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基于新一代密度泛函和神经网络势能面的量子反应动力学计算 被引量:2
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作者 苏乃强 陈俊 +1 位作者 徐昕 张东辉 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第1期119-130,共12页
介绍了近年来发展起来的新一代密度泛函XYG3及利用神经网络构造分子体系势能面的最新进展。以H3和CH5等体系为实例,表明基于高效准确的密度泛函电子结构计算,与神经网络高精度势能面构造的理想结合,可以得到可靠的化学动力学结果,并有... 介绍了近年来发展起来的新一代密度泛函XYG3及利用神经网络构造分子体系势能面的最新进展。以H3和CH5等体系为实例,表明基于高效准确的密度泛函电子结构计算,与神经网络高精度势能面构造的理想结合,可以得到可靠的化学动力学结果,并有望用于更大更复杂的体系。 展开更多
关键词 密度泛函 势能面 神经网络 第一性原理 反应动力学
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嵌套式稀疏网格随机配置法及其在随机门延时建模中的应用 被引量:2
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作者 罗旭 杨帆 +4 位作者 朱恒亮 陶俊 蔡伟 周电 曾璇 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第1期165-172,共8页
为了提高随机工艺偏差下门延时建模的计算精度和效率,提出一种基于扩展Gauss积分理论及嵌套式稀疏网格技术的随机配置门延时建模方法.首先采用参数空间中具有指数收敛特性的随机正交多项式对随机门延时进行逼近;然后针对现有的基于传统G... 为了提高随机工艺偏差下门延时建模的计算精度和效率,提出一种基于扩展Gauss积分理论及嵌套式稀疏网格技术的随机配置门延时建模方法.首先采用参数空间中具有指数收敛特性的随机正交多项式对随机门延时进行逼近;然后针对现有的基于传统Gauss积分理论的稀疏网格随机配置法所用的配置点不具有嵌套特性的问题,利用单变量扩展Gauss积分理论及稀疏网格技术构造了一组嵌套式多变量Gauss积分点,将其作为随机门延时建模的配置点.这组配置点既具有Gauss积分点的高精度,又满足嵌套性质,且在低阶积分配置点上已经得到的门延时可以在高阶积分时重复使用.与现有的基于非嵌套式配置点的随机配置法相比,该方法的计算精度和效率可以得到很大的提升,数值实验结果也验证了该方法在计算精度和效率上的优势. 展开更多
关键词 门延时 工艺偏差 扩展Gauss积分 嵌套式稀疏网格 随机配置法
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XYG3型双杂化密度泛函方法新进展:从能量到能量的解析梯度 被引量:2
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作者 苏乃强 徐昕 《中国科学:化学》 CSCD 北大核心 2013年第12期1761-1779,共19页
本文回顾了现代密度泛函理论的基础,着重评述了XYG3型双杂化(XYG3 type of doubly hybrid,xDH)泛函的最新进展,解析能量梯度的实现.XYG3是首个依照绝热途径理论建立的双杂化泛函,在具体实现上具有独特的构架.该类型泛函利用常用泛函(如B... 本文回顾了现代密度泛函理论的基础,着重评述了XYG3型双杂化(XYG3 type of doubly hybrid,xDH)泛函的最新进展,解析能量梯度的实现.XYG3是首个依照绝热途径理论建立的双杂化泛函,在具体实现上具有独特的构架.该类型泛函利用常用泛函(如B3LYP或PBE0等)作母泛函来进行自洽计算,以期获得更好的密度和轨道,然后将所得到的轨道和密度信息带入到xDH泛函中以得到最终能量.由于自洽泛函和最终能量泛函不同,因而在计算解析能量梯度时需要求解耦合微扰Kohn-Sham方程.在此基础上,还评述了xDH泛函在能量,尤其是构型优化方面的具体表现.测试的构型集包括以共价键键合的分子和非键相互作用体系的平衡结构,以及反应过渡态结构.结果表明,xDH双杂化泛函总体上给出了比母泛函更好的能量和几何构型. 展开更多
关键词 密度泛函 解析能量梯度 几何构型 非键相互作用 过渡态结构 XYG3 xDH PBE0 B3LYP PBE0
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Assessment of Some Density Functional Theory Methods and Force Field Models in Describing Various Interaction Modes of Benzene Dimer 被引量:1
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作者 周余伟 张颖 +2 位作者 吴剑鸣 吴安安 徐昕 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2011年第6期635-639,I0003,共6页
