基于核酸适配体的生物传感技术检测食源性致病菌研究进展 被引量：5

1

作者 秦铭灿 田雪晴 +5 位作者 周俊栏 方再郗 周皓隆 高仁姣 吕明生 王淑军 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第13期5237-5243,共7页

食品供应的全球化导致食源性疾病传播快、分布广,严重威胁人类健康。病原检测需要特异性强和灵敏度高的方法。核酸适配体是可以识别并与多种类型靶标分子的单链DNA或RNA结合。基于核酸适配体的生物传感器特异性好、灵敏度高、易储存,为... 食品供应的全球化导致食源性疾病传播快、分布广,严重威胁人类健康。病原检测需要特异性强和灵敏度高的方法。核酸适配体是可以识别并与多种类型靶标分子的单链DNA或RNA结合。基于核酸适配体的生物传感器特异性好、灵敏度高、易储存,为食源性致病菌快速检测提供了新的方法。本文介绍了核酸适配体的特点和筛选技术,综述了基于核酸适配体的电化学、比色、荧光、表面增强拉曼散射和质量生物传感器技术的基本原理及其在食源性致病菌检测中的应用,以期为开发高效、精准检测食源致病菌技术提供参考。 展开更多

关键词 食源性致病菌 核酸适配体 生物传感器

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大菱鲆肠道乳杆菌Lactobacillus sp.N5的筛选鉴定及其抑制水产病原菌的研究 被引量：1

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作者 包瑞璇 周皓隆 +3 位作者 方再郗 卢静 吕明生 王淑军 《水产学杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期38-45,共8页

从大菱鲆(Scophthalmus maximus)肠道内分离出8株乳酸菌,经16S rDNA鉴定为Lactobacillus sp.,以对水产病原菌的抑制和对抗生素的敏感性为指标,研究乳酸菌的特性。其中,菌株N5对鳗弧菌(Vibrio anguillarum)、哈维氏弧菌(V.harveyi)、副... 从大菱鲆(Scophthalmus maximus)肠道内分离出8株乳酸菌,经16S rDNA鉴定为Lactobacillus sp.,以对水产病原菌的抑制和对抗生素的敏感性为指标,研究乳酸菌的特性。其中,菌株N5对鳗弧菌(Vibrio anguillarum)、哈维氏弧菌(V.harveyi)、副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)均具有较强的抑制作用,对氨苄青霉素、庆大霉素和罗红霉素敏感。菌株N5发酵上清液经加热、排酸和过氧化氢酶处理后,仍有抑菌作用;经蛋白酶处理后失去抑菌能力,推测菌株N5分泌的抑菌物质为耐热的乳酸菌素,其可以抑制病原菌生物膜的形成。菌株N5在凡纳对虾(Litopenaeus vannamei)肠道定植5 d后,加入鳗弧菌和哈维氏弧菌,继续养殖7 d,死亡率显著降低。本研究结果可为菌株N5制备水产养殖益生菌剂提供实验依据。 展开更多

关键词 乳酸菌 大菱鲆 水产病原菌 凡纳滨对虾 鳗弧菌

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耐盐菌Halomonas alimentaria NY处理高盐废水的研究 被引量：1

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作者 孟欣 张磊 +3 位作者 丁闻 田凤蓉 王开春 王淑军 《化工管理》 2023年第23期61-64,86,共5页

石油、医药和海水养殖等产业的废水具有高盐高氮的特点。采用物理化学法处理存在成本高和效率低的弊端,生物法具有成本低和无二次污染等优点。文章从连云港赣榆盐场沉积土中筛选出耐盐菌株NY,经过16S rDNA基因序列鉴定菌株NY为盐单胞菌(... 石油、医药和海水养殖等产业的废水具有高盐高氮的特点。采用物理化学法处理存在成本高和效率低的弊端,生物法具有成本低和无二次污染等优点。文章从连云港赣榆盐场沉积土中筛选出耐盐菌株NY,经过16S rDNA基因序列鉴定菌株NY为盐单胞菌(Halomonas alimentaria)。该菌生长的最适碳氮源分别为麦芽糖和酵母粉,最适生长温度和盐度分别为30℃和4%。在初始氮浓度为100~250 mg/L时,该菌能够在24 h内将硝酸盐(NO_(3)^(-))转化为亚硝酸盐(NO_(2)^(-)),硝酸盐的降解率均大于80%。该菌在高盐含氮废水的处理中具有较好的应用前景。 展开更多

关键词 高盐废水 耐盐菌 反硝化 高效转化

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半滑舌鳎肠道中抗氧化活性乳酸杆菌的筛选与鉴定 被引量：1

