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探索细胞的“脚步”:黏着斑的动态结构
被引量:
1
1
作者
余聪
魏志毅
《生命的化学》
CAS
2023年第7期975-986,共12页
黏着斑是细胞与细胞外基质之间重要的黏附结构,对于细胞黏附、信号传导和细胞迁移起着重要作用。通过感知外界机械力并将其转化为细胞内信号,黏着斑使细胞能够感知和响应环境变化,其结构也在发生动态变化,如同人类行走的“脚步”。深入...
黏着斑是细胞与细胞外基质之间重要的黏附结构,对于细胞黏附、信号传导和细胞迁移起着重要作用。通过感知外界机械力并将其转化为细胞内信号,黏着斑使细胞能够感知和响应环境变化,其结构也在发生动态变化,如同人类行走的“脚步”。深入了解黏着斑的结构和功能,对于揭示细胞生理和病理过程具有重要意义。本文概述了黏着斑结构与功能的最新研究进展,着眼于黏着斑动态结构变化中蛋白-蛋白相互作用、机械力以及液-液相分离的调控,同时也对黏着斑研究领域中未来的研究方法和研究内容进行了展望。
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关键词
整合素
液-液相分离
蛋白-蛋白相互作用
细胞骨架
细胞黏附
细胞微环境
原文传递
基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
2
作者
唐君
郭凯珠
+5 位作者
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1263-1269,共7页
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清...
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清白蛋白(BSA),吸附容量是商品化磁珠的10倍左右。以BSA作为标准蛋白质,对所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子作为蛋白质组学反应器的酶解时间进行了优化,发现Fe_3O_4/EDTA磁性粒子处理BSA酶解1、8和16 h的肽段序列覆盖率和特征肽段结果相当。因此,可以将复杂的蛋白质样品前处理时间缩短至2 h内。最后,将所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子应用于血清的蛋白质组学研究,成功地鉴定出218种蛋白质,其中包含了41种美国食品药品管理局(FDA)认证的生物标志物。所发展的基于Fe_3O_4/EDTA磁性粒子的蛋白质组学样品前处理方法将蛋白质样品预富集、还原、烷基化、酶解、多肽除盐和洗脱等步骤集成到一起,减少了样品转移和处理所造成的损失。这种技术具有快速、灵敏和易于操作的特点,可用于临床蛋白质组学研究。
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关键词
Fe3O4/乙二胺四乙酸(Fe3O4/EDTA)
磁性粒子
蛋白质组学
样品前处理
下载PDF
职称材料
色谱与质谱联用技术在蛋白质翻译后修饰研究中的进展及应用
被引量:
12
3
作者
林琳
罗树生
+3 位作者
王灵珏
杨杰
沈海南
田瑞军
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期1479-1489,共11页
蛋白质翻译后修饰是调控各种细胞信号通路和细胞命运最为关键的分子机制之一。在分子水平上,蛋白质翻译后修饰的"写入"、"擦除"和"识别"是实现其动态调控功能的核心过程,均属于生物分析化学的研究范畴。...
蛋白质翻译后修饰是调控各种细胞信号通路和细胞命运最为关键的分子机制之一。在分子水平上,蛋白质翻译后修饰的"写入"、"擦除"和"识别"是实现其动态调控功能的核心过程,均属于生物分析化学的研究范畴。基于液相色谱与生物质谱联用的蛋白质组学技术经历了近十年的高速发展,已成为系统水平上表征各种蛋白质翻译后修饰的标准方法。本文综述了蛋白质翻译后修饰分析相关的关键技术和方法进展,主要包括:各种翻译后修饰蛋白质和多肽的富集方法、基于高效液相色谱的多维分离方法和各种生物质谱鉴定方法,并重点阐述了近年来的新的发展方向。基于相关技术的快速发展和大规模鉴定数据的产生,本文重点介绍了5种具有重要生物学功能的蛋白质翻译后修饰,包括:磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化和甲基化。生物分析化学领域的方法和技术创新必将进一步促进对蛋白质翻译后修饰的系统水平研究的发展。
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关键词
蛋白质翻译后修饰
蛋白质组学
质谱
综述
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职称材料
题名
探索细胞的“脚步”:黏着斑的动态结构
被引量:
1
1
作者
余聪
魏志毅
机构
南方科技大学生命科学学院
广东省
细胞
微
环境
与疾病研究
重点
实验室
出处
《生命的化学》
CAS
2023年第7期975-986,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31500621,31870757,32170697)
深圳市科技创新委员会项目(JCYJ20200109141241950,ZDSYS20140509142721429)。
文摘
黏着斑是细胞与细胞外基质之间重要的黏附结构,对于细胞黏附、信号传导和细胞迁移起着重要作用。通过感知外界机械力并将其转化为细胞内信号,黏着斑使细胞能够感知和响应环境变化,其结构也在发生动态变化,如同人类行走的“脚步”。深入了解黏着斑的结构和功能,对于揭示细胞生理和病理过程具有重要意义。本文概述了黏着斑结构与功能的最新研究进展,着眼于黏着斑动态结构变化中蛋白-蛋白相互作用、机械力以及液-液相分离的调控,同时也对黏着斑研究领域中未来的研究方法和研究内容进行了展望。
