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鲁中肉羊不同生长阶段体尺体重的遗传参数估计 被引量:1
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作者 杨存明 刘静 +10 位作者 张梦华 张晓雪 刘桂芬 何军敏 毛静艺 李雪 唐丽 张文静 潘林香 田可川 黄锡霞 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期48-57,共10页
估计鲁中肉羊不同生长阶段体尺、体重的遗传参数,分析各性状间的遗传规律,以期为鲁中肉羊育种规划工作提供理论依据。收集2015—2019年共15 040条鲁中肉羊体尺、体重数据,以初生、3月龄、6月龄、周岁和成年阶段的体重、体高、体长、胸... 估计鲁中肉羊不同生长阶段体尺、体重的遗传参数,分析各性状间的遗传规律,以期为鲁中肉羊育种规划工作提供理论依据。收集2015—2019年共15 040条鲁中肉羊体尺、体重数据,以初生、3月龄、6月龄、周岁和成年阶段的体重、体高、体长、胸围、胸宽、胸深、管围性状为研究对象,利用DMU软件中AI-REML结合EM算法并配合动物模型,以出生年份、出生季节和性别为固定效应,以加性效应和母体效应为随机效应,估计各性状的遗传力和遗传相关。结果表明,初生至成年阶段鲁中肉羊的体重的遗传力为0.18~0.51,体高的遗传力为0.15~0.60,体长的遗传力为0.09~0.42,胸围的遗传力为0.11~0.43,胸宽的遗传力为0.05~0.39,胸深的遗传力为0.06~0.21,管围的遗传力为0.11~0.59,初生至6月龄阶段母体遗传力为0.15~0.26,不同阶段性状间遗传相关系数-0.52~0.98,表型相关系数为-0.05~0.95,不同生长阶段间体重的遗传相关系数为-0.10~0.87,表型相关系数为0.01~0.91。综上,母体遗传效应对鲁中肉羊早期生长性状影响较大,随着成长母体遗传效应逐步减弱,周岁阶段体重遗传力在本研究中最高,不同生长阶段体尺体重间存在中到高的遗传相关,各生长阶段间6月龄与周岁阶段体重遗传相关系数最高。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 不同生长阶段 体尺 体重 母体遗传效应 遗传参数
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非遗传因素对鲁中肉羊不同生长阶段体尺体重性状的影响 被引量:2
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作者 刘静 毛静艺 +5 位作者 吴翠玲 刘桂芬 潘林香 何军敏 黄锡霞 田可川 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期108-113,共6页
为了探析非遗传因素对鲁中肉羊不同生长阶段体尺体重性状的影响,采用莱芜市赢泰有机农业科技发展有限公司2015—2019年的15 040条鲁中肉羊的生产性能数据,用最小二乘方差分析和多重比较分析了出生年份、出生季节、性别对初生、3月龄、6... 为了探析非遗传因素对鲁中肉羊不同生长阶段体尺体重性状的影响,采用莱芜市赢泰有机农业科技发展有限公司2015—2019年的15 040条鲁中肉羊的生产性能数据,用最小二乘方差分析和多重比较分析了出生年份、出生季节、性别对初生、3月龄、6月龄、周岁、成年阶段鲁中肉羊体重、体高、体长、胸围、胸宽、胸深、管围的影响。结果表明,出生年份对鲁中肉羊初生、3月龄、6月龄、成年阶段的体重、体高、体长、胸围、胸宽、胸深、管围均有极显著影响,出生年份对周岁阶段的体重、体高、胸围、胸宽、胸深、管围有极显著影响。出生季节对初生阶段的体重、体长、胸宽、胸深有极显著影响;出生季节对3月龄阶段的体重、体高、体长、胸围、胸宽、胸深和管围均有极显著影响;出生季节对6月龄阶段的体重、体高、胸围、胸宽、胸深、管围有极显著影响;出生季节对周岁体重、体高、体长、胸围、胸宽也有极显著影响;出生季节对成年阶段的体长有极显著影响。性别对鲁中肉羊初生、3月龄、6月龄、周岁、成年阶段的体重、体高、体长、胸围、胸宽、胸深、管围均有极显著影响。本文通过对影响鲁中肉羊不同生长阶段的非遗传因素进行科学合理分析,为鲁中肉羊遗传参数估计和遗传进展工作的进行奠定基础。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 不同生长阶段 体尺体重 非遗传因素
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鲁中肉羊初生体尺体重的遗传参数估计 被引量:5
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作者 陶林 潘林香 +5 位作者 王金文 狄冉 刘秋月 胡文萍 王翔宇 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第2期17-19,27,共4页
为估计鲁中肉羊初生重、体高、体长、胸宽、胸深、胸围和管围的遗传参数,利用2018年上半年出生的611只鲁中肉羊的初生体尺体重数据,采用AI-REML (Average information restricted maximum likelihood)算法,借助DMU软件分析以产羔数为固... 为估计鲁中肉羊初生重、体高、体长、胸宽、胸深、胸围和管围的遗传参数,利用2018年上半年出生的611只鲁中肉羊的初生体尺体重数据,采用AI-REML (Average information restricted maximum likelihood)算法,借助DMU软件分析以产羔数为固定效应、个体加性遗传效应为随机效应的多性状动物模型。结果表明:鲁中肉羊初生重、胸宽、胸深、体高、体长、胸围和管围的遗传力分别为0.16、0.10、0.22、0.44、0.43、0.46和0.52,各性状之间遗传相关为-0.517~0.773,表型相关为-0.197~0.503。说明鲁中肉羊初生重、胸宽和胸深为低遗传力性状,体高、体长、胸围和管围为中等遗传力性状。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 初生体尺体重 遗传参数 AI-REML
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鲁中肉羊SMAD1和ESR2基因多态性与产羔数关联分析 被引量:4
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作者 田志龙 潘林香 +2 位作者 王金文 马琳 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第2期13-16,共4页
