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中国狼(Canis lupus chanco)线粒体全基因组序列分析
被引量:
6
1
作者
孟超
张洪海
陈玉才
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期1170-1176,共7页
参照近缘物种线粒体全基因组序列,设计14对特异引物,采用PCR产物直接测序法测得中国狼线粒体基因组全序列,并分析其基因组特点和各基因的定位.用pDRAW32软件,预测12种限制性酶的酶切图谱.结果表明,中国狼线粒体基因组全长16774bp,包括1...
参照近缘物种线粒体全基因组序列,设计14对特异引物,采用PCR产物直接测序法测得中国狼线粒体基因组全序列,并分析其基因组特点和各基因的定位.用pDRAW32软件,预测12种限制性酶的酶切图谱.结果表明,中国狼线粒体基因组全长16774bp,包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区.除ND2、ND3和ND5基因以ATA作为起始密码子外,其它基因的起始密码子均为ATG.除COXⅢ、ND4、ND3基因的终止密码子分别为不完全的T,T,TA;ND2,COXⅡ,Cytb基因的终止密码子分别是TAG、TAG、AGA外;其余基因均以TAA作为终止密码子,而欧亚狼和狗COXⅡ基因则以TAA终止.基于近缘哺乳动物15种近缘物种的线粒体基因组的12S rRNA和16S rRNA基因全序列,用邻近法、最大简约法和最大似然法构建系统进化树,系统进化关系与传统的系统分类基本一致.并在已有文献的基础上,探讨了中国狼的进化地位.
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关键词
中国
狼
线粒体基因组
序列分析
系统发育
下载PDF
职称材料
题名
中国狼(Canis lupus chanco)线粒体全基因组序列分析
被引量:
6
1
作者
孟超
张洪海
陈玉才
机构
曲阜师范大学生命科学学院
济南
跑
马岭
野生
动物园
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期1170-1176,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.30370218)
山东省自然科学基金(No.2002B13)
+2 种基金
山东省科技攻关项目(No.2007GG2009011)
山东省教育厅科技计划重点项目(J07YG06)
教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-070507)~~
文摘
参照近缘物种线粒体全基因组序列,设计14对特异引物,采用PCR产物直接测序法测得中国狼线粒体基因组全序列,并分析其基因组特点和各基因的定位.用pDRAW32软件,预测12种限制性酶的酶切图谱.结果表明,中国狼线粒体基因组全长16774bp,包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区.除ND2、ND3和ND5基因以ATA作为起始密码子外,其它基因的起始密码子均为ATG.除COXⅢ、ND4、ND3基因的终止密码子分别为不完全的T,T,TA;ND2,COXⅡ,Cytb基因的终止密码子分别是TAG、TAG、AGA外;其余基因均以TAA作为终止密码子,而欧亚狼和狗COXⅡ基因则以TAA终止.基于近缘哺乳动物15种近缘物种的线粒体基因组的12S rRNA和16S rRNA基因全序列,用邻近法、最大简约法和最大似然法构建系统进化树,系统进化关系与传统的系统分类基本一致.并在已有文献的基础上,探讨了中国狼的进化地位.
关键词
中国
狼
线粒体基因组
序列分析
系统发育
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国狼(Canis lupus chanco)线粒体全基因组序列分析
孟超
张洪海
陈玉才
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
6
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