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霍乱弧菌O1群菌株多位点酶电泳分析 被引量：10
1
作者 段广才 高守一 +2 位作者 刘延清 祁国明 章丽娟 《河南医科大学学报》 1998年第3期 11-17,共7页
为更准确区分霍乱弧菌Ｏ１群不同菌株的流行病学意义，应用多位点酶早泳法对来自不同国家，地区，时间和人群的霍乱弧菌Ｏ１群菌４７１株进行分型和分子生物学数值分类分析。结果；通过１１种酶基因位点的检测，４７１株Ｏ１群霍乱弧菌... 为更准确区分霍乱弧菌Ｏ１群不同菌株的流行病学意义，应用多位点酶早泳法对来自不同国家，地区，时间和人群的霍乱弧菌Ｏ１群菌４７１株进行分型和分子生物学数值分类分析。结果；通过１１种酶基因位点的检测，４７１株Ｏ１群霍乱弧菌可以分为７１个ＥＴ型，ＥＴ１－ＥＴ２８为噬菌体－生物分型所区分的流行株，其中ＥＴ１－ＥＴ６为古典型菌，ＥＴ７包括大多埃尔托流行株和部分古典型菌株； 展开更多
关键词 霍乱弧菌 分型 多位点酶电泳 数值分类 O1群
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RAPD法对50株幽门螺杆菌的分子流行病学 被引量：5
2
作者 代敏 段广才 +3 位作者 郗园林 范清堂 李倩 施侣元 《疾病控制杂志》 CAS 2002年第1期12-14,共3页
目的　从基因水平研究幽门螺杆菌与疾病的关系。方法　用随机扩增的多态性 DNA(RAPD)法对 5 0株来自不同病人的幽门螺杆菌进行基因分型 ,并在此基础上探讨不同基因型别的幽门螺杆菌与疾病之间的关系。结果　 5 0株幽门螺杆菌均呈现不同... 目的　从基因水平研究幽门螺杆菌与疾病的关系。方法　用随机扩增的多态性 DNA(RAPD)法对 5 0株来自不同病人的幽门螺杆菌进行基因分型 ,并在此基础上探讨不同基因型别的幽门螺杆菌与疾病之间的关系。结果　 5 0株幽门螺杆菌均呈现不同的基因图谱 ,经聚类分析可分为 3个基因型别 ,此 3个基因型别在不同疾病中的发生率不同 ,经统计学分析 ,差异有显著性 (P=0 .0 3)。 展开更多
关键词 随机扩增多态DNA技术 幽门螺杆菌 流行病学 分子
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霍乱弧菌非O1群菌株的毒力基因检测和染色体酶切图谱分析 被引量：6
3
作者 段广才 高守一 +2 位作者 祁国明 刘延清 刘彩莲 《河南医科大学学报》 1998年第3期40-43,共4页
非Ｏ１群霍乱弧菌（不包括Ｏ１３９菌）是腹泻病原菌，由于它们分布较广，因此对人们的健康具有较大的威协；应用核酸技术对９８株非Ｏ１菌的主要毒力基因进行检测，并从ＤＮＡ和基因水平对５株非Ｏ１菌的分子特征进行研究。结果：所选... 非Ｏ１群霍乱弧菌（不包括Ｏ１３９菌）是腹泻病原菌，由于它们分布较广，因此对人们的健康具有较大的威协；应用核酸技术对９８株非Ｏ１菌的主要毒力基因进行检测，并从ＤＮＡ和基因水平对５株非Ｏ１菌的分子特征进行研究。结果：所选菌株的染色体酶切图谱与Ｏ１群霍乱弧菌相比有很大差异，尤其与Ｏ１群流行株的差异更大，非Ｏ１菌相互之间的差异也很大；对９８株非Ｏ１菌进行ｃｔｘ、ｚｏｔ、ａｃｅ、ＲＳ１基因检测，结果有２株为上述基因阳性，仅为２％左右。结果显示：非Ｏ１菌群体遗传结构复杂，变异程度高；其与Ｏ１菌，尤其是流行株（包括Ｏ１３９菌）的遗传关系较远； 展开更多