4

作者 郭东 包瑞璇 +3 位作者 王逸 卢静 吕明生 王淑军 《中国饲料》 北大核心 2022年第23期40-47,共8页

本研究从养殖的半滑舌鳎肠道中筛选乳酸菌,采用牛津杯法检测菌株抑制病原菌和对抗生素的敏感性,并对乳酸菌的抗氧化性及应用进行了研究。通过形态学和分子生物学鉴定,获得了三株乳酸杆菌CS1、CS2、CS4,都对氨苄青霉素钠和氯霉素敏感,发... 本研究从养殖的半滑舌鳎肠道中筛选乳酸菌,采用牛津杯法检测菌株抑制病原菌和对抗生素的敏感性,并对乳酸菌的抗氧化性及应用进行了研究。通过形态学和分子生物学鉴定,获得了三株乳酸杆菌CS1、CS2、CS4,都对氨苄青霉素钠和氯霉素敏感,发酵上清液对多株病原菌具有抑制能力。乳酸杆菌在pH 2~3和低浓度胆盐条件下均可生长。抑菌物质热稳定性好,可以被蛋白酶K降解,分子量在3~10 kDa。乳酸杆菌的抗氧化物质主要存在于发酵上清液中。在饲料中添加,乳酸杆菌和发酵上清液均可显著提高饲料的抗脂质过氧化能力。三株乳酸杆菌在水产动物养殖和饲料加工中具有一定的应用潜力。 展开更多

关键词 半滑舌鳎 肠道乳酸杆菌 抗菌 抗氧化 抗指质过氧化

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基于宏基因组技术分析产褥期新生儿肠道菌群变化的研究

5

作者 韩小飞 周俊栏 +3 位作者 赵岩 卢静 吕明生 王淑军 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2023年第5期664-673,共10页

目的研究影响产褥期新生儿肠道微生物群的建立过程中的因素。方法采用宏基因组技术,对不同喂养方式、出生方式和性别的4名在月子会所中产褥期新生儿肠道微生物生态系统形成的过程进行研究。结果新生儿肠道菌群多样性均明显增加,满月时... 目的研究影响产褥期新生儿肠道微生物群的建立过程中的因素。方法采用宏基因组技术,对不同喂养方式、出生方式和性别的4名在月子会所中产褥期新生儿肠道微生物生态系统形成的过程进行研究。结果新生儿肠道菌群多样性均明显增加,满月时新生儿肠道菌群中存在显著差异的纲为拟杆菌和放线菌(P<0.05)。母乳与婴儿配方奶粉间隔喂养的混合喂养的新生儿肠道中乳酸杆菌比例显著低于母乳喂养方式的新生儿。母乳喂养的新生儿肠道菌群多样性较低,而混合喂养的新生儿菌群结构则多样性高,拟杆菌、肠杆菌、梭菌的丰度高于母乳喂养的新生儿。在纲水平上,母乳喂养与混合喂养组肠道菌群中存在显著差异的菌为杆菌。满月时女婴肠道菌群物种组成与男婴相比更丰富、分布均匀度更高。结论喂养方式、分娩方式、性别均在不同程度上影响产褥期新生儿肠道微生物的构成。 展开更多

关键词 宏基因组技术 肠道菌群 新生儿 母乳喂养 混合喂养

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一种来自海洋细菌Virgibacillus sp.sp2T的豌豆蛋白加工蛋白酶 被引量：1

6

作者 魏桐 包瑞璇 +4 位作者 丁闻 吴广浩 卢静 吕明生 王淑军 《食品科技》 CAS 北大核心 2022年第6期8-15,共8页

蛋白酶的底物特异性是影响其应用的重要因素之一。以豌豆蛋白为底物筛选出了适用于其深加工的蛋白酶,该酶生产菌株为sp2T,通过16S rDNA鉴定为Virgibacillus sp。该菌最适生长条件为:蔗糖3 g/L、酵母粉10 g/L、pH7.5,25℃培养10 h;最适... 蛋白酶的底物特异性是影响其应用的重要因素之一。以豌豆蛋白为底物筛选出了适用于其深加工的蛋白酶,该酶生产菌株为sp2T,通过16S rDNA鉴定为Virgibacillus sp。该菌最适生长条件为:蔗糖3 g/L、酵母粉10 g/L、pH7.5,25℃培养10 h;最适产酶条件为:木薯淀粉3 g/L、鱼粉蛋白胨10 g/L、NaCl 10 g/L、干酪素10 g/L、初始pH10.0,35℃发酵36 h。豌豆蛋白经菌株sp2T产的蛋白酶酶解后,溶解性、乳化稳定性和抗氧化活性均显著提高;酶解产物对DPPH自由基、超氧阴离子和羟基自由基的IC_(50)分别为3、5 mg/mL和5 mg/mL。该蛋白酶在豌豆蛋白的深加工中具有潜在的应用价值。 展开更多

