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以生物合成为基础的红霉素A的产量提高和结构改造
被引量：
4
1
作者
陈单丹
吴杰群
刘文
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期939-954,共16页
红霉素A是一种广谱大环内酯类抗生素,在临床上应用广泛。其生物合成包括由聚酮合酶催化的十四元环骨架形成,以及羟基化、糖基化、甲基化后修饰。基于对红霉素A生物合成机制的认识,可以对产生菌种进行定向的遗传操作,达到产量提高和结构...
红霉素A是一种广谱大环内酯类抗生素,在临床上应用广泛。其生物合成包括由聚酮合酶催化的十四元环骨架形成,以及羟基化、糖基化、甲基化后修饰。基于对红霉素A生物合成机制的认识,可以对产生菌种进行定向的遗传操作,达到产量提高和结构改造等目的。本文综述了近年来在红霉素A高产菌株改造和化学结构衍生方面所取得的研究进展,为相关研究人员提供参考。
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关键词
红霉素
生物合成
产量提高
结构改造
原文传递
CRISPR/Cas9基因编辑系统在获取放线菌天然产物中的应用
被引量：
2
2
作者
乔怡
张庆林
+2 位作者
陈单丹
刘美娜
刘文
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期4279-4288,共10页
作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性...
作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性的遗传改造.规律性成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白(CRISPR/Cas)是部分细菌和古细菌在长期自然进化过程中发展而来的一种对抗外源遗传物质入侵的适应性免疫防御系统.以CRISPR/Cas9为代表的基因编辑系统已被广泛应用于脱氧核糖核酸(DNA)片段的靶向特异性切割,为生物技术领域的发展提供了无限可能.综述了CRISPR/Cas9系统在放线菌遗传改造中的应用情况,包括在基因簇抓取、编辑与重构、原位同源重组以及代谢调控方面的研究进展,涉及全新的CRISPR/Cas9介导的基因编辑方法以及代表性的成功案例,为高效利用CRISPR/Cas9系统获取放线菌天然产物提供了借鉴.
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关键词
放线菌
天然产物
生物合成基因簇
基因编辑
规律性间成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)
原文传递
植物来源的二萜化合物的生物合成研究
被引量：
4
3
作者
益萱
贺庆利
刘文
《生命科学》
CSCD
北大核心
2019年第5期458-472,共15页
二萜化合物广泛地存在于动物、植物和微生物中。由于其化学结构多样性和良好的生物活性,越来越多的二萜类化合物作为药物走进大众的视野,并受到越来越多的科学工作者的关注。绝大多数的二萜化合物来源于植物,但是随着植物药材的长期开发...
二萜化合物广泛地存在于动物、植物和微生物中。由于其化学结构多样性和良好的生物活性,越来越多的二萜类化合物作为药物走进大众的视野,并受到越来越多的科学工作者的关注。绝大多数的二萜化合物来源于植物,但是随着植物药材的长期开发,野生植物药材资源日益减少,人工种植植物药材品质日渐退化,而揭示其中关键活性成分的生物合成机制,以合成生物学的策略改造的微生物作为"细胞工厂",是解决上述问题的重要手段。该文主要以二萜合酶为线索,概述了植物来源的二萜类化合物的生物合成研究进展,探究二萜化合物结构的多样性及其生物合成研究的前景和发展趋势。
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关键词
二萜化合物
二萜合酶
天然产物
生物合成途径
原文传递
吡咯吲哚霉素生物合成途径中酶促Diels-Alder反应的生化机制研究
4
作者
郑庆飞
刘文
《中国科学基金》
CSSCI
CSCD
北大核心
2016年第6期501-504,共4页
Diels—Alder（D—A）反应是一类能够直接形成C—C键的重要有机反应类型，可以高效地构筑杂环、手性螺环和桥环等复杂结构，广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D—A反应还被开发为“点击化学”（clickchemistry）和“生物正交...
Diels—Alder（D—A）反应是一类能够直接形成C—C键的重要有机反应类型，可以高效地构筑杂环、手性螺环和桥环等复杂结构，广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D—A反应还被开发为“点击化学”（clickchemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonalchemistry），并应用于材料科学和生命科学的研究中。
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关键词
Diels—Alder反应
酶促反应
生物合成
吡咯吲哚霉素
协同反应
过渡态
原文传递
题名
以生物合成为基础的红霉素A的产量提高和结构改造
被引量：
4
1
作者
陈单丹
吴杰群
刘文
机构
中国科学院上海有机化学研究所
湖州
生物
制造
创新
中心
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期939-954,共16页
基金
国家自然科学基金(Nos.81302674
31430005
+1 种基金
91213303
91413101)资助~~
文摘
红霉素A是一种广谱大环内酯类抗生素,在临床上应用广泛。其生物合成包括由聚酮合酶催化的十四元环骨架形成,以及羟基化、糖基化、甲基化后修饰。基于对红霉素A生物合成机制的认识,可以对产生菌种进行定向的遗传操作,达到产量提高和结构改造等目的。本文综述了近年来在红霉素A高产菌株改造和化学结构衍生方面所取得的研究进展,为相关研究人员提供参考。
关键词
红霉素
生物合成
产量提高
结构改造
Keywords
erythromycin
biosynthesis
production improvement
structure modification
分类号
TQ465 [化学工程—制药化工]
原文传递
题名
CRISPR/Cas9基因编辑系统在获取放线菌天然产物中的应用
被引量：
2
2
作者
乔怡
张庆林
陈单丹
刘美娜
刘文
机构
上海应用技术大学化学与环境工程学院
中国科学院上海有机化学研究所
中国科学院上海有机化学研究所
出处
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期4279-4288,共10页
基金
国家自然科学基金(Nos.21977109,32030002,21750004)
国家重点研发计划(No.2019YFA0905400)
+1 种基金
中国科学院战略性先导科技专项(No.XDB20020200)
中国科学院青年创新促进会(No.2017303)资助项目.