为探究SMAD1、ESR2基因多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,采用Sequenom MassARRAY誖SNP技术检测鲁中肉羊SMAD1、ESR2基因单核苷酸多态性,并与产羔数进行关联分析。结果表明:SMAD1基因g.12485895A>G存在AA、AG和GG基因型,基因型频率... 为探究SMAD1、ESR2基因多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,采用Sequenom MassARRAY誖SNP技术检测鲁中肉羊SMAD1、ESR2基因单核苷酸多态性,并与产羔数进行关联分析。结果表明:SMAD1基因g.12485895A>G存在AA、AG和GG基因型,基因型频率分别为0.05、0.45和0.50;ESR2基因g.73324006C>T存在CC和CT基因型,基因型频率分别为0.98和0.02。g.12485895A>G位点在鲁中肉羊表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),g.73324006C>T位点为低度多态(PIC<0.25);卡方适合性检验表明,g.12485895A>G位点在鲁中肉羊处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05),g. 73324006C>T位点处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。g.12485895A>G位点多态性与鲁中肉羊产羔数没有显著关联(P>0.05), g.73324006C>T位点多态性与鲁中肉羊产羔数显著关联(P<0.05)。综上可知,SMAD1基因g.12485895A>G位点和鲁中肉羊产羔数性状没有显著关联(P>0.05),ESR2基因g.73324006C>T位点对鲁中肉羊产羔数性状选育具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 绵羊 SMAD1 ESR2 分型 产羔数
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鲁中肉羊GLIS1基因多态性及其与产羔数的关联分析 被引量:2
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作者 张壮彪 潘林香 +2 位作者 王金文 贺小云 储明星 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第9期12-17,共6页
为探究鲁中肉羊GLIS1基因g.27775611T>C位点多态性与其产羔数的关系,利用Sequenom MassARRAY^®RSNP技术对384只鲁中肉羊的g.27775611T>C位点进行多态性检测。结果表明,该群体含有TT、TC和CC三种基因型。群体遗传学分析发现,... 为探究鲁中肉羊GLIS1基因g.27775611T>C位点多态性与其产羔数的关系,利用Sequenom MassARRAY^®RSNP技术对384只鲁中肉羊的g.27775611T>C位点进行多态性检测。结果表明,该群体含有TT、TC和CC三种基因型。群体遗传学分析发现,该位点在鲁中肉羊群体中处于低度多态(PIC<0.25),且该群体处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析表明突变纯合个体(CC)的产羔数显著低于突变杂合个体(TC)和野生型(TT)(P<0.05)。生物信息学分析表明GLIS1蛋白属于碱性不稳定脂溶性的疏水蛋白,存在对其核定位具有重要作用的锌指功能域。突变前后糖基化和磷酸化的变化可能是引起该蛋白功能甚至是产羔数变化的重要原因。研究结果表明,GLIS1基因g.27775611T>C位点突变显著降低了鲁中肉羊的产羔数,为筛选合适的绵羊高繁殖力遗传标记提供了参考。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 GLIS1基因 产羔数 生物信息学分析
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鲁中肉羊HIRA基因多态性及其与产羔数的关联分析 被引量:1
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作者 张仁森 刘秋月 +6 位作者 潘林香 王金文 王翔宇 胡文萍 马琳 狄冉 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第3期1-5,共5页
该研究旨在探究鲁中肉羊HIRA基因g.71833755 T>C和g.71874104 G>A两个位点多态性及其与产羔数之间的关系,以期为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY~? SNP技术对鲁中肉羊HIRA基... 该研究旨在探究鲁中肉羊HIRA基因g.71833755 T>C和g.71874104 G>A两个位点多态性及其与产羔数之间的关系,以期为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY~? SNP技术对鲁中肉羊HIRA基因2个多态位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析。结果表明:鲁中肉羊HIRA基因g.71833755 T>C位点存在TT、TC和CC三种基因型,g.71874104 G>A位点存在AA、AG和GG三种基因型。g.71833755 T>C位点在鲁中肉羊中表现为低度多态(PIC<0.25),该位点在鲁中肉羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05);g.71874104G>A位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),该位点在鲁中肉羊中处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。HIRA基因g.71874104 G>A位点多态性与鲁中肉羊第2胎、第3胎产羔数显著关联(P<0.05),杂合型AG个体各胎产羔数均高于野生型GG和突变纯合型AA个体;g.71833755 T>C位点多态性与鲁中肉羊第2胎产羔数显著关联(P<0.05),杂合型TC个体第2胎产羔数均高于野生型TT(P>0.05)和突变纯合型CC个体(P <0.05)。综上,g.71833755 T>C位点的C等位基因和g.71874104 G>A位点的A等位基因可能是提高绵羊产羔数的潜在有效的DNA标记。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 HIRA基因 SNP分型 产羔数
