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运用系统进化分析技术研究全国献血人群HIV感染特征
被引量:
11
1
作者
高占
王瑞
+19 位作者
赵帅
冯毅
黄力勤
邵一鸣
王露楠
邢辉
葛红卫
潘彤
韩卫
朱绍汶
王芳
郑伟
释艳华
朱海峰
方建华
李维
何清
何敏
王鹏
曾劲峰
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期981-985,共5页
目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化...
目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯(BI)和最大似然(ML)系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01AE和CRF07BC所占比例最高,分别占46.1%(41/89)和37.1%(33/89);亚型CRF08BC、B分别占2.2%(2/89)、5.6%(5/89);其他亚型CRF65CPX、CRF5501B、CRF5901B、CRF6801B、CRF62BC各占1.1%(1/89)。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%(21/89)、21.3%(19/89)和33.7%(30/89),这3个均是全国男男性行为者(MSM)传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01AE(C4和C5簇)和CRF07BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。
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关键词
艾滋病病毒
基因型
无偿献血
系统进化
原文传递
题名
运用系统进化分析技术研究全国献血人群HIV感染特征
被引量:
11
1
作者
高占
王瑞
赵帅
冯毅
黄力勤
邵一鸣
王露楠
邢辉
葛红卫
潘彤
韩卫
朱绍汶
王芳
郑伟
释艳华
朱海峰
方建华
李维
何清
何敏
王鹏
曾劲峰
机构
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红十字
血液
中心
山东
省
血液
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河南
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血液
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重庆市
血液
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云南昆明
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北京市通州区
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血站
深圳市
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中国疾病预防控制
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性病艾滋病预防控制
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中心
天津市
血液
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红十字
血液
中心
江苏
省
血液
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辽宁
省
血液
中心
黑龙江
省
血液
中心
襄阳市
中心
血站
出处
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期981-985,共5页
基金
国家自然科学基金(81471962)
北京市科技计划项目(D161100000416002)~~
文摘
目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯(BI)和最大似然(ML)系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01AE和CRF07BC所占比例最高,分别占46.1%(41/89)和37.1%(33/89);亚型CRF08BC、B分别占2.2%(2/89)、5.6%(5/89);其他亚型CRF65CPX、CRF5501B、CRF5901B、CRF6801B、CRF62BC各占1.1%(1/89)。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%(21/89)、21.3%(19/89)和33.7%(30/89),这3个均是全国男男性行为者(MSM)传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01AE(C4和C5簇)和CRF07BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。
关键词
艾滋病病毒
基因型
无偿献血
系统进化
Keywords
HIV-1
Genotype
Volunteer blood donors
Phylogenetic evolution
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
运用系统进化分析技术研究全国献血人群HIV感染特征
高占
王瑞
赵帅
冯毅
黄力勤
邵一鸣
王露楠
邢辉
葛红卫
潘彤
韩卫
朱绍汶
王芳
郑伟
释艳华
朱海峰
方建华
李维
何清
何敏
王鹏
曾劲峰
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2018
11
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