关键词 碱性蛋白酶 豌豆蛋白 海洋微生物 酶解产物 抗氧化活性

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海洋源乳酸菌细菌素及其在海产品中的应用研究进展

7

作者 唐海峰 刘欢 +5 位作者 戴昀峰 高腾琪 崔子杭 盘赛昆 王文彬 杨杰 《食品研究与开发》 CAS 2024年第7期188-195,共8页

海鲜在加工和储存过程中因酶、微生物和化学反应等因素极易发生腐烂变质。海洋源乳酸菌细菌素是由海洋乳酸菌核糖体合成的一种天然抗菌肽,能有效抑制多种食源性病原菌,将其用于海产品保鲜中可以减少化学防腐剂的添加以及物理处理的强度... 海鲜在加工和储存过程中因酶、微生物和化学反应等因素极易发生腐烂变质。海洋源乳酸菌细菌素是由海洋乳酸菌核糖体合成的一种天然抗菌肽,能有效抑制多种食源性病原菌,将其用于海产品保鲜中可以减少化学防腐剂的添加以及物理处理的强度,有效延长食品的保质期。该文综述海洋源乳酸菌细菌素来源、海产品中影响乳酸菌细菌素抗菌效果的因素及其在海产品中的应用研究进展,为海产品保鲜中乳酸菌细菌素的选择和应用提供参考。 展开更多

关键词 细菌素 天然防腐剂 海产品 应用方式 保鲜

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一株耐盐反硝化细菌的筛选、鉴定和特性及其产物四氢嘧啶的检测

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作者 翁南海 王焕宇 +3 位作者 张磊 田凤蓉 王开春 王淑军 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2335-2348,共14页

【背景】石化工业废水具有高盐含氮的特点,高盐度会对微生物代谢造成抑制,导致普通反硝化微生物难以在高盐环境下有效脱氮。【目的】筛选在高盐条件下仍能保持反硝化能力的菌株并研究其特性。【方法】富集筛选出一株耐盐反硝化细菌,对... 【背景】石化工业废水具有高盐含氮的特点,高盐度会对微生物代谢造成抑制,导致普通反硝化微生物难以在高盐环境下有效脱氮。【目的】筛选在高盐条件下仍能保持反硝化能力的菌株并研究其特性。【方法】富集筛选出一株耐盐反硝化细菌,对其进行生理生化特性和16S rRNA基因序列鉴定,对其生长条件进行优化并测定该菌株反硝化能力,对菌株在高盐环境下的产物进行定性定量分析。【结果】经鉴定菌株YA16-1为表皮短杆菌(Brevibacterium epidermidis),可对硝态氮进行反硝化作用,在盐度为3%、初始氮浓度为55 mg/L的条件下,18 h的硝态氮转化率达到97%;初始硝态氮浓度为250 mg/L时,24 h内硝态氮转化率达到100%。该菌株的最适生长条件为:2%NaCl,碳源为玉米芯粉,氮源为酵母粉,pH值为6.0,培养温度为30℃。菌株在盐度为2%-15%的培养基内生长良好。在15%盐度下,菌株通过产四氢嘧啶维持渗透压,产量为0.89 mg/mL。【结论】菌株YA16-1具有良好的耐盐能力和反硝化能力,在高盐废水处理、保护生态环境和四氢嘧啶的制备具有潜在的应用价值。 展开更多

关键词 反硝化细菌 耐盐菌 高盐含氮废水 四氢嘧啶

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枯草芽孢杆菌中bacilosarcin B对美人鱼发光杆菌的抑菌机理 被引量：2

9

作者 唐海峰 戴昀峰 +6 位作者 扶洋帆 邹一明 高占 盘赛昆 王文彬 杨杰 卞小莹 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期419-432,共14页

