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题名不可分型流感嗜血杆菌外膜蛋白P6的生物信息学分析
被引量：1
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作者
马玉帅
张彦霞
孙皖如
常月立
王文栋
张玉妥
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机构
河北北方学院病原生物学教研室
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出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2019年第3期275-281,共7页
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基金
河北省高校科技研究重点项目(No.ZD2016030)
河北省教育厅青年基金项目(No.QN2015024)
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文摘
目的克隆不可分型流感嗜血杆菌ATCC49247外膜蛋白P6基因,并对其编码蛋白进行分析。方法以标准菌株ATCC49247NTHI DNA为模板,PCR扩增P6目的基因,构建重组质粒pGEX-6P2/P6并测序,利用生物信息软件和GenBank数据库对编码外膜蛋白P6进行同源性分析,预测其主要理化性质、结构功能、B细胞抗原表位和T细胞抗原表位。结果 ATCC49247 P6基因核苷酸序列长度为462 bp,与不可分型流感嗜血杆菌外膜蛋白P6基因核苷酸同源性为99.17%～100%,编码蛋白氨基酸同源性为96.18%～100%。编码蛋白含有153个氨基酸,相对分子质量为16.137 94×10~3,等电点6.09,为亲水性蛋白;该蛋白含有信号肽和3个结构域,无跨膜结构域;综合蛋白质的二级结构、亲疏水性、柔性、表面可及性和抗原指数预测该蛋白含有6个优势B细胞抗原表位,有7个CTL细胞抗原表位及16个Th细胞抗原表位。结论成功克隆外膜蛋白P6基因,生物信息学方法预测分析ATCC49247外膜蛋白P6高度保守,免疫原性强,可作为流感嗜血杆菌候选疫苗和疫苗载体。
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关键词
流感嗜血杆菌
外膜蛋白P6
重组质粒
生物信息学分析
同源性
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Keywords
Haemophilus influenzae
outer membrane protein p6
recombinant plasmid
bioinformatics analysis
homology
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分类号
R378.41
[医药卫生—病原生物学]
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