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题名对中东亚人群胃癌相关易感基因的挖掘
被引量：1
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作者
安覃景
李思思
韩崇旭
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机构
大连医科大学研究生院
江苏省苏北人民医院/扬州大学临床医学院临床医学检验中心
扬州大学医学院研究生院
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出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2019年第12期1409-1412,1416,共5页
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基金
国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2015CB755400)
江苏省苏北人民医院院级扶持技术项目(fcjs201748)
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文摘
目的筛选中东亚人群胃癌的易感基因,为胃癌的诊断和治疗提供新思路。方法在基因表达数据库(GEO)中进行检索,利用在线工具GEO2R筛选胃癌的差异表达基因,并对其进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号转导通路分析,最后利用STRING数据库对基因相关蛋白相互作用进行关联构建。结果本研究共纳入2个数据集,通过筛选得到40个差异表达基因,其中上调基因34个,下调基因6个,并首次发现ARHGAP11A基因与胃癌相关。通过对差异表达基因的分析发现,涉及的信号通路主要有白细胞转运蛋白迁移、p53信号通路、细胞周期等。结论利用生物信息学方法可有效地筛选出中东亚人群的胃癌易感基因,从而为胃癌发病机制的研究提供依据。
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关键词
胃癌
差异基因
信号通路
中东亚人群
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Keywords
gastric cancer
differential gene
signaling pathway
middle-east Asian population
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分类号
R735.2
[医药卫生—肿瘤]
Q34
[医药卫生—临床医学]
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