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应用高通量测序技术对进境澳大利亚小麦病原真菌的检测研究 被引量:4
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作者 史亚千 程颖慧 +7 位作者 王颖 高瑞芳 汪莹 向才玉 冯建军 娄定风 王红英 朱崧琪 《植物检疫》 北大核心 2017年第1期26-31,共6页
相比较其他检测技术,高通量测序技术具有高效、快速等特点,并拥有全面分析复杂核苷酸群体的功能,本文运用高通量测序技术对进境澳大利亚4批次小麦种子和筛下物上的病原真菌进行检测,通过基因组DNA提取、高通量测序、生物信息学分析后得... 相比较其他检测技术,高通量测序技术具有高效、快速等特点,并拥有全面分析复杂核苷酸群体的功能,本文运用高通量测序技术对进境澳大利亚4批次小麦种子和筛下物上的病原真菌进行检测,通过基因组DNA提取、高通量测序、生物信息学分析后得到分类OTU共622个,基于不同分类水平,分属于5个门、64个目、201个属。检测显示,种子与筛下物携带的病原真菌的种类和比例有较大差异,并且筛下物携带的病原真菌数量和种类远多于种子携带的病原真菌。 展开更多
关键词 高通量测序 小麦病原真菌 检测
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高通量测序技术在进境小麦病原微生物检测上的应用前景 被引量:4
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作者 史亚千 高瑞芳 +4 位作者 王颖 章桂明 潘广 汪莹 程颖慧 《植物检疫》 北大核心 2016年第3期9-11,共3页
我国是最大的小麦进口国,小麦上携带的病原微生物通过贸易方式传入我国会对我国的农业生产安全带来很大的风险。本文介绍了高通量检测技术在进境小麦病原微生物检测中的应用前景,相比较其他检测技术,高通量检测技术具有高效、快速并全... 我国是最大的小麦进口国,小麦上携带的病原微生物通过贸易方式传入我国会对我国的农业生产安全带来很大的风险。本文介绍了高通量检测技术在进境小麦病原微生物检测中的应用前景,相比较其他检测技术,高通量检测技术具有高效、快速并全面分析复杂的核苷酸群体的功能,随着测序成本不断降低,高通量测序将成为一项常规的实验手段,在进境小麦病原微生物多样性研究中发挥重要作用。 展开更多
关键词 高通量测序 小麦病原微生物 微生物多样性 检测
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PMA结合实时荧光PCR进行玉米细菌性枯萎病菌细胞活性检测初步研究 被引量:10
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作者 冯建军 刘杰 +4 位作者 王飞 李秋枫 刘新娇 李一农 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2014年第2期27-32,共6页
本文将DNA染料PMA选择渗透性和实时荧光PCR特异性相结合,建立了一种快速灵敏检测玉米细菌性枯萎病菌细胞活性的新方法。结果表明,当菌悬液浓度不高于104 CFU/mL时,终浓度为1μg/mL或更高PMA渗透处理后,可以完全抑制死菌DNA的扩增,而活菌... 本文将DNA染料PMA选择渗透性和实时荧光PCR特异性相结合,建立了一种快速灵敏检测玉米细菌性枯萎病菌细胞活性的新方法。结果表明,当菌悬液浓度不高于104 CFU/mL时,终浓度为1μg/mL或更高PMA渗透处理后,可以完全抑制死菌DNA的扩增,而活菌DNA的实时荧光PCR检测仍有荧光信号;当菌悬液浓度为105 CFU/mL时,20μg/mL的PMA也可以完全抑制死细胞DNA扩增。该方法能有效区分玉米细菌性枯萎病菌死活细胞,并有助于监测玉米种子中该病菌的活性。 展开更多
关键词 叠氮碘化丙锭 玉米细菌性枯萎病 TAQMAN探针 活性
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MALDI-TOF质谱技术鉴定植物病原体研究进展 被引量:8
4
作者 冯建军 龙海 +4 位作者 刘新娇 李秋枫 刘杰 陈冬美 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2014年第6期13-18,共6页
