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题名鉴定鼻咽癌候选基因及信号通路的研究
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作者
郭恒臣
孙永刚
刘国良
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机构
海伦市人民医院耳鼻喉科
海伦市中医院麻醉科
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出处
《当代医药论丛》
2021年第14期11-15,共5页
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文摘
目的:在基因表达谱的水平分析头颈部肿瘤鼻咽癌的差异表达基因(DEGs),鉴定候选基因及信号通路。方法:依据Home-GEO-NCBI数据库中的高通量基因表达数据,对GEO数据集进行统计。以GEO2R、David、Amigo、Kegg-Pathway、Reactome、Panther等作为基础,整合四个芯片数据集数据(GSE12452,GSE13597,GSE53819和GSE64634),统计四组数据及DEGs,并进行GO基因功能富集分析、KEGG信号通路富集分析和蛋白相互作用网络分析。结果:本研究发现114个有统计学意义的DEGs(38个上调基因和76个下调基因)。通过基因功能富集分析及信号通路富集分析,发现36个中心节点基因(FN1、CD19、C3、CXCL10、CLU、PROM1、CD22、MMP3、CR2、SCGB1A1、MEF2C、PAX5、PIGR、GAD1、PLAU、MAD2L1、MSLN、VCAN、DST、HOXA10、LTF、MS4A1、MUC16、PTGDS、ANG、SPAG6、TCL1A、TEKT2、TSPAN8、ATP12A、BANK1、CR1、DNAI1、KLF2、KRT7、NRXN1)。上述基因富集于癌症中的转录失调、细胞粘附分子(CAMs)、PI3K-Akt信号通路等过程。结论:中心节点基因与鼻咽癌发生、发展密切相关,可以为鼻咽癌的早期诊断及靶向治疗提供潜在线索。
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关键词
鼻咽癌
基因芯片
数据表达分析
标志物
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Keywords
nasopharyngeal carcinoma
Gene chip
Data expression analysis
markers
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分类号
R739.62
[医药卫生—肿瘤]
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