文摘
作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性的遗传改造.规律性成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白(CRISPR/Cas)是部分细菌和古细菌在长期自然进化过程中发展而来的一种对抗外源遗传物质入侵的适应性免疫防御系统.以CRISPR/Cas9为代表的基因编辑系统已被广泛应用于脱氧核糖核酸(DNA)片段的靶向特异性切割,为生物技术领域的发展提供了无限可能.综述了CRISPR/Cas9系统在放线菌遗传改造中的应用情况,包括在基因簇抓取、编辑与重构、原位同源重组以及代谢调控方面的研究进展,涉及全新的CRISPR/Cas9介导的基因编辑方法以及代表性的成功案例,为高效利用CRISPR/Cas9系统获取放线菌天然产物提供了借鉴.
关键词
放线菌
天然产物
生物合成基因簇
基因编辑
规律性间成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)
Keywords
actinomycetes
natural products
biosynthetic gene clusters
gene editing
the clustered regularly interspaced short palindromic repeats and the associated protein 9(CRISPR/Cas9)
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
植物来源的二萜化合物的生物合成研究
被引量：
4
3
作者
益萱
贺庆利
刘文
机构
上海大学化学系
上海中医药大学
创新
中药研究院
中国科学院上海有机化学研究所
湖州
生物
制造
创新
中心
出处
《生命科学》
CSCD
北大核心
2019年第5期458-472,共15页
基金
国家自然科学基金项目(21520102004,31430005)
上海市科委项目(14JC1407700)
文摘
二萜化合物广泛地存在于动物、植物和微生物中。由于其化学结构多样性和良好的生物活性,越来越多的二萜类化合物作为药物走进大众的视野,并受到越来越多的科学工作者的关注。绝大多数的二萜化合物来源于植物,但是随着植物药材的长期开发,野生植物药材资源日益减少,人工种植植物药材品质日渐退化,而揭示其中关键活性成分的生物合成机制,以合成生物学的策略改造的微生物作为"细胞工厂",是解决上述问题的重要手段。该文主要以二萜合酶为线索,概述了植物来源的二萜类化合物的生物合成研究进展,探究二萜化合物结构的多样性及其生物合成研究的前景和发展趋势。
关键词
二萜化合物
二萜合酶
天然产物
生物合成途径
Keywords
diterpenoids
diterpene synthase
nature products
biosynthetic pathway
分类号
Q629 [生物学—生物物理学]
Q81
原文传递
题名
吡咯吲哚霉素生物合成途径中酶促Diels-Alder反应的生化机制研究
4
作者
郑庆飞
刘文
机构
中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室
湖州
生物
制造
创新
中心
出处
《中国科学基金》
CSSCI
CSCD
北大核心
2016年第6期501-504,共4页
基金
国家自然科学基金(项目批准号:31430005
21520102004
+3 种基金
31300064)
科技部(项目批准号:2012AA02A706)
上海市科委(项目批准号:14JC1407700
15JC1400400)的资助
文摘
Diels—Alder（D—A）反应是一类能够直接形成C—C键的重要有机反应类型，可以高效地构筑杂环、手性螺环和桥环等复杂结构，广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D—A反应还被开发为“点击化学”（clickchemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonalchemistry），并应用于材料科学和生命科学的研究中。
关键词
Diels—Alder反应
酶促反应
生物合成
吡咯吲哚霉素
协同反应
过渡态
Keywords
Diels-Alder reaction
enzymatic reaction
biosynthesis
pyrroindomycin
concerted reaction
transition state
分类号
R914.5 [医药卫生—药物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
以生物合成为基础的红霉素A的产量提高和结构改造
陈单丹
吴杰群
刘文
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
原文传递
2
CRISPR/Cas9基因编辑系统在获取放线菌天然产物中的应用
乔怡
张庆林
陈单丹
刘美娜
刘文
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
原文传递
3
植物来源的二萜化合物的生物合成研究
益萱
贺庆利
刘文
《生命科学》
CSCD
北大核心
2019
4
原文传递
4
吡咯吲哚霉素生物合成途径中酶促Diels-Alder反应的生化机制研究
郑庆飞
刘文
《中国科学基金》
CSSCI
CSCD
北大核心
2016
0
原文传递
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