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术具有快速和高通量特点,适合分析微量蛋白质、多肽、多糖和核酸,该技术已在生命科学领域广泛应用。本文综述了MALDI-TOF MS技术原理以及近年来在植物病原真菌和细菌鉴定方面的研究进... 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术具有快速和高通量特点,适合分析微量蛋白质、多肽、多糖和核酸,该技术已在生命科学领域广泛应用。本文综述了MALDI-TOF MS技术原理以及近年来在植物病原真菌和细菌鉴定方面的研究进展。MALDI-TOF MS作为一种简便和快捷的检测技术,必将在植物病原菌鉴定领域发挥更大的作用。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 植物病原菌 鉴定
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基于锁式探针技术的菜豆晕疫病菌检测技术研究 被引量:4
5
作者 李志锋 王忠文 +4 位作者 冯建军 郑耘 王颖 李一农 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2016年第2期63-68,共6页
根据菜豆晕疫病菌的一段特异促旋酶亚组B(gyr B)基因序列,设计锁式探针和扩增引物,优化体系反应条件,建立了基于锁式探针菜豆晕疫病菌滚环扩增特异性检测体系。试验结果表明该检测体系能够从供试菌株中特异性检测出菜豆晕疫病菌。该... 根据菜豆晕疫病菌的一段特异促旋酶亚组B(gyr B)基因序列,设计锁式探针和扩增引物,优化体系反应条件,建立了基于锁式探针菜豆晕疫病菌滚环扩增特异性检测体系。试验结果表明该检测体系能够从供试菌株中特异性检测出菜豆晕疫病菌。该体系检测DNA的阈值为600 fg/μL,与传统PCR相当;检测菌悬液检测阈值1.3×10~3 cfu/m L,比传统PCR高10倍,在模拟样品检测中也显示了更适合于样品的检测。 展开更多
关键词 菜豆晕疫病菌 锁式探针 滚环扩增 检测
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多重PCR-DHPLC法检测转基因棉花品系 被引量:4
6
作者 向才玉 凌杏园 +6 位作者 潘广 康林 陈冬美 李秋枫 刘新娇 欧阳辉 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2015年第1期37-41,共5页
根据3种转基因棉花品系的边界序列设计品系检测引物,建立了一种特异性检测转基因棉花品系MON531、MON1445和MON15985的多重PCR-DHPLC方法。以20种不同的转基因及非转基因作物DNA验证该方法的特异性,结果只有MON531、MON15985和MON1445... 根据3种转基因棉花品系的边界序列设计品系检测引物,建立了一种特异性检测转基因棉花品系MON531、MON1445和MON15985的多重PCR-DHPLC方法。以20种不同的转基因及非转基因作物DNA验证该方法的特异性,结果只有MON531、MON15985和MON1445有特异的品系扩增片段峰,而其他转基因和非转基因作物无品系扩增片段峰,表明该方法特异性强。灵敏度实验结果表明3种转基因棉花的检测下限均为1 ng,灵敏度高。建立的方法可用于转基因棉花MON531、MON1445和MON15985品系及含有其成分产品的筛查或定性检测。 展开更多
关键词 转基因棉花 多重PCR DHPLC 检测
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轮枝菌的检测与鉴定研究进展 被引量:4
7
作者 陶杰 程颖慧 +1 位作者 章桂明 王颖 《植物检疫》 北大核心 2012年第6期64-68,共5页
轮枝菌是一类分布广、适应性强的常见真菌,其中一些种类为重要植物病原菌,个别种类属于国内外重要检疫性真菌,本文从比较形态学、酯酶同工酶、血清学、分子生物学、基质辅助激光解吸电离等方面综述了轮枝菌检测与鉴定的研究进展,可为该... 轮枝菌是一类分布广、适应性强的常见真菌,其中一些种类为重要植物病原菌,个别种类属于国内外重要检疫性真菌,本文从比较形态学、酯酶同工酶、血清学、分子生物学、基质辅助激光解吸电离等方面综述了轮枝菌检测与鉴定的研究进展,可为该菌的检测与鉴定研究提供理论依据。 展开更多
关键词 轮枝菌 检测 鉴定 研究进展
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实时荧光PCR方法快速检测3种重要火蚁 被引量:4
8
作者 徐浪 余道坚 +5 位作者 陈志粦 焦懿 娄定风 向才玉 胡运发 王红英 《植物检疫》 北大核心 2013年第4期65-68,共4页