【背景】美人鱼发光杆菌(Photobacteriumdamselae)是一种海洋条件致病菌,能够引起多种海洋生物和人类疾病。因此,探究美人鱼发光杆菌的生物防治技术具有重要意义。【目的】探究枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中bacilosarcin B对美人... 【背景】美人鱼发光杆菌(Photobacteriumdamselae)是一种海洋条件致病菌,能够引起多种海洋生物和人类疾病。因此,探究美人鱼发光杆菌的生物防治技术具有重要意义。【目的】探究枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中bacilosarcin B对美人鱼发光杆菌的抑菌活性及其可能的抑菌机理。【方法】利用高效液相色谱法从枯草芽孢杆菌fmb60发酵液中制备bacilosarcin B,采用分光光度法测定bacilosarcinB对多种致病菌的最小抑菌浓度及其对美人鱼发光杆菌的时间-抑菌曲线。测定bacilosarcin B对美人鱼发光杆菌生物被膜、胞外核酸、蛋白质和胞内碱性磷酸酶含量的影响,结合荧光显微镜、扫描电镜和透射电镜检测美人鱼发光杆菌细胞膜通透性和细胞壁完整性,并研究bacilosarcin B对细菌运动能力和胞内DNA的作用。【结果】Bacilosarcin B对美人鱼发光杆菌最小抑菌浓度为8μg/mL。抑菌机理研究表明bacilosarcin B通过破坏细菌细胞壁和细胞膜的完整性使细胞膜通透性增强,造成细胞内成分渗出。此外,bacilosarcinB还可与胞内DNA结合,且结合方式与溴化乙锭(ethidium bromide,EB)插入DNA结构类似。【结论】Bacilosarcin B对美人鱼发光杆菌具有显著的抑菌效果,具有研发成新型抑菌剂的潜力,对海洋养殖业的健康发展具有一定的意义。 展开更多

关键词 bacilosarcin B 美人鱼发光杆菌 细胞膜 抑菌机理

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亚麻籽油替代鱼油对大黄鱼生长性能和肌肉代谢能力的影响

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作者 陈圣娣 孙子涵 +5 位作者 谭朋 刘宁宁 阎斌伦 高焕 张庆起 牟华 《饲料研究》 CAS 北大核心 2024年第18期49-57,共9页

试验旨在探究亚麻籽油替代鱼油对大黄鱼生长性能、饲料利用及肌肉代谢能力的影响。选取360尾初重为(3.89±0.01)g的大黄鱼随机分为两组,每组3个重复,每个重复60尾鱼,配制两种等氮等脂饲料,即鱼油组(FO组,鱼油添加量6%)和亚麻籽油组... 试验旨在探究亚麻籽油替代鱼油对大黄鱼生长性能、饲料利用及肌肉代谢能力的影响。选取360尾初重为(3.89±0.01)g的大黄鱼随机分为两组,每组3个重复,每个重复60尾鱼,配制两种等氮等脂饲料,即鱼油组(FO组,鱼油添加量6%)和亚麻籽油组(LO组,亚麻籽油完全替代鱼油)。试验期10 w。结果显示,LO组大黄鱼末重和增重率显著低于FO组(P<0.05),饲料系数显著高于FO组(P<0.05)。与FO组相比,LO组肌肉中亚油酸和α-亚麻酸含量显著升高(P<0.05),二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)含量显著下降(P<0.05)。亚麻籽油替代鱼油显著影响了肌肉腺苷酸活化蛋白激酶/沉默信息调节因子1/过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α(AMPK/SIRT1/PGC-1α)通路及糖脂代谢相关基因表达(P<0.05)。LO组肌肉中乳酸脱氢酶活性及葡萄糖-6-磷酸和乳酸含量显著高于FO组(P<0.05),柠檬酸合酶和细胞色素c氧化酶活性显著低于FO组(P<0.05)。研究表明,亚麻籽油完全替代鱼油抑制了大黄鱼生长性能和饲料利用,降低了肌肉EPA和DHA含量,引起了肌肉AMPK/SIRT1/PGC-1α通路基因表达以及线粒体有氧代谢能力的下降。 展开更多

关键词 大黄鱼 亚麻籽油 鱼油 生长性能 肌肉代谢能力

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半滑舌鳎rimoc1基因在雌雄鱼中的差异表达

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作者 孙宇轩 张梦倩 +2 位作者 李璐 魏敏 徐文腾 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第4期34-42,共9页