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鲁中肉羊GTF2A1基因多态性及其与产羔数的关联分析 被引量:1
7
作者 狄冉 刘秋月 +8 位作者 潘林香 王金文 王翔宇 胡文萍 夏青 马琳 张仁森 潘章源 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第4期15-17,80,共4页
该研究旨在分析绵羊GTF2A1基因g.89505005G>A位点多态性与产羔数之间的关系,以期寻找与绵羊产羔数有关的分子标记。针对前期利用基因组选择信号分析获得的候选基因GTF2A1及其g.89505005G>A位点,采用Sequenom MassARRAY SNP技术对... 该研究旨在分析绵羊GTF2A1基因g.89505005G>A位点多态性与产羔数之间的关系,以期寻找与绵羊产羔数有关的分子标记。针对前期利用基因组选择信号分析获得的候选基因GTF2A1及其g.89505005G>A位点,采用Sequenom MassARRAY SNP技术对产羔数存在差异的鲁中肉羊群体进行该位点的多态性检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明:鲁中肉羊GTF2A1基因g.89505005G>A位点存在AA、AG和GG三种基因型,且以GG基因型为主;g.89505005G>A位点多态性与鲁中肉羊第1胎、第2胎以及第3胎产羔数均存在显著关联(P<0.05),AA型各胎产羔数均高于GG型(P<0.05)。综上,g.89505005G>A位点A等位基因可能是提高绵羊产羔数的一个潜在有效的DNA标记。 展开更多
关键词 绵羊 GTF2A1 基因 产羔数 SNP 分型
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鲁中肉羊BMP4基因g.63454744 T>G位点多态性与产羔数的关联分析
8
作者 文禹粱 潘林香 +3 位作者 王金文 马琳 赵生国 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第3期11-13,17,共4页
为了探索骨形态发生蛋白4(Bone morphogenetic protein 4,BMP4)基因g.63454744T>G位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,对前期重测序中筛选得到的BMP4基因编码区错义突变单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism site, SNP)... 为了探索骨形态发生蛋白4(Bone morphogenetic protein 4,BMP4)基因g.63454744T>G位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,对前期重测序中筛选得到的BMP4基因编码区错义突变单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism site, SNP)g.63454744T>G在384只鲁中肉羊中利用Sequenom MassARRAY~? SNP技术进行分型,再将分型结果与鲁中肉羊产羔数进行关联分析。结果表明:BMP4基因g.63454744T>G位点在鲁中肉羊中存在TT、GT和GG三种基因型;该位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),且在鲁中肉羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.01);该位点多态性与鲁中肉羊各胎产羔数均无显著关联(P>0.05)。说明BMP4基因g.63454744T>G位点不适合用于鲁中肉羊产羔数选育。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 BMP4基因 SNP分型 产羔数
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鲁中肉羊TSHR多态性与产羔数的关联及生物信息学分析
9
作者 陈炜昊 潘林香 +3 位作者 王金文 马琳 孙伟 储明星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期3935-3940,共6页
本研究旨在探究TSHR基因g.89431097C>G位点多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,并进行相关生物信息学分析,以期为TSHR基因编码蛋白功能机制研究提供基础数据并为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Seq... 本研究旨在探究TSHR基因g.89431097C>G位点多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,并进行相关生物信息学分析,以期为TSHR基因编码蛋白功能机制研究提供基础数据并为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY?SNP技术对鲁中肉羊TSHR基因g.89431097C>G位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析,利用Protparam等软件对TSHR基因进行生物信息学分析。分型结果表明:g.89431097C>G位点存在GG、GC和CC 3种基因型;群体遗传学分析表明,g.89431097C>G位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5);卡方适合性检验结果表明,该位点在鲁中肉羊中处于哈代温伯格平衡状态(p>0.05);关联分析表明,g.89431097C>G位点GG型第一胎、第二胎、第三胎产羔数均显著高于GC与CC型(p<0.05)。生物信息学分析表明绵羊TSHR基因编码764个氨基酸组成不稳定碱性疏水性蛋白,存在信号肽,存在7个跨膜域,预测存在6个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点和85个磷酸化位点,预测存在二硫键,绵羊与山羊、家牛等12个物种TSHR基因编码区生物进化高度保守。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 TSHR SNP分型 产羔数 生物信息学
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