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基于长链底物亲和的脂肪酶MAS1理性设计改造
1
作者
唐秀云
王嘉伟
+4 位作者
张建国
缪雨露
赵玥
高蓓
张鲁嘉
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期529-535,共7页
探讨了脂肪酶MAS1对长链底物4-硝基苯酚豆蔻肉酸酯(pNP-C14)催化的最适温度、最适pH、pH稳定性,并通过分子动力学模拟计算得出结合自由能,然后根据结合自由能的差值初步筛选出了G145W及T141L两个单点突变体。实验表明,与野生型MAS1相比...
探讨了脂肪酶MAS1对长链底物4-硝基苯酚豆蔻肉酸酯(pNP-C14)催化的最适温度、最适pH、pH稳定性,并通过分子动力学模拟计算得出结合自由能,然后根据结合自由能的差值初步筛选出了G145W及T141L两个单点突变体。实验表明,与野生型MAS1相比,结合自由能降低显著的突变体G145W的米氏常数(Km)减小了11%,催化常数(kcat)与Km的比值(kcat/Km)为野生型MAS1的1.29倍,突变体G145W对长链底物的亲和能力和催化效率均有提高;而结合自由能降低较小的突变体T141L的Km值增大了22%,kcat/Km为野生型MAS1的0.88倍,说明酶与底物分子结合自由能的降低并非准确的突变筛选标准。通过分子力学/广义波恩表面积(MM/GBSA)残基拆解分析得出:残基T38、F39、L149、F153、V202、V233对脂肪酶活性口袋与长链底物结合的稳定性贡献较其他残基大;残基T38、G40、N41、N45和T237对提高长链底物的亲和能力具有重要贡献,预测为热点残基,其结合自由能的降低可以作为突变筛选的参考标准。
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关键词
脂肪酶MAS1
长链底物
动力学
MM/GBSA
热点残基
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职称材料
题名
基于长链底物亲和的脂肪酶MAS1理性设计改造
1
作者
唐秀云
王嘉伟
张建国
缪雨露
赵玥
高蓓
张鲁嘉
机构
华东理工
大学
生物工程学院
上海
理工
大学
健康科学
与
工程学院
华东师范
大学
化学
与
分子工程学院
纽约大学
(
上海
)
理论
与
计算
化学
联合
中心
出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期529-535,共7页
基金
国家重点研发计划(2020YFA0908400)
国家自然科学基金(31772007,U1805235)
+2 种基金
上海市自然科学基金(21ZR1416500)
纽约大学全球种子基金
纽约大学-华东师范大学计算化学中心(ECNU创新001公众平台)。
文摘
探讨了脂肪酶MAS1对长链底物4-硝基苯酚豆蔻肉酸酯(pNP-C14)催化的最适温度、最适pH、pH稳定性,并通过分子动力学模拟计算得出结合自由能,然后根据结合自由能的差值初步筛选出了G145W及T141L两个单点突变体。实验表明,与野生型MAS1相比,结合自由能降低显著的突变体G145W的米氏常数(Km)减小了11%,催化常数(kcat)与Km的比值(kcat/Km)为野生型MAS1的1.29倍,突变体G145W对长链底物的亲和能力和催化效率均有提高;而结合自由能降低较小的突变体T141L的Km值增大了22%,kcat/Km为野生型MAS1的0.88倍,说明酶与底物分子结合自由能的降低并非准确的突变筛选标准。通过分子力学/广义波恩表面积(MM/GBSA)残基拆解分析得出:残基T38、F39、L149、F153、V202、V233对脂肪酶活性口袋与长链底物结合的稳定性贡献较其他残基大;残基T38、G40、N41、N45和T237对提高长链底物的亲和能力具有重要贡献,预测为热点残基,其结合自由能的降低可以作为突变筛选的参考标准。
关键词
脂肪酶MAS1
长链底物
动力学
MM/GBSA
热点残基
Keywords
lipase MAS1
long-chain substrate
kinetics
MM/GBSA
hotspot residues
分类号
Q55 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于长链底物亲和的脂肪酶MAS1理性设计改造
唐秀云
王嘉伟
张建国
缪雨露
赵玥
高蓓
张鲁嘉
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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