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生物信息学在基因组和蛋白质研究中的应用 被引量:5
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作者 陈永对 《中国临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2006年第41期136-139,共4页
目的:人类基因组计划在世界范围内的开展促进了生命科学的进步,在此过程中产生了大量的基因组与蛋白质结构和序列数据库资源,促进了生物信息学的发展;同时生物信息学在基因组和蛋白质研究中也起着重要的作用。资料来源:应用计算机检索Me... 目的:人类基因组计划在世界范围内的开展促进了生命科学的进步,在此过程中产生了大量的基因组与蛋白质结构和序列数据库资源,促进了生物信息学的发展;同时生物信息学在基因组和蛋白质研究中也起着重要的作用。资料来源:应用计算机检索Medline1990-01/2006-01文章,检索词“bioinformatics”,并限定语言种类为English;同时手工检索2000-01/2006-01的相关文章,限定语言为中文,检索词为“生物信息学;基因组;蛋白质结构”以及基因组相关方面的书籍。资料选择:对资料进行初审,纳入标准:生物信息学的发展及其在基因组和蛋白质研究中的应用。排除标准:重复性研究。资料提炼:从检索资料选取34篇(含2篇中文文献或书籍)关于生物信息学及其应用的文章,进行综述。其中与基因组研究相关的文献4篇,与蛋白质研究相关的文献20篇,其他文献10篇。资料综合:随着人们对基因组和蛋白质研究的深入,对基因表达模式、蛋白质结构、蛋白质-蛋白质相互作用等分析得到的数据越来越多,为生物信息学提供了丰富的资源,促进了生物信息学的发展;同时生物信息学在基因序列比对、大规模基因功能表达谱的分析、新基因的发现与鉴定等方面以及蛋白质序列比较分析、蛋白质空间结构和功能预测等研究中也起着重要的作用,促进了DNA和蛋白质的研究。结论:基因组和蛋白质组研究与生物信息学技术互相推动,并行发展;生物信息学在基因组和蛋白质研究中发挥着重要的作用。 展开更多
关键词 计算生物学 基因组 蛋白质类 数据库
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颗粒蛋白前体的生理功能及其与肿瘤发生的关系 被引量:5
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作者 肖渝 许正平 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2006年第12期890-893,共4页
颗粒蛋白前体(PGRN)在调节生长发育、损伤修复和促进细胞增殖等方面发挥重要作用。PGRN能促进肿瘤细胞过度增殖、增强细胞向外周侵袭的能力以及促进肿瘤组织血管新生,提示它可能是肿瘤治疗的一个非常重要的靶标。
关键词 肿瘤 肿瘤侵润 增殖
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扣针蛋白-5与疾病 被引量:3
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作者 汤佳城 许正平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期511-516,共6页
扣针蛋白-5(fibulin-5,FBLN-5)是一个胞外基质糖蛋白,广泛分布于富含弹性蛋白的组织中,可通过与其它胞外蛋白相互作用而调节基质的结构.近期研究发现,该蛋白是一个内源性的血管生成抑制剂,在血管发育中发挥了重要的作用.同时,扣针蛋白-... 扣针蛋白-5(fibulin-5,FBLN-5)是一个胞外基质糖蛋白,广泛分布于富含弹性蛋白的组织中,可通过与其它胞外蛋白相互作用而调节基质的结构.近期研究发现,该蛋白是一个内源性的血管生成抑制剂,在血管发育中发挥了重要的作用.同时,扣针蛋白-5与一些肿瘤的增殖、转移和侵袭等相关,其基因突变则会导致遗传性疾病的发生.本文就扣针蛋白-5与血管生成、血管发育、肿瘤及遗传性疾病的关系及当前的研究进展进行综述. 展开更多
关键词 扣针蛋白-5 血管生成 血管发育 肿瘤 遗传性疾病
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B细胞非霍奇金淋巴瘤IgH基因重排检测及凝胶扫描技术应用的初步研究 被引量:5
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作者 张晓飞 周韧 +4 位作者 毛峥嵘 骆利康 胡孟钧 杨水友 李斐铭 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期513-517,共5页
目的 采用凝胶扫描技术 ,力求对采用聚合酶链反应 (PCR)检测非霍奇金淋巴瘤(NHL)抗原受体基因重排结果分析时建立量化标准 ,以利于临床医师应用时客观判断 ,并为其筛选随访病例提供依据。方法 用PCR对 96例B NHL分别采用IgHFR3A及FR2... 目的 采用凝胶扫描技术 ,力求对采用聚合酶链反应 (PCR)检测非霍奇金淋巴瘤(NHL)抗原受体基因重排结果分析时建立量化标准 ,以利于临床医师应用时客观判断 ,并为其筛选随访病例提供依据。方法 用PCR对 96例B NHL分别采用IgHFR3A及FR2A检测IgH基因克隆性重排。 6 5例经IgHFR3APCR已证实为IgH基因克隆性重排B NHL及 8例良性病变淋巴组织和 5例正常人外周血单核细胞 ,IgHFR3APCR产物 8%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染后图像行凝胶扫描 ,绘制曲线并计算h1/h2比值。结果  (1)采用FR3A引物 ,克隆性IgH基因重排在 96例B NHL中检测率为 6 8% ,采用FR2A引物 ,检测率为 6 1% ,结合FR3A、FR2A引物 ,总检测率为 83%。 (2 )凝胶扫描曲线示 6 5例B NHL的h1/h2均〉3,而 5例正常人外周血单核细胞曲线均表现为钟型 ,8例良性病变淋巴组织h1/h2比值均 <1 5。结论 非霍奇金淋巴瘤抗原受体基因重排检测的凝胶扫描分析曲线中 ,h1/h2峰高比值至少 >3可提示为IgH基因克隆性重排 ,<1 5可能提示IgH基因多克隆重排。比值介于 1 5和 3之间 ,提示有随访意义。联合FR3A ,FR2A引物 ,可提高B NHLIgH基因克隆性重排的检测率。 展开更多
关键词 NHL IGH基因重排 克隆性 非霍奇金淋巴瘤 比值 FR 良性病变 曲线 结论 提示
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