关键词 非O1群 霍乱弧菌 毒力基因
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霍乱弧菌O139菌株的分子生物学特征 被引量：4
4
作者 段广才 高守一 +1 位作者 祁国明 刘延清 《河南医科大学学报》 1998年第3期43-47,共5页
为阐明Ｏ１３９霍乱弧菌的主要分子生物学特征，并为探讨其来源提供科学依据，应用核酸脉冲场凝胶电泳、基因探针Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交等方法，对国内外分离的２３株Ｏ１３９菌和一些Ｏ１群菌株进行分析。结果表明，所有Ｏ１３９菌株均... 为阐明Ｏ１３９霍乱弧菌的主要分子生物学特征，并为探讨其来源提供科学依据，应用核酸脉冲场凝胶电泳、基因探针Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交等方法，对国内外分离的２３株Ｏ１３９菌和一些Ｏ１群菌株进行分析。结果表明，所有Ｏ１３９菌株均表现为一致的且具有特征性的酶切图谱；它们与埃尔托型流行株的图谱较与古典型菌株图谱更为相似，与埃尔托非流行株和其他非Ｏ１菌株的遗传差异较大。在ＳｍａＩ图谱中，新疆分离的Ｏ１３９菌株显示出与当地１９８９年分离的埃尔托型流行株较接近的图谱；Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ结果显示在不同的酶切图谱分子杂交（ＳｍａＩ、ＳａｌＩ、ＸｂａＩｃｔｘ，ＢｇｌＩ１６ｓｒＲＮＡ）中，Ｏ１３９菌株与Ｏ１流行株之间有一定的差异；我国分离的Ｏ１３９菌株具有一致的图谱，与印度和孟加拉国分离的Ｏ１３９菌株之间有较小差异；新疆分离的Ｏ１３９菌株与该地１９８９年分离的某些ＥＶＣ流行株的图谱相似。基因检测表明，Ｏ１３９菌株都具有ｃｔｘ、ｚｏｔ、ａｃｅ和ＲＳ１；ＭＥＥ分析表明，Ｏ１３９菌株的ＥＴ型与ＥＶＣ流行株不可区分。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 PFGE RRNA 分子特征 O139菌株
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细菌分子生物学数值分类计算机程序的研制及应用 被引量：2
5
作者 段广才 高守一 +1 位作者 刘延清 祁国明 《河南医科大学学报》 1998年第3期48-55,共8页
在分子生物学数值分类中，最基本的，也是最关键的技术指标是遗传距离的权重系数；目前除等权系数被广泛应用外，尚未有公认客观、合理的遗传距离权重系数，使分子生物学数值分类的合理性和客观性受到了严峻的挑战。以群体遗传学中遗传... 在分子生物学数值分类中，最基本的，也是最关键的技术指标是遗传距离的权重系数；目前除等权系数被广泛应用外，尚未有公认客观、合理的遗传距离权重系数，使分子生物学数值分类的合理性和客观性受到了严峻的挑战。以群体遗传学中遗传多态度为客观基础指标，经过数学复合运算，获得较合理、客观的分子生物学数值分类的遗传距离权重系数；以此为基础，编制了细菌分子生物学数值分类的计算机处理程序。应用此程序分别对以ＰＦＧＥＲＦＬＰｓ、ＰＦＧＥＳｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ（１６ＳｒＲＮＡ基因和ＣＴ基因探针）和ＭＥＥ结果为基础的霍乱弧菌分子生物学特征进行数值分类分析，取得了非常满意的结果；可以客观、合理地分析霍乱弧菌不同群体之间的遗传关系，并有效区分霍乱弧菌古典型、埃尔托型流行株、埃尔托型非流行株。 展开更多
