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利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL
被引量:
12
1
作者
徐剑文
刘剑光
+2 位作者
赵君
王希睿
肖松华
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期319-326,共8页
【目的】将群体分离分析法与下一代测序技术相结合,定位与棉花果枝长度关联的数量性状位点。【方法】以Ⅰ式果枝品系苏机棉125和Ⅱ式果枝品种泗抗1号为亲本,构建棉花F2分离群体。根据F2群体单株中部果枝节间平均长度,选择极端性状单株分...
【目的】将群体分离分析法与下一代测序技术相结合,定位与棉花果枝长度关联的数量性状位点。【方法】以Ⅰ式果枝品系苏机棉125和Ⅱ式果枝品种泗抗1号为亲本,构建棉花F2分离群体。根据F2群体单株中部果枝节间平均长度,选择极端性状单株分为2组,构建DNA混池。再对2个混池进行重测序,分析2个混池之间的单核苷酸多态性和插入缺失突变,并利用欧式距离法关联与果枝节间长度相关的数量性状位点。【结果】利用测序获得的单核苷酸多态性位点数据,在A3染色体上定位到1个与果枝节间长度关联的区域,区间范围为0.8Mbp;利用测序获得的缺失突变位点数据,也在A3染色体上定位到1个关联区域,区间范围为1.09Mbp;2个关联区域互相重合,重合区间为0.77Mbp。【结论】本研究中Ⅰ式果枝相关基因被定位在A3染色体上,说明棉花Ⅰ式果枝和〇式果枝的差异是因为遗传位点和模式的不同,而不是同一基因的剂量效应。
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关键词
棉花
株型育种
果枝长度
机采棉
QTL
下载PDF
职称材料
盐胁迫下棉花萌发、成苗和产量相关性状的QTL定位
被引量:
3
2
作者
徐剑文
孔杰
+7 位作者
赵君
王为然
刘剑光
朱家辉
王希睿
徐海江
肖松华
阿里甫.艾尔西
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第5期972-977,共6页
利用感盐棉花品种泗抗1号和耐盐棉花新品系苏S012为亲本配置杂交组合,构建F2分离群体和F2∶3家系。分别调查2个亲本和299个F2∶3家系萌发期、苗期以及铃质量、铃数、衣分和产量的盐害率,作为QTL定位的表型数据。在棉花A5、D5、D8、D10、...
利用感盐棉花品种泗抗1号和耐盐棉花新品系苏S012为亲本配置杂交组合,构建F2分离群体和F2∶3家系。分别调查2个亲本和299个F2∶3家系萌发期、苗期以及铃质量、铃数、衣分和产量的盐害率,作为QTL定位的表型数据。在棉花A5、D5、D8、D10、A13和D13染色体上共定位到13个耐盐相关QTL,分别解释2. 81%、15. 18%、1. 78%、5. 39%、2. 92%、8. 38%、9. 65%、5. 06%、0. 46%、2. 17%、2. 27%、13. 25%、1. 50%的表型变异率。
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关键词
棉花
耐盐性
分子标记
QTL定位
下载PDF
职称材料
题名
利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL
被引量:
12
1
作者
徐剑文
刘剑光
赵君
王希睿
肖松华
机构
江苏省
农业
科学院
经济作物
研究所
/
农业部
长江
中下游
棉花
和
油菜
重点
实验室
南京市标准化
研究
院
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期319-326,共8页
基金
国家自然科学基金(31701475)
江苏省自然科学基金(BK20170597)
+2 种基金
江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划(ZX(17)2013)
“十三五”国家重点研发计划(2016YFD0100203-5)
江苏省农科院基金(012066111622)
文摘
【目的】将群体分离分析法与下一代测序技术相结合,定位与棉花果枝长度关联的数量性状位点。【方法】以Ⅰ式果枝品系苏机棉125和Ⅱ式果枝品种泗抗1号为亲本,构建棉花F2分离群体。根据F2群体单株中部果枝节间平均长度,选择极端性状单株分为2组,构建DNA混池。再对2个混池进行重测序,分析2个混池之间的单核苷酸多态性和插入缺失突变,并利用欧式距离法关联与果枝节间长度相关的数量性状位点。【结果】利用测序获得的单核苷酸多态性位点数据,在A3染色体上定位到1个与果枝节间长度关联的区域,区间范围为0.8Mbp;利用测序获得的缺失突变位点数据,也在A3染色体上定位到1个关联区域,区间范围为1.09Mbp;2个关联区域互相重合,重合区间为0.77Mbp。【结论】本研究中Ⅰ式果枝相关基因被定位在A3染色体上,说明棉花Ⅰ式果枝和〇式果枝的差异是因为遗传位点和模式的不同,而不是同一基因的剂量效应。
关键词
棉花
株型育种
果枝长度
机采棉
QTL
Keywords
cotton
plant type breeding
fruit branch length
machine-harvested cotton
QTL
分类号
S562 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
盐胁迫下棉花萌发、成苗和产量相关性状的QTL定位
被引量:
3
2
作者
徐剑文
孔杰
赵君
王为然
刘剑光
朱家辉
王希睿
徐海江
肖松华
阿里甫.艾尔西
机构
江苏省
农业
科学院
经济作物
研究所
/
农业部
长江
中下游
棉花
和
油菜
重点
实验室
新疆
农业
科学院
经济作物
研究所
南京市标准化
研究
院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第5期972-977,共6页
基金
江苏省重点研发计划项目(BE2015353)
国家自然科学基金项目(31701475)
+3 种基金
"十三五"国家重点研发计划项目(2016YFD0100203-5)
江苏省自然科学基金项目(BK20170597)
江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2013)
江苏省农科院基金项目(012066111622)
文摘
利用感盐棉花品种泗抗1号和耐盐棉花新品系苏S012为亲本配置杂交组合,构建F2分离群体和F2∶3家系。分别调查2个亲本和299个F2∶3家系萌发期、苗期以及铃质量、铃数、衣分和产量的盐害率,作为QTL定位的表型数据。在棉花A5、D5、D8、D10、A13和D13染色体上共定位到13个耐盐相关QTL,分别解释2. 81%、15. 18%、1. 78%、5. 39%、2. 92%、8. 38%、9. 65%、5. 06%、0. 46%、2. 17%、2. 27%、13. 25%、1. 50%的表型变异率。
关键词
棉花
耐盐性
分子标记
QTL定位
Keywords
cotton
salt tolerance
molecular marker
QTL mapping
分类号
S562.035.3 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL
徐剑文
刘剑光
赵君
王希睿
肖松华
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019
12
下载PDF
职称材料
2
盐胁迫下棉花萌发、成苗和产量相关性状的QTL定位
徐剑文
孔杰
赵君
王为然
刘剑光
朱家辉
王希睿
徐海江
肖松华
阿里甫.艾尔西
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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