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题名当阳鱼腥草花叶病病原分子鉴定
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作者
周洁
吴方华
燕飞
齐传东
郭凤领
吴金平
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机构
湖北省农业科学院经济作物研究所·农业农村部高山蔬菜生态栽培重点实验室·湖北省蔬菜种质创新与遗传改良重点实验室
湖北省当阳市两河镇农业服务中心
宁波大学植物病毒学研究所
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出处
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024年第9期54-58,共5页
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基金
湖北省农业科技创新中心项目(2021-620-000-001-007)
国家特色蔬菜产业技术体系(CARS-24-G-17)。
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文摘
明确当阳鱼腥草花叶病致病菌种类,为当阳鱼腥草花叶病的田间防治提供依据。采集鱼腥草花叶叶片提取当阳鱼腥草典型病样的总RNA,利用sRNA深度测序,结合生物信息学分析初步确定病原菌,利用该病毒外壳蛋白(CP)特异性引物进行RT-PCR检测,所得序列进行BLAST比对和系统进化树构建,以进一步确定病原菌种类。利用sRNA深度测序和生物信息学初步确定鱼腥草花叶病致病菌为黄瓜花叶病毒(CMV),特异性引物扩增得到878 bp特异性条带,经BLAST比对发现其与已发表的CMV序列高度同源,相似性最高达97.84%。通过CMV病毒CP基因的核苷酸序列构建系统进化树可得鱼腥草花叶病病毒属于CMV亚组Ⅱ。引起鱼腥草花叶病的病原属于黄瓜花叶病毒Ⅱ亚组,研究结果为鱼腥草花叶病防治提供了理论基础。
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关键词
鱼腥草
黄瓜花叶病毒
sRNA深度测序
RT-PCR
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Keywords
Houttuynia cordata
Cucumber mosaic virus
sRNA sequencing
RT-PCR
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分类号
S649
[农业科学—蔬菜学]
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