目的分析中国大陆地区2004-2016年柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus group A type 10,CA10)流行毒株基因型分布概况和进化规律,为手足口病防控提供数据支撑。方法利用MEGA 6.0软件对GenBank核酸数据库收录的流行于中国大陆地区的CA10毒...目的分析中国大陆地区2004-2016年柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus group A type 10,CA10)流行毒株基因型分布概况和进化规律,为手足口病防控提供数据支撑。方法利用MEGA 6.0软件对GenBank核酸数据库收录的流行于中国大陆地区的CA10毒株VP1区基因序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株彼此间的核苷酸和氨基酸同源性进行计算。结果纳入本研究的中国大陆地区CA10毒株共计218株,中国大陆地区CA10流行毒株的基因型以C型为主。与原型株CA10-Kowalik相比,中国大陆地区CA10毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为69.4%~73.9%和90.6%~93.6%;中国大陆地区CA10毒株内部的核苷酸和氨基酸同源性分别为76.4%~100.0%和92.9%~100.0%。结论本研究提示应针对CA10毒株流行趋势和基因型分布情况,采取有效措施防控手足口病。展开更多
文摘目的分析中国大陆地区2004-2016年柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus group A type 10,CA10)流行毒株基因型分布概况和进化规律,为手足口病防控提供数据支撑。方法利用MEGA 6.0软件对GenBank核酸数据库收录的流行于中国大陆地区的CA10毒株VP1区基因序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株彼此间的核苷酸和氨基酸同源性进行计算。结果纳入本研究的中国大陆地区CA10毒株共计218株,中国大陆地区CA10流行毒株的基因型以C型为主。与原型株CA10-Kowalik相比,中国大陆地区CA10毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为69.4%~73.9%和90.6%~93.6%;中国大陆地区CA10毒株内部的核苷酸和氨基酸同源性分别为76.4%~100.0%和92.9%~100.0%。结论本研究提示应针对CA10毒株流行趋势和基因型分布情况,采取有效措施防控手足口病。
