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题名鉴定肝细胞癌特异性血清细胞因子
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作者
张迷
陈曦
李孟祥
焦叶林
齐义军
岳文彬
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机构
新乡医学院附属濮阳市油田总医院肿瘤科
河南科技大学信息工程学院
洛阳市第一人民医院病理科
河南科技大学医学院河南省肿瘤表观遗传重点实验室
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出处
《胃肠病学和肝病学杂志》
CAS
2021年第11期1224-1229,共6页
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基金
河南省科技攻关项目(152102310218)。
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文摘
目的鉴定肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)特异性血清细胞因子。方法用细胞因子抗体芯片检测非癌对照和HCC患者血清细胞因子,富集分析KEGG生物学通路,ProteoMap分析生物学功能构成。构建基于STRING数据库差异表达细胞因子间相互作用网络,计算节点分子的“degree”和“betweenness”,确定关键细胞因子并应用ELISA进行验证。结果鉴定出差异倍数>1.5倍的HCC相关差异表达细胞因子为43个(高、低表达分别为26个和17个),80%差异表达的细胞因子参与多个功能相关的生物学通路和信号通路。这些差异表达细胞因子构成的蛋白-蛋白互作网络中,“degree”和“betweenness”分值位居前5的细胞因子包括VEGFA、VCAM1、CXCR4、CCR7和TLR3。HCC血清中VEGFA、CCR7和CXCR4表达显著高于肝硬化和慢性乙肝患者及健康对照,其中慢性乙肝患者血清VEGFA表达高于肝硬化和健康对照,慢性乙肝和肝硬化患者血清中CCR7和CXCR4表达差异无统计学意义,但明显高于健康对照。结论VEGFA、CCR7和CXCR4是潜在的HCC血清标志物。
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关键词
肝细胞癌
细胞因子
蛋白-蛋白相互作用网络
VEGFA
CCR7
CXCR4
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Keywords
Hepatocellular carcinoma
Cytokines
Protein-protein interaction network
VEGFA
CCR7
CXCR4
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
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