Benzene dimer (bz2) is the simplest prototype of the π-π interactions. Such interactions are ubiquitous in diverse areas of science and molecular engineering. In the present work, we have made assessment on some m... Benzene dimer (bz2) is the simplest prototype of the π-π interactions. Such interactions are ubiquitous in diverse areas of science and molecular engineering. In the present work, we have made assessment on some modern density functional methods including B97-D, BLYP-D3, M06-2X, XYG3, and force field models including CHARMM, AMBER, MM3, AMOEBA on six important interaction modes of bz2. Our results not only highlight the usefulness of these cost-effective methods, which can be used as economic substitutes of the expensive CCSD(T) for complex real-world systems, but also indicate their weakness in the description of the π-π interactions, which points to the future direction for further improvements. 展开更多
关键词 π-π interaction Benzene dimer van der Waals DISPERSION XYG3
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大规模原子模拟软件包(LSASP)程序设计和进展 被引量:1
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作者 刘智攀 商城 《中国科学基金》 CSSCI CSCD 北大核心 2018年第1期95-100,共6页
本文介绍了笔者课题组开发的针对复杂体系精确计算的软件包LSASP,包括核心算法,软件架构以及开发进展。与传统经验力场的程序不同,LSASP软件整合现有的通用电子结构计算软件,提供统一数据接口,以通用型全局势能面神经网络势函数作为主... 本文介绍了笔者课题组开发的针对复杂体系精确计算的软件包LSASP,包括核心算法,软件架构以及开发进展。与传统经验力场的程序不同,LSASP软件整合现有的通用电子结构计算软件,提供统一数据接口,以通用型全局势能面神经网络势函数作为主要势能面计算工具,涵盖全局结构搜索,自动反应路径取样,过渡态寻找,分子动力学,蒙特卡洛模拟等势能面采样功能的大尺度计算平台。LSASP软件的核心算法,随机势能面行走(SSW),具有自有知识产权,在势能面全局搜索,过渡态反应路径搜索,神经网络势函数模拟等方面具有国际竞争力。 展开更多
关键词 势能面 全局优化 反应路径采样 LSASP软件
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机器学习助力发现高效CO2电催化还原Cu-Al合金催化剂 被引量:1
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作者 李晔飞 刘智攀 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第20期2074-2075,共2页
CO2大量排放造成的环境变化已逐渐成为制约现代社会发展的难题.将CO2还原为高附加值化学品(如乙烯)是解决这一问题的有效途径,具有重要的科学意义和应用前景.然而,由于CO2是一个非常惰性的分子,高效还原难度高.实验发现金属Cu可以作为将... CO2大量排放造成的环境变化已逐渐成为制约现代社会发展的难题.将CO2还原为高附加值化学品(如乙烯)是解决这一问题的有效途径,具有重要的科学意义和应用前景.然而,由于CO2是一个非常惰性的分子,高效还原难度高.实验发现金属Cu可以作为将CO2还原为C2物种的催化剂,但是催化选择性和产率都很低,不能满足大规模工业化的要求[1].因此尝试对Cu改性,如形成合金. 展开更多
关键词 CO2还原 催化选择性 大规模工业化 催化剂 金属Cu
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自动化势能面搜索方法新进展 被引量:1
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作者 商城 刘智攀 《中国科学:化学》 CSCD 北大核心 2013年第12期1640-1653,共14页
