目的:基于网络药理学探讨加味通窍活血汤治疗瘀血阻窍型后循环缺血的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索加味通窍活血...目的:基于网络药理学探讨加味通窍活血汤治疗瘀血阻窍型后循环缺血的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索加味通窍活血汤组方中药麝香、川芎、赤芍、桃仁、红花、全蝎、石菖蒲、葛根、老葱、生姜、大枣的活性成分和作用靶点。利用Genecards数据库及在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索后循环缺血相关靶点,并与中药有效成分相关靶点取交集。将交集靶标导入String11.0中获取蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)并筛选核心靶点。运用Cyoscape 3.7.2软件构建“中药-成分-靶点”网络并进行拓扑分析。借助R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过Autodock Vina对筛选出的部分活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:通过TCMSP数据库检索加味通窍活血汤组方中药活性成分,并获得加味通窍活血汤相关靶点289个。在Genecards和OMIM数据库获得疾病靶标1044个,与中药活性成分靶点交集靶标131个。PPI网络分析筛选出10个核心基因。“中药-成分-靶点”网络分析显示槲皮素、17-β-雌二醇、木犀草苷、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、β-胡萝卜素、芒柄花黄素、豆甾烯醇、杨梅酮为核心活性成分。GO功能富集分析显示主要与对缺氧的反应及氧化应激的反应等生物过程、细胞因子受体结合等分子功能及膜微区等细胞组分相关。KEGG通路富集分析筛选得到156条信号通路。分子对接显示,核心成分与关键靶点能有效结合。结论:加味通窍活血汤中的槲皮素、17-β-雌二醇、木犀草苷等有效成分可能通过作用于血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor,VEG展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨加味通窍活血汤治疗瘀血阻窍型后循环缺血的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索加味通窍活血汤组方中药麝香、川芎、赤芍、桃仁、红花、全蝎、石菖蒲、葛根、老葱、生姜、大枣的活性成分和作用靶点。利用Genecards数据库及在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索后循环缺血相关靶点,并与中药有效成分相关靶点取交集。将交集靶标导入String11.0中获取蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)并筛选核心靶点。运用Cyoscape 3.7.2软件构建“中药-成分-靶点”网络并进行拓扑分析。借助R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过Autodock Vina对筛选出的部分活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:通过TCMSP数据库检索加味通窍活血汤组方中药活性成分,并获得加味通窍活血汤相关靶点289个。在Genecards和OMIM数据库获得疾病靶标1044个,与中药活性成分靶点交集靶标131个。PPI网络分析筛选出10个核心基因。“中药-成分-靶点”网络分析显示槲皮素、17-β-雌二醇、木犀草苷、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、β-胡萝卜素、芒柄花黄素、豆甾烯醇、杨梅酮为核心活性成分。GO功能富集分析显示主要与对缺氧的反应及氧化应激的反应等生物过程、细胞因子受体结合等分子功能及膜微区等细胞组分相关。KEGG通路富集分析筛选得到156条信号通路。分子对接显示,核心成分与关键靶点能有效结合。结论:加味通窍活血汤中的槲皮素、17-β-雌二醇、木犀草苷等有效成分可能通过作用于血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor,VEG
