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茶树异胡豆苷合酶基因CsSTR1克隆及表达分析 被引量：1
1
作者 周棋赢 李娅菲 +6 位作者 郭文利 张馨月 葛鑫 方志贞 孙洁 王仪佳 陈尚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第10期2296-2302,共7页
【目的】探明茶树(Camellia sinensis)STR基因(CsSTR)的分子特征及其表达调控模式,为其功能研究以及茶叶药用价值的挖掘奠定基础。【方法】利用RACE克隆技术对茶树CsSTR1基因进行克隆,利用信息学分析方法对其理化性质、蛋白质结构、亚... 【目的】探明茶树(Camellia sinensis)STR基因(CsSTR)的分子特征及其表达调控模式,为其功能研究以及茶叶药用价值的挖掘奠定基础。【方法】利用RACE克隆技术对茶树CsSTR1基因进行克隆,利用信息学分析方法对其理化性质、蛋白质结构、亚细胞定位以及系统进化关系进行分析,通过qPCR技术检测其表达模式。【结果】CsSTR1基因cDNA全长1382 bp,其中5′UTR长92 bp, 3′UTR长159 bp, CDS长1131 bp,编码376个氨基酸,分子量为41.5 kD,理论等电点为6.36,不稳定指数为29.74,脂肪族氨基酸指数为88.94,亲水性平均系数为-0.077。CsSTR1定位于液泡,其二级结构中无规卷曲、延伸链、α螺旋和β转角占比分别为42.82%、29.79%、16.76%、10.64%,其三维结构呈六叶β-螺旋浆状。系统发育树分析显示,CsSTR1与水稻OsSTRL2蛋白具有较近的亲缘关系。CsSTR1基因在茶树不同组织器官中均有表达,其中在芽和第一、二、三叶中表达量较高,在花和果中表达量较低。低温、PEG模拟干旱胁迫以及MeJA和SA处理均诱导CsSTR1基因上调表达;ABA处理后24~48 h,CsSTR1基因呈现下调表达。【结论】CsSTR1在茶树芽叶发育以及逆境防御反应中具有重要作用,植物激素MeJA,SA和ABA能调控CsSTR1基因表达。 展开更多
关键词 茶树 CsSTR1基因 克隆 表达分析 逆境胁迫
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茶树NAC基因的鉴定及其在逆境反应中的表达调控分析 被引量：8
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作者 周棋赢 韩月华 +7 位作者 梁萍 王艳丽 穆逸雪 王仪佳 祝悦 刘国峰 彭波 袁红雨 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2020年第4期567-578,共12页
利用隐马可夫模型检索和同源比对的方法,从茶树基因组鉴定出108个NAC成员(CsNAC).理化特征、进化关系、基因结构和保守基序分析表明,CsNAC蛋白长度在134~1950个氨基酸之间,分子量介于15.4~222 kD,等电点介于4.60~9.91,大部分为亲水性蛋... 利用隐马可夫模型检索和同源比对的方法,从茶树基因组鉴定出108个NAC成员(CsNAC).理化特征、进化关系、基因结构和保守基序分析表明,CsNAC蛋白长度在134~1950个氨基酸之间,分子量介于15.4~222 kD,等电点介于4.60~9.91,大部分为亲水性蛋白(除CsNAC97).其中,CsNAC3、8、14、23、32、74、82、90、106蛋白含跨膜结构域.进化分析将CsNAC家族分为18个亚类,ONAC022和NAP亚类成员最多,AtNAC3和OsNAC8亚类成员最少.CsNAC基因启动子区富含响应干旱、低温、盐胁迫以及病原菌侵染的序列元件.据转录组数据分析结果,CsNAC基因家族成员在不同组织和胁迫处理后呈现显著的表达差异.低温和干旱胁迫下的CsNAC共表达网络中,ABA参与调控其关键基因的表达;KEGG分析显示,信号传递、糖代谢、植物与病原菌互作等途径存在显著富集. 展开更多
关键词 茶树 NAC转录因子 逆境反应 表达调控
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茶树异胡豆苷合成酶基因的全基因组鉴定和表达分析 被引量：3
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作者 周棋赢 姜慧敏 +3 位作者 李拉拉 袁红雨 张瑞娇 王仪佳 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2021年第4期596-605,共10页
基于隐马可夫模型检索和序列比对,从茶树基因组鉴定出17个异胡豆苷合成酶(Strictosidine synthase,STR)基因(CsSTR1~17).理化分析表明,CsSTR蛋白长度在147~552个氨基酸之间,分子量介于15.6~60.8 kD,等电点介于4.65~10.88,除CsSTR3、4、9... 基于隐马可夫模型检索和序列比对,从茶树基因组鉴定出17个异胡豆苷合成酶(Strictosidine synthase,STR)基因(CsSTR1~17).理化分析表明,CsSTR蛋白长度在147~552个氨基酸之间,分子量介于15.6~60.8 kD,等电点介于4.65~10.88,除CsSTR3、4、9、10、11和13,其他CsSTR都为亲水性蛋白.物种进化分析结果表明,CsSTR3、4、10、11、12、13、14与蛇根木、萝芙木、长春花和喜树中的STR位于同一进化分支;但进化关系较近的CsSTR基因间,其内含子数目和长度、蛋白保守基序的数量和类型不同.表达分析结果显示,CsSTR基因表达受低温、干旱、盐胁迫以及茉莉酸甲酯调控,大部分CsSTR基因在顶芽、成熟叶和根中具有较高的表达量.启动子分析结果表明,CsSTR基因启动子区含有许多与生长发育和逆境反应相关的元件.ERF、MYB、Zinc Finger、bZIP家族转录因子是与CsSTR基因启动子结合较多的蛋白. 展开更多
关键词 茶树 异胡豆苷合成酶 鉴定 表达分析
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植物棉子糖合成酶的功能及调控机理研究进展
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作者 周棋赢 张佳佳 +5 位作者 赵艳 胡雨桐 张瑞姣 方志贞 李娅菲 冯迎春 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第2期338-344,共7页
从棉子糖及其系列寡糖的合成、棉子糖合成酶(Raffinose synthase,RS)的生化和序列特征、棉子糖合成酶在种子发育与萌发中的作用、棉子糖合成酶在逆境防御中的作用、棉子糖合成酶的转录调控等5个方面对当前植物棉子糖合成酶的研究成果进... 从棉子糖及其系列寡糖的合成、棉子糖合成酶(Raffinose synthase,RS)的生化和序列特征、棉子糖合成酶在种子发育与萌发中的作用、棉子糖合成酶在逆境防御中的作用、棉子糖合成酶的转录调控等5个方面对当前植物棉子糖合成酶的研究成果进行了综述,并展望了该领域今后的研究重点。 展开更多
关键词 棉子糖合成酶 棉子糖 棉子糖系列寡糖 逆境防御 转录调控
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