酶A合成酶1功能的关键性方式之一,ZmLACS1可能与AtLACS1在功能上具有相似性。
关键词
玉米
长链酰基辅酶A合成酶
磷酸化修饰
蛋白结构
Keywords
Zea mays
long chain acyl-CoA synthase 1
phosphorylation
protein structure
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株木质素降解菌的鉴定及其降解特性
胡笑峰
张朵朵
周云横
卫亚红
陈少林
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
10
下载PDF
职称材料
2
玉米长链酰基辅酶A合成酶1基因鉴定及其蛋白磷酸化位点检测
陈莹
王晓峰
陈少林
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2020
1
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职称材料
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