火蚁属(Solenopsis)是一类具有重要经济意义的害虫,其中红火蚁(S.invicta Buren)和黑火蚁(S.richteri Forel)为国际上关注的检疫性害虫。在本研究中,利用mt DNA COI基因设计了3组特异性引物探针,应用实时荧光PCR方法实现了对红火蚁、黑... 火蚁属(Solenopsis)是一类具有重要经济意义的害虫,其中红火蚁(S.invicta Buren)和黑火蚁(S.richteri Forel)为国际上关注的检疫性害虫。在本研究中,利用mt DNA COI基因设计了3组特异性引物探针,应用实时荧光PCR方法实现了对红火蚁、黑火蚁及近似种热带火蚁的快速准确鉴定。 展开更多
关键词 红火蚁 黑火蚁 热带火蚁 实时荧光PCR 检测
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水稻细菌性谷枯病研究进展 被引量:3
9
作者 龙海 李芳荣 +1 位作者 冯建军 李一农 《中国植保导刊》 北大核心 2015年第7期73-78,共6页
水稻细菌性谷枯病病菌是我国进境植物检疫性细菌,由其引起的水稻细菌性谷枯病是水稻上的重要病害,在热带和亚热带的水稻产区发生严重。本文综述了该病菌的分类、生理特征、寄主、致病机理及病害症状与防病措施等方面的研究进展。了解水... 水稻细菌性谷枯病病菌是我国进境植物检疫性细菌,由其引起的水稻细菌性谷枯病是水稻上的重要病害,在热带和亚热带的水稻产区发生严重。本文综述了该病菌的分类、生理特征、寄主、致病机理及病害症状与防病措施等方面的研究进展。了解水稻细菌性谷枯病病菌的致病机理以及水稻对该病的防卫机制有利于制定更有效的防治策略。 展开更多
关键词 细菌性谷枯病 毒黄菌素 脂酶 防治
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豆类重要植物病原细菌检测研究进展 被引量:2
10
作者 李志锋 王忠文 +4 位作者 冯建军 吴绍精 娄定风 王红英 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2015年第6期7-15,共9页
随着全球经济一体化的推进,豆类种子及其他植物产品的国际贸易越来越广泛,尤其是我国进口大豆量的迅猛增加,有害生物的跨境传播风险也随之增大。本文简要介绍了豆类上6种重要植物细菌病害及其危害特征,综述了分离培养技术、生理生化技... 随着全球经济一体化的推进,豆类种子及其他植物产品的国际贸易越来越广泛,尤其是我国进口大豆量的迅猛增加,有害生物的跨境传播风险也随之增大。本文简要介绍了豆类上6种重要植物细菌病害及其危害特征,综述了分离培养技术、生理生化技术等传统检测方法和血清学技术以及普通PCR、实时荧光PCR等现代分子生物学检测技术在豆类重要植物病原细菌检测上的应用,并对其优缺点加以分析。在此基础上,对高通量检测方法的应用前景进行展望。 展开更多
关键词 植物病原细菌 豆科作物 检测
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影响全球食品安全的植物线虫综述 被引量:2
11
作者 龙海 齐小峰 +2 位作者 谢泳桂 李一农 李芳荣 《中国植保导刊》 北大核心 2017年第12期78-83,共6页
线虫病害已严重威胁到全球食品安全。在众多的植物线虫中,有些种类分布范围广,造成的经济损失巨大。根据对农林业生产造成危害的严重程度,列举10个种类的植物线虫,对其分布、寄主范围、为害、致病机制等进行了综述。
关键词 植物线虫 为害 食品安全 检疫 防控
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植物隔离检疫温室相关标准的气密性要求比较与探讨 被引量:2
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作者 郑耘 卢小雨 +8 位作者 冯建军 张伟锋 张雪颖 康林 李芳荣 龙海 李一农 王红英 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2012年第6期61-64,共4页
气密性是实验室生物安全的核心要求,是实现隔离检疫功能,防止有害生物发生逃逸的重要技术保证。为此,我国颁布的国家强制性标准《实验室生物安全通用要求》对医学体外和动物活体操作实验室的气密性要求做出了具体的规定。本文介绍了《... 气密性是实验室生物安全的核心要求,是实现隔离检疫功能,防止有害生物发生逃逸的重要技术保证。为此,我国颁布的国家强制性标准《实验室生物安全通用要求》对医学体外和动物活体操作实验室的气密性要求做出了具体的规定。本文介绍了《实验室生物安全通用要求》中气密性要求的主要内容和技术指标,并将其与多个植物隔离检疫温室标准和文献中的气密性要求进行比较,建议根据植物隔离检疫试验对象的特点,对植物隔离检疫温室的布局、设施设备和技术指标进行调整和补充,以利于植物隔离检疫温室的建设和管理。 展开更多
关键词 植物隔离检疫温室 标准 气密性
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MALDI-TOF质谱技术检测豆类作物病原细菌 被引量:2
