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通过加权基因共表达网络分析鉴定与慢性肾脏病相关急性心肌梗死的潜在关键基因
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作者 桑珍珍 饶欣 +5 位作者 郭杨 刘媛媛 仲爽 高杰 贾春梅 李勇 《岭南心血管病杂志》 CAS 2024年第3期256-263,共8页
目的本研究旨在识别慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)相关急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)的关键基因和信号通路。方法从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据。采用加权基因共表达... 目的本研究旨在识别慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)相关急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)的关键基因和信号通路。方法从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据。采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)确定CKD和AMI的枢纽模块,并将两个模块交叉确定与CKD相关AMI的共同基因。采用R软件筛选出CKD和AMI的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),将二者取交集得到交叉基因。结合WGCNA和差异分析的结果,得到与CKD和AMI相关的候选基因。将两者的候选基因取交集得到CKD相关AMI的关键基因。对与CKD相关AMI的交叉基因进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果通过WGCNA获得了CKD相关枢纽模块和AMI相关枢纽模块。将两个模块交叉,共获得12个共同基因。通过将CKD和AMI差异表达基因DEG取交集得到41个交叉基因。结合WGCNA和差异分析的结果,得出与CKD和AMI相关的候选基因,通过将候选基因交叉,共筛选出4个关键基因(DUSP1、FOS、RGS2、S100P)。根据功能富集分析,交叉基因主要在免疫和炎症相关通路中增强。结论本研究基于WGCNA方法筛选出CKD相关AMI的4个关键基因,可能成为潜在的CKD相关AMI诊疗相关候选靶点。 展开更多
关键词 心肌梗死 关键基因 慢性肾脏病
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老年2型糖尿病患者肌肉减少与低度微量白蛋白尿的相关性研究 被引量：3
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作者 张超虎 潘清蓉 +4 位作者 任小丽 杨彦娜 高淑欣 王广 陈哲 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2022年第3期264-268,共5页
目的探讨老年2型糖尿病患者肌肉减少与低度微量白蛋白尿(LGA)的关系。方法选择2019年5月~2020年1月首都医科大学附属北京朝阳医院内分泌科及三里屯社区卫生服务中心的老年2型糖尿病患者152例,根据LGA三分位数分为T1组51例(1.02 mg/g≤LG... 目的探讨老年2型糖尿病患者肌肉减少与低度微量白蛋白尿(LGA)的关系。方法选择2019年5月~2020年1月首都医科大学附属北京朝阳医院内分泌科及三里屯社区卫生服务中心的老年2型糖尿病患者152例,根据LGA三分位数分为T1组51例(1.02 mg/g≤LGA<7.12 mg/g)、T2组50例(7.12 mg/g≤LGA<13.54 mg/g)、T3组51例(13.54 mg/g≤LGA<29.90 mg/g)。收集各组一般临床资料,四肢肌肉质量指数(ASMI)、LGA等。采用logistic回归分析肌少症与LGA的关系。结果与T1组比较,T2组和T3组年龄、病程、LGA水平明显升高,ASMI和估算的肾小球滤过率明显降低,T3组白蛋白水平明显降低,差异有统计学意义(P<0.05);与T2组比较,T3组LGA水平明显升高,白蛋白水平明显降低,差异有统计学意义(P<0.05)。152例患者中,共检出肌少症15例(9.9%),T1组肌少症1例(2.0%),T2组肌少症2例(4.0%),T3组肌少症12例(23.5%),3组肌少症检出率比较,差异有统计学意义(P=0.001)。肌少症患者LGA水平明显高于非肌少症患者[21.87(20.50,28.10)mg/g vs 10.99(5.30,14.70)mg/g,P=0.001]。logistic回归分析显示,肌少症和病程是老年2型糖尿病患者LGA升高的独立危险因素(OR=11.456,95%CI:2.837~46.253,P=0.000;OR=1.343,95%CI:1.124~1.605,P=0.000)。Spearman相关性分析显示,糖尿病患者ASMI与LGA呈负相关(r=-0.274,P=0.001)。多元线性回归分析显示,肌肉减少、病程增加是导致LGA升高的危险因素(P=0.001)。ROC曲线分析显示,当LGA≥20.76 mg/g时,肌少症发病风险增加。结论在老年2型糖尿病患者中,肌肉减少是LGA增加的独立危险因素。当发现LGA≥20.76 mg/g时应警惕肌少症发生。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 肌减少症 白蛋白尿 肾小球滤过率
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