关键词 数值分类 计算机程序 分子生物学 霍乱弧菌
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霍乱弧菌不同群体菌株的群体遗传特征比较 被引量：2
6
作者 段广才 高守一 +2 位作者 祁国明 刘延清 章丽娟 《河南医科大学学报》 CAS 1998年第3期32-35,共4页
应用ＭＥＥ法对５９２株霍乱弧菌的１５个酶基因位点进行检测，分析和比较霍乱弧菌不同群体的群体遗传特征。结果：古典型菌株（ＣＶＣ）、埃尔托流行株（ＥＳＥＶＣ）和Ｏ１３９菌株（Ｏ１３９）的群体平均遗传多态值和平均杂合度都很... 应用ＭＥＥ法对５９２株霍乱弧菌的１５个酶基因位点进行检测，分析和比较霍乱弧菌不同群体的群体遗传特征。结果：古典型菌株（ＣＶＣ）、埃尔托流行株（ＥＳＥＶＣ）和Ｏ１３９菌株（Ｏ１３９）的群体平均遗传多态值和平均杂合度都很低，ＨＣＶＣ＝０．１０６、ｈＣＶＣ＝１．５，ＨＥＳＥＶＣ＝０．０５６、ｈＥＳＥＶＣ＝２．３（Ｏ１３９包含在ＥＳＥＶＣ之中），被检测的基因位点多为非多态位点；而同为Ｏ１群菌的埃尔托非流行株（ＮＳＥＶＣ）的平均遗传多态值和平均杂合度要高得多，接近非Ｏ１群菌株（ＮＯ１）的群体遗传学指标，分别为ＨＮＳＥＶＣ＝０．４２５、ｈＮＳＥＶＣ＝５，ＨＮＯ１＝０．６２７、ｈＮＯ１＝６．５，被检测的基因位点几乎全是遗传多态位点。结果表明：ＥＳＥＶＣ和ＮＳＥＶＣ虽然都是Ｏ１群菌，但在群体遗传学特征上存在巨大差异；ＣＶＣ、ＥＳＥＶＣ和Ｏ１３９为遗传学性状稳定、群体遗传结构紧密的群体。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 群体遗传特征 遗传多态度
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霍乱弧菌O1群毒力基因分布和DNA分子特征
7
作者 段广才 高守一 +2 位作者 刘延清 祁国明 刘彩莲 《河南医科大学学报》 1998年第3期35-40,共6页
由于霍乱弧菌（ＶＣ）Ｏ１群菌株中仅有部分可以引起霍乱流行，研究其主要毒力基因分布和ＤＮＡ分子特征，已成为目前学者们关注的重要课题。应用原位杂交法对４７１株Ｏ１群ＶＣ的主要毒力基因分布情况进行检测，用核酸脉冲场凝胶电泳... 由于霍乱弧菌（ＶＣ）Ｏ１群菌株中仅有部分可以引起霍乱流行，研究其主要毒力基因分布和ＤＮＡ分子特征，已成为目前学者们关注的重要课题。应用原位杂交法对４７１株Ｏ１群ＶＣ的主要毒力基因分布情况进行检测，用核酸脉冲场凝胶电泳对其中３４株进行染色体ＤＮＡ特征和ＣＴ基因Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析。结果：在ＳａｌＩ酶切图谱中，所有埃尔托流行株（ＥＳＥＶＣ）具有一致的酶切图谱；古典型菌株（ＣＶＣ）除１１１９菌与ＥＳＥＶＣ图谱相同外，其他均具有一致的特征性图谱。ＣＶＣ和ＥＳＥＶＣ之间有较微小的差异。埃尔托非流行株（ＮＳＥＶＣ）的图谱与ＥＳＥＶＣ之间有较大差异。在ＳｍａＩ和ＸｂａＩ酶切图谱中，结果与上述一致，其中ＣＴ基因缺失的ＥＳＥＶＣ菌株７７４３和８０１２７５具有较相似的ＳｍａＩ酶谱。用ｃｔｘ、ｚｏｔ、ａｃｅ、ＲＳ１为探针，对４７１株Ｏ１群霍乱弧菌进行毒力基因检测；结果：ＣＶＣ菌株全部阳性；ＥＳＥＶＣ菌株中，上述基因阳性率分别为：９７．３％、９７．５％、９７．３％、９９％；在１０株ＣＴ基因缺失的ＥＳＥＶＣ菌株中，有三株为ｚｏｔ基因阳性；在ＮＳＥＶＣ菌株中，有一株为ｚｏｔ和ＲＳ１阳性。美国海湾分离的６株产毒ＶＣ上述基因阳性。结果? 展开更多