13
作者 冯建军 龙海 +3 位作者 李志锋 吴绍精 李一农 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2015年第4期31-37,共7页
本文通过基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术分析豆类作物上7种主要病原细菌,建立了MALDI-TOF MS分析方法。结果表明:构建的MALDI-TOF质谱检测数据库可以快速、准确地区分和鉴定该作物上的主要病原菌。该分析方法... 本文通过基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术分析豆类作物上7种主要病原细菌,建立了MALDI-TOF MS分析方法。结果表明:构建的MALDI-TOF质谱检测数据库可以快速、准确地区分和鉴定该作物上的主要病原菌。该分析方法具有属特异性和致病变种特异性,可用于豆类作物主要病原细菌的检测。 展开更多
关键词 MALDI-TOF MS 植物病原细菌 豆类 检测
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根结线虫多样性研究进展 被引量:2
14
作者 龙海 李芳荣 +2 位作者 程颖慧 谢泳桂 李一农 《中国植保导刊》 北大核心 2016年第2期22-26,53,共6页
根结线虫属(Meloidogyne spp.)是专性内寄生物,寄主范围广,全球分布,给世界农业生产造成严重为害。生殖方式主要有孤雌生殖和两性融合。系统发育学研究指出,种间杂交可能在根结线虫多样化的进程中起着重要作用。越来越多的证据表明,基... 根结线虫属(Meloidogyne spp.)是专性内寄生物,寄主范围广,全球分布,给世界农业生产造成严重为害。生殖方式主要有孤雌生殖和两性融合。系统发育学研究指出,种间杂交可能在根结线虫多样化的进程中起着重要作用。越来越多的证据表明,基因组范围内的序列重复和水平基因转移为根结线虫的多样性提供了遗传基础。南方根结线虫(Meloidogyne incognita)和北方根结线虫(Meloidogyne hapla)基因组测序的完成和注释也为研究根结线虫的多样性提供了重要线索。根结线虫的多样性给鉴定和防治工作带来了巨大挑战,需要寻找更加有效的方法。 展开更多
关键词 多样性 基因组重复 水平基因转移 鉴定 防治
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一种重要的植物病原细菌——大黄欧文氏菌 被引量:1
15
作者 冯建军 李一农 +2 位作者 王飞 郑耘 章桂明 《植物检疫》 北大核心 2013年第1期61-63,共3页
大黄欧文氏菌是一种重要的种传植物病原细菌,影响豌豆的品质而降低其商业价值。本文介绍了大黄欧文氏菌的地理分布、寄主范围、生理生化特性、危害症状、发病规律以及防治等内容。该病菌寄主范围广、中国未见分布报道,深入了解该病菌对... 大黄欧文氏菌是一种重要的种传植物病原细菌,影响豌豆的品质而降低其商业价值。本文介绍了大黄欧文氏菌的地理分布、寄主范围、生理生化特性、危害症状、发病规律以及防治等内容。该病菌寄主范围广、中国未见分布报道,深入了解该病菌对防治和植物检疫具有重要意义。 展开更多
关键词 大黄欧文氏菌 粉红色种子 腐烂 分布 寄主 生理生化持性 防治
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MALDI-TOF质谱检测单条植物线虫 被引量:1
16
作者 龙海 李芳荣 +5 位作者 李一农 凌杏园 谢泳桂 冯建军 郑耘 刘亮山 《生物技术通讯》 CAS 2015年第5期716-718,共3页
目的:研发一种快速、灵敏检测植物线虫的方法。方法:挑取单条线虫到裂解液中,用挑针压破线虫,以便提高蛋白质提取效率,利用MALDI-TOF质谱技术分析线虫的蛋白质指纹图谱,作为结果判断依据。结果:用该方法分析单条短体线虫的雌虫和二龄幼... 目的:研发一种快速、灵敏检测植物线虫的方法。方法:挑取单条线虫到裂解液中,用挑针压破线虫,以便提高蛋白质提取效率,利用MALDI-TOF质谱技术分析线虫的蛋白质指纹图谱,作为结果判断依据。结果:用该方法分析单条短体线虫的雌虫和二龄幼虫,雌虫的质谱峰值分别为m/z 2790、2970、3326、4373、4872、5654、7000、9579和19161,二龄幼虫的质谱峰值分别为m/z 2185、2790、3036、3326、4063、4373、4929、5380、6999和11156,二者相同的峰值分别为m/z 2790、4373和7000,其余峰值分别为各自的特征峰。结论:MALDI-TOF质谱能够区分同种线虫的不同虫态,检测灵敏度高,可用于单条植物线虫的检测。 展开更多