本文简要介绍了势能面搜索的两个主要问题,即过渡态搜索和全局势能面搜索,并针对这两个问题介绍了本研究组最近发展的3种方法,即限制最小化双子算法、偏置势函数辅助限制性最小化双子算法以及势能面随机行走方法.这3种方法均只需计算一... 本文简要介绍了势能面搜索的两个主要问题,即过渡态搜索和全局势能面搜索,并针对这两个问题介绍了本研究组最近发展的3种方法,即限制最小化双子算法、偏置势函数辅助限制性最小化双子算法以及势能面随机行走方法.这3种方法均只需计算一阶梯度,能够用于快速自动化的搜索过渡态以及势能面.通过几个典型例子分别说明了3种方法的特点及优势. 展开更多
关键词 势能面搜索 过渡态搜索 全局最优化
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固体异质结界面结构预测方法及AutoInterface程序实现
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作者 李晔飞 刘智攀 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2383-2392,共10页
预测材料异质结的界面原子结构对于理解界面对性能的影响至关重要.目前,从理论上预测材料界面结构仍具有极大挑战,主要是缺乏普适有效的理论计算方法.本文介绍了本课题组在异质结界面结构预测方面取得的最新进展.结合马氏体相变唯象理... 预测材料异质结的界面原子结构对于理解界面对性能的影响至关重要.目前,从理论上预测材料界面结构仍具有极大挑战,主要是缺乏普适有效的理论计算方法.本文介绍了本课题组在异质结界面结构预测方面取得的最新进展.结合马氏体相变唯象理论、图论和随机表面行走算法,提出了界面结构的一种有效预测方法,可以实现自动化的计算预测.通过GaP/TiO2半导体异质结等展示了该方法的有效性和在催化等领域的应用前景. 展开更多
关键词 异质结界面结构预测 马氏体相变唯象理论 图论 随机表面行走
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低标度XYG3双杂化密度泛函的开发与测评
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作者 郑若昕 张颖 徐昕 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2210-2217,共8页
以XYG3为代表的双杂化泛函代表了目前密度泛函方法的最高精度,可以胜任复杂化学环境中不同类型的相互作用的精准描述.然而由于XYG3采用二级微扰相关能(PT2)的形式引入未占轨道信息,其计算标度随体系尺寸呈5次方增长,同时内存需求呈4次... 以XYG3为代表的双杂化泛函代表了目前密度泛函方法的最高精度,可以胜任复杂化学环境中不同类型的相互作用的精准描述.然而由于XYG3采用二级微扰相关能(PT2)的形式引入未占轨道信息,其计算标度随体系尺寸呈5次方增长,同时内存需求呈4次方增长,这极大削弱了XYG3方法在复杂大体系研究中的可用性.本文介绍了一种结合局域密度拟合方法(Local Resolution-of-Identity,RI-LVL)与拉普拉斯变换(Laplace Transformation,LT)的低标度算法.采用MPI与OpenMP的混合并行设计,实现了可兼顾计算精度、计算效率和数值稳定性的低标度XYG3(LT-XYG3)计算功能.在一系列水簇及ISOL22测试集的测评中,LT-XYG3有效地降低了双杂化泛函的计算成本与内存消耗,展示了良好的可靠性与应用前景. 展开更多
关键词 密度泛函理论 双杂化密度泛函 密度拟合 低标度算法
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X1se:一种密度泛函和神经网络组合的高效、准确的热化学方法
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作者 吴剑鸣 杨勇 +1 位作者 周余伟 徐昕 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期38-50,共13页
本文介绍一个近期发展的基于神经元网络的校正密度泛函(DFT)计算标准生成焓(?fHo)的方法,即X1se方法.首先,该方法通过B3LYP/6-311+G(d,p)优化构型和计算零点能,采用B3LYP/6-311+G(3df,2p)计算单点能量,由此获得DFT计算的?fHo;接着,将DF... 本文介绍一个近期发展的基于神经元网络的校正密度泛函(DFT)计算标准生成焓(?fHo)的方法,即X1se方法.首先,该方法通过B3LYP/6-311+G(d,p)优化构型和计算零点能,采用B3LYP/6-311+G(3df,2p)计算单点能量,由此获得DFT计算的?fHo;接着,将DFT计算获得的生成焓和零点能,以及分子的各种描述子输入已训练好的神经网络模型,无需额外的计算量,就可获得校正后的生成焓.与本研究组早期发展的X1和X1s方法相比,X1se新增加了环境描述子,因而进一步提高了该系列方法的应用范围和计算精度. 展开更多
关键词 密度泛函 B3LYP 生成焓 热化学 神经网络 X1/X1s
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Cu_2ZnSnS_4类四元硫族半导体的理论研究--以二元、三元、四元半导体的演化为思路 被引量:6
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作者 陈时友 龚新高 +1 位作者 Aron Walsh 魏苏淮 《物理》 CAS 北大核心 2011年第4期248-258,共11页