动物中普遍存在性别生长二态性,这种现象在海水鱼中更为明显。半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)性成熟雌鱼体重显著高于雄鱼,雌性个体的生长速度比雄性快2~4倍。本研究旨在探究rimoc1基因在半滑舌鳎雌、雄鱼中的表达差异及与性别和生... 动物中普遍存在性别生长二态性,这种现象在海水鱼中更为明显。半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)性成熟雌鱼体重显著高于雄鱼,雌性个体的生长速度比雄性快2~4倍。本研究旨在探究rimoc1基因在半滑舌鳎雌、雄鱼中的表达差异及与性别和生长的关系。实时定量和原位杂交结果显示,rimoc1在雄性组织中未检测到表达,而在雌性组织中表达量最高的是卵巢和肌肉,在卵巢中表达相对稳定,在孵化后1.5年(1.5yph)和3yph的水平有所增加。在细胞系中通过si RNA干扰敲除rimoc1后,发现生长相关基因igf1、性别分化相关基因sox9b和foxl2的表达水平显著降低,而sox9a的表达升高。启动子活性分析显示,rimoc1启动子可能受到C/EBPdelta、Sox2和c-Jun等转录因子的调控。推测rimoc1可能在半滑舌鳎的性别分化和生长中发挥重要作用,为深入研究半滑舌鳎的性别生长二态性提供了基础。 展开更多

关键词 半滑舌鳎 rimoc1 性别生长二态性 表达模式 启动子活性 RNA干扰

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有害赤潮藻赤潮异弯藻Heterosigma akashiwo研究进展 被引量：2

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作者 姬南京 张珍珍 +1 位作者 黄金旺 申欣 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期127-136,共10页

浮游植物不仅在食物链中充当贡献者,也在生物地球化学循环过程中扮演着重要角色,然而一些种类在某些条件下暴发性增殖或聚集,形成有害藻华,对人类健康和生态系统构成威胁。赤潮异弯藻是形成有害藻华的典型物种,其藻华发生时会造成养殖... 浮游植物不仅在食物链中充当贡献者,也在生物地球化学循环过程中扮演着重要角色,然而一些种类在某些条件下暴发性增殖或聚集,形成有害藻华,对人类健康和生态系统构成威胁。赤潮异弯藻是形成有害藻华的典型物种,其藻华发生时会造成养殖鱼类大面积死亡,给水产养殖业造成巨大损失。近年来,随着全球气候变暖、水体富营养化程度日趋严重,有害藻华发生的规模和频次总体呈增加趋势,且相关研究表明气候变暖和二氧化碳水平升高均能刺激赤潮异弯藻的生长。本文主要从赤潮异弯藻物种鉴定、基础生物学研究、生态学研究等几个方面综述了该物种的研究进展,并对其未来研究方向进行了相关展望,以期为赤潮异弯藻的藻华形成机制研究、藻华防治等工作提供参考。 展开更多

关键词 有害藻华 赤潮异弯藻 气候变化 形成机制

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氨氮胁迫对锦绣龙虾代谢酶和抗氧化酶活力的影响 被引量：2

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作者 周钱森 任宪云 +2 位作者 徐垚 刘萍 李健 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2022年第2期147-156,共10页

为了研究急性氨氮胁迫对锦绣龙虾(Panulirus ornatus)抗氧化系统及氨氮代谢机制的影响,通过设置对照[(0.24±0.07)mg/L]、低浓度[(1.04±0.08)mg/L]、中浓度[(9.75±0.21)mg/L]和高浓度[(19.87±0.46)mg/L]氨氮胁迫方... 为了研究急性氨氮胁迫对锦绣龙虾(Panulirus ornatus)抗氧化系统及氨氮代谢机制的影响,通过设置对照[(0.24±0.07)mg/L]、低浓度[(1.04±0.08)mg/L]、中浓度[(9.75±0.21)mg/L]和高浓度[(19.87±0.46)mg/L]氨氮胁迫方法对锦绣龙虾进行48 h急性实验,测定鳃与肝胰腺中抗氧化及氨氮代谢酶的活性,同时测定相关基因mRNA的相对表达变化情况。结果显示,氨氮胁迫下锦绣龙虾鳃和肝胰腺组织总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化(SOD)活力有不同程度的升高,6~12h均显著高于对照组(P<0.05);高浓度组胁迫48h时T-AOC、SOD活力则均被抑制;过氧化脂质(LPO)含量随胁迫时间的延长逐渐增加,48 h均显著高于对照组(P<0.05)。氨代谢相关酶谷氨酰胺合成酶(GS)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、谷草转氨酶(GOT)、黄嘌呤氧化还原酶(XOD)的酶活在氨氮胁迫下与对照组相比均有不同程度的上调,表明其共同参与离子氨的代谢转运。肝胰腺中GDH、GOT基因表达量在12~24h显著高于对照组(P<0.05),在鳃组织中变化趋势基本相同。由此可见,不同浓度的氨氮胁迫会对锦绣龙虾抗氧化酶活性造成不同程度的诱导;锦绣龙虾主要通过在肝胰腺GS、GDH等代谢相关酶的共同作用下合成无