关键词
整合素
液-液相分离
蛋白-蛋白相互作用
细胞骨架
细胞黏附
细胞微环境
Keywords
integrin
liquid-liquid phase separation
protein-protein interaction
cytoskeleton
cell adhesion
cell microenvironment
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
原文传递
题名
基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
2
作者
唐君
郭凯珠
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
机构
深圳市
人民医院肿瘤研究所
南方科技大学化学系
暨南大学基础医学院病理生理学系
西南交通大学生命科学与工程学院
深圳市
细胞
微
环境
重点
实验室
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1263-1269,共7页
基金
国家自然科学基金项目(21575057)
深圳市科技计划项目(JCYJ20150901153557178
JSGG20160301103415523)~~
文摘
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清白蛋白(BSA),吸附容量是商品化磁珠的10倍左右。以BSA作为标准蛋白质,对所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子作为蛋白质组学反应器的酶解时间进行了优化,发现Fe_3O_4/EDTA磁性粒子处理BSA酶解1、8和16 h的肽段序列覆盖率和特征肽段结果相当。因此,可以将复杂的蛋白质样品前处理时间缩短至2 h内。最后,将所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子应用于血清的蛋白质组学研究,成功地鉴定出218种蛋白质,其中包含了41种美国食品药品管理局(FDA)认证的生物标志物。所发展的基于Fe_3O_4/EDTA磁性粒子的蛋白质组学样品前处理方法将蛋白质样品预富集、还原、烷基化、酶解、多肽除盐和洗脱等步骤集成到一起,减少了样品转移和处理所造成的损失。这种技术具有快速、灵敏和易于操作的特点,可用于临床蛋白质组学研究。
关键词
Fe3O4/乙二胺四乙酸(Fe3O4/EDTA)
磁性粒子
蛋白质组学
样品前处理
Keywords
Fe3O4/EDTA ( ethylenediaminetetraacetic acid)
magnetic beads
proteomics
sample preparation
分类号
O658 [理学—分析化学]
下载PDF
职称材料
题名
色谱与质谱联用技术在蛋白质翻译后修饰研究中的进展及应用
被引量:
12
3
作者
林琳
罗树生
王灵珏
杨杰
沈海南
田瑞军
机构
南方科技大学化学系
南方科技大学分析测试中心
南方科技大学
深圳市
细胞
微
环境
重点
实验室
出处
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期1479-1489,共11页
基金
南方科技大学启动经费
教育部留学回国人员科研启动基金(No.K15211203)资助
文摘
蛋白质翻译后修饰是调控各种细胞信号通路和细胞命运最为关键的分子机制之一。在分子水平上,蛋白质翻译后修饰的"写入"、"擦除"和"识别"是实现其动态调控功能的核心过程,均属于生物分析化学的研究范畴。基于液相色谱与生物质谱联用的蛋白质组学技术经历了近十年的高速发展,已成为系统水平上表征各种蛋白质翻译后修饰的标准方法。本文综述了蛋白质翻译后修饰分析相关的关键技术和方法进展,主要包括:各种翻译后修饰蛋白质和多肽的富集方法、基于高效液相色谱的多维分离方法和各种生物质谱鉴定方法,并重点阐述了近年来的新的发展方向。基于相关技术的快速发展和大规模鉴定数据的产生,本文重点介绍了5种具有重要生物学功能的蛋白质翻译后修饰,包括:磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化和甲基化。生物分析化学领域的方法和技术创新必将进一步促进对蛋白质翻译后修饰的系统水平研究的发展。
关键词
蛋白质翻译后修饰
蛋白质组学
质谱
综述
Keywords
Post translational modification
Proteomics
Mass spectrometry
Review
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
O657.63 [理学—分析化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
探索细胞的“脚步”:黏着斑的动态结构
余聪
魏志毅
《生命的化学》
CAS
2023
1
原文传递
2
基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
唐君
郭凯珠
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
3
色谱与质谱联用技术在蛋白质翻译后修饰研究中的进展及应用
林琳
罗树生
王灵珏
杨杰
沈海南
田瑞军
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
12
下载PDF
职称材料
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