在过去60多年中,人们对半导体的研究集中在一元、二元和三元半导体方面,最近,出于寻找新型廉价、环保、高效光伏转换材料的需要,Cu2ZnSnS4类Ⅰ2-Ⅱ-Ⅳ- Ⅵ4型四元硫族半导体吸引了人们越来越多的关注,它在光催化和热电等多方面的应用也... 在过去60多年中,人们对半导体的研究集中在一元、二元和三元半导体方面,最近,出于寻找新型廉价、环保、高效光伏转换材料的需要,Cu2ZnSnS4类Ⅰ2-Ⅱ-Ⅳ- Ⅵ4型四元硫族半导体吸引了人们越来越多的关注,它在光催化和热电等多方面的应用也不断被发掘.然而,对于这类四元半导体的基本性质,如晶体结构和电子结构,人们知之甚少,很多研究还停留在经验阶段.文章首先简要回顾了这类半导体的由来和在应用方面的最新进展,然后详细介绍了文章作者对这类四元半导体的第一性原理计算研究工作的进展,其中包括:系统研究了这类硫族半导体在从二元向三元再向四元的演化过程中晶体结构和电子能带结构变化的规律,总结了元素成分对其影响的一般趋势,并结合实验结果分析了这类四元半导体晶格结构表征和带隙测量中易于出现的混淆;文章作者还以Cu2ZnSnS4为例,考察了这类四元化合物相对二元、三元化合物的相稳定性和本征缺陷性质.文章介绍的研究结果将为一系列Ⅰ2-Ⅱ-Ⅳ- Ⅵ4型四元半导体的深入研究提供基础. 展开更多
关键词 Cu2ZnSnS4 四元硫族半导体 晶体结构 电子结构 缺陷 第一性原理计算
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新一代密度泛函方法XYG3 被引量:5
12
作者 张颖 徐昕 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1023-1037,共15页
大量的应用研究测试表明,以B3LYP为代表的传统密度泛函方法在反应能垒以及非键相互作用等重要性质的预测上存在困难,并且预测精度随研究体系的增大而不断变差。开发越来越精确的交换相关泛函是现代密度泛函理论发展的主线。近年来,引入... 大量的应用研究测试表明,以B3LYP为代表的传统密度泛函方法在反应能垒以及非键相互作用等重要性质的预测上存在困难,并且预测精度随研究体系的增大而不断变差。开发越来越精确的交换相关泛函是现代密度泛函理论发展的主线。近年来,引入未占轨道信息的新一代双杂化密度泛函方法的研究受到越来越多的关注。本篇综述回顾了这一领域已取得的一些进展;推导了双杂化泛函方法在Kohn-Sham密度泛函理论框架下的理论基础;依据各自特点,将现已提出的双杂化泛函划分为三种类别。本文着重测评了以XYG3为代表的一类双杂化泛函的表现。最后,就双杂化泛函的未来发展方向,提出了一些设想与建议。 展开更多
关键词 密度泛函理论 双杂化泛函 杂化泛函 Kohn-Sham框架 绝热路径
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中国电子结构理论及其应用领域的发展现状和未来挑战
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作者 徐昕 《科学观察》 2023年第2期9-12,共4页
电子结构理论是从量子力学基本原理出发,研究原子、分子、聚集体、表面以及固体中电子的复杂行为,探讨电子行为与材料物性和功能的关系,揭示复杂化学反应的微观机理的科学。波函数理论和密度泛函理论是电子结构理论的两大基石。一方面,... 电子结构理论是从量子力学基本原理出发,研究原子、分子、聚集体、表面以及固体中电子的复杂行为,探讨电子行为与材料物性和功能的关系,揭示复杂化学反应的微观机理的科学。波函数理论和密度泛函理论是电子结构理论的两大基石。一方面,尽管基于第一性原理的波函数理论方法计算消耗巨大,但其拥有正确而普适地描述电子间不同类型复杂相互作用的能力,提供了可严格逼近电子结构精确解的途径。 展开更多
关键词 密度泛函理论 第一性原理 波函数 量子力学 精确解 材料物性 聚集体 复杂行为
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固液界面光催化裂解水的理论进展 被引量:2
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作者 李晔飞 刘智攀 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第6期957-963,共7页
二氧化钛纳米颗粒作为一种光催化剂,目前已经得到了广泛的应用,但是对于光催化反应的理解,尤其是在原子水平上,还明显不足,如TiO2纳米颗粒的几何结构与光催化反应活性的构效关系。本文主要介绍了我们课题组在TiO2裂解水的一些理论研究... 二氧化钛纳米颗粒作为一种光催化剂,目前已经得到了广泛的应用,但是对于光催化反应的理解,尤其是在原子水平上,还明显不足,如TiO2纳米颗粒的几何结构与光催化反应活性的构效关系。本文主要介绍了我们课题组在TiO2裂解水的一些理论研究进展。通过周期性密度泛函以及周期性连续介质模型的理论计算,我们研究了水析氧反应(OER)的机理,得出了反应的决速步骤是失去第一个质子的过程,同时研究了不同纳米颗粒对该决速步骤的影响。研究指出,TiO2纳米颗粒的热力学平衡构型在1—30nm内会受到其颗粒尺寸的显著影响;尖的TiO2纳米颗粒比扁的颗粒具有更高的OER反应活性。综合以上两个因素,最终导致了光催化反应的形态依赖性。 展开更多
关键词 光催化 二氧化钛 形貌
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