关键词 MALDI-TOF质谱 植物线虫 检测
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负压型植物隔离检疫温室的给排水系统设计及其生物安全性评价 被引量:1
17
作者 郑耘 龙海 +5 位作者 冯建军 王红英 卢小雨 张伟锋 徐浪 余道坚 《植物检疫》 北大核心 2015年第4期7-10,共4页
给排水系统的消毒处理部分是植物隔离检疫温室生物安全性的重要保障,可防止有害生物随水发生逃逸,或产生交叉污染,对于保证试验的可靠性、准确性以及确保生态安全具有重要的意义。本文根据负压型植物隔离检疫温室的特点设计了给排水系统... 给排水系统的消毒处理部分是植物隔离检疫温室生物安全性的重要保障,可防止有害生物随水发生逃逸,或产生交叉污染,对于保证试验的可靠性、准确性以及确保生态安全具有重要的意义。本文根据负压型植物隔离检疫温室的特点设计了给排水系统,其消毒处理部分采用砂石沉淀、活性炭、反渗透、超滤、紫外和臭氧等多种方式消毒处理有害生物,初步建立了给排水系统的生物安全评价指标。试验检测结果表明,消毒处理部分可有效处理全部有害生物,符合实验室生物安全要求。 展开更多
关键词 植物隔离检疫温室 给排水系统 消毒处理 生物安全评价
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深圳口岸首次截获重要害虫——李白盾蚧 被引量:1
18
作者 向才玉 焦懿 +4 位作者 陈冬美 康林 陈志粦 娄定风 徐浪 《植物检疫》 北大核心 2015年第3期97-99,共3页
李白盾蚧是一种重要经济害虫,在我国仅极少地区有分布。本报道该虫为我国口岸首次截获。本文对该虫的分类地位、分布、寄主、形态特征及其与近似种的区别等方面进行详细介绍,为各口岸检疫提供参考。
关键词 李白盾蚧 形态特征 分布 寄主
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泰国输华真柏中一种隐皮孢囊线虫的鉴定 被引量:1
19
作者 龙海 齐小峰 +2 位作者 谢泳桂 李一农 李芳荣 《植物检疫》 北大核心 2017年第3期29-32,共4页
深圳口岸从来自泰国真柏苗木中截获一种隐皮孢囊线虫。序列分析显示截获的孢囊线虫28S r DNA-D2/D3区基因序列与Gen Bank中布林克曼隐皮孢囊线虫(Cryphodera brinkmani)(登录号为JQ965677和DQ328705)的序列相似性为99%。系统进化树中截... 深圳口岸从来自泰国真柏苗木中截获一种隐皮孢囊线虫。序列分析显示截获的孢囊线虫28S r DNA-D2/D3区基因序列与Gen Bank中布林克曼隐皮孢囊线虫(Cryphodera brinkmani)(登录号为JQ965677和DQ328705)的序列相似性为99%。系统进化树中截获的孢囊线虫和布林克曼隐皮孢囊线虫聚为一个分支。结合形态学特征比较和分子特征分析,将截获的孢囊线虫鉴定为布林克曼隐皮孢囊线虫。这是我国口岸首次报道截获该线虫。 展开更多
关键词 布林克曼隐皮孢囊线虫 真柏 泰国 形态学 分子鉴定
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日本仙人掌中仙人掌孢囊线虫形态和分子鉴定
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作者 龙海 李芳荣 +2 位作者 程颖慧 谢泳桂 李一农 《生物安全学报》 2016年第4期295-299,共5页
【背景】近年来,种苗等植物通过邮寄包裹进入我国的数量越来越多,有害生物随之入侵的风险与日俱增。深圳口岸曾多次从入境包裹中截获孢囊线虫、根结线虫等。【方法】2015年10月12日,深圳口岸在对日本邮寄来的仙人掌进行检疫时,从其根部... 【背景】近年来,种苗等植物通过邮寄包裹进入我国的数量越来越多,有害生物随之入侵的风险与日俱增。深圳口岸曾多次从入境包裹中截获孢囊线虫、根结线虫等。【方法】2015年10月12日,深圳口岸在对日本邮寄来的仙人掌进行检疫时,从其根部发现了一种孢囊线虫。对该线虫进行分离,结合形态学和28S r DNA序列扩增并测序的方法,对截获的线虫进行鉴定。【结果】分离到了一种孢囊线虫,其形态特征与仙人掌孢囊线虫基本吻合,28S r DNA序列与Gen Bank数据库中登录号为DQ328702的德国群体的同源性高达99%。因此,判定截获的线虫为仙人掌孢囊线虫。【结论与意义】入境包裹检疫需要引起口岸检疫部门的高度重视。采用形态学和分子生物学相结合的方法对植物寄生线虫进行鉴定,可以得到更加准确的结果。 展开更多
关键词 仙人掌孢囊线虫 邮检 形态学 分子鉴定
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