关键词 O1群 霍乱弧菌 毒力基因分布 DNA 分子特征
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霍乱弧菌O1群菌株的群体遗传学特征
8
作者 段广才 高守一 +1 位作者 祁国明 刘延清 《河南医科大学学报》 1998年第3期24-29,共6页
霍乱的病原菌是Ｏ１群霍乱弧菌，但在Ｏ１群霍乱弧菌中，仅有部分可以引起霍乱流行，因此不同菌株在流行病学上的意义差异很大。为探讨Ｏ１群菌不同型别和亚群之间的遗传关系和进化变异规律，应用多位点酶电泳法对Ｏ１群霍乱弧菌进行研... 霍乱的病原菌是Ｏ１群霍乱弧菌，但在Ｏ１群霍乱弧菌中，仅有部分可以引起霍乱流行，因此不同菌株在流行病学上的意义差异很大。为探讨Ｏ１群菌不同型别和亚群之间的遗传关系和进化变异规律，应用多位点酶电泳法对Ｏ１群霍乱弧菌进行研究。结果：Ｏ１群霍乱弧菌的大多基因位点等位基因频率较低，尤其是古典型菌株和埃尔托型流行株，大多被检测基因为非多态位点；Ｏ１群霍乱弧菌的平均遗传多态值（ＨＯ１）为０．１８３，平均杂合度（ｈＯ１）为５．６７；其中古典型菌、埃尔托型流行株、埃尔托型非流行株的平均遗传多态值和平均杂合度分别为：ＨＣＶＣ＝０．１０６，ｈＣＶＣ＝１．５；ＨＥＳＥＶＣ＝０．０５６，ｈＥＳＥＶＣ＝２．３；ＨＮＳＥＶＣ＝０．４２５，ｈＮＳＥＶＣ＝５。结果显示：古典型和埃尔托型流行株作为霍乱的病原体是一个遗传关系紧密的群体，而埃尔托型非流行株遗传关系较为离散，与流行株之间的关系也较远。 展开更多
关键词 O1群 霍乱弧菌 群体遗传学 遗传多态度 杂合度
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霍乱弧菌非O1群菌株的群体遗传结构
9
作者 段广才 高守一 +2 位作者 祁国明 刘延清 章丽娟 《河南医科大学学报》 CAS 1998年第3期30-32,共3页
近年来非Ｏ１群霍乱弧菌在人类疾病上的流行病学意义也日益受到人们的关注。应用多位点酶电泳法对９８株非Ｏ１群霍乱弧菌１７个酶基因位点进行检测分析。结果：在被检测的基因位点中，大多位点的等位基因数较多，等位基因频率相对较低... 近年来非Ｏ１群霍乱弧菌在人类疾病上的流行病学意义也日益受到人们的关注。应用多位点酶电泳法对９８株非Ｏ１群霍乱弧菌１７个酶基因位点进行检测分析。结果：在被检测的基因位点中，大多位点的等位基因数较多，等位基因频率相对较低，但多数位点具有１～２个优势等位基因；平均遗传多态值和杂合度分析表明，检测的１７个酶基因位点都是多态的，平均遗传多态值ＨＮＯ１为０．６２７，平均杂合度ｈＮＯ１为６．５，说明非Ｏ１群霍乱弧菌群体遗传结构复杂，群体中的变异程度很高；这与非Ｏ１群霍乱弧菌广泛分布于自然环境水体中是一致的。结果提示：在被检测地区，非Ｏ１群霍乱弧菌中尚不具有遗传性状稳定的较大优势群体存在；同时也说明环境的自然选择在细菌进化变异中的重要作用。 展开更多
关键词 非O1群 霍乱弧菌 群体遗传结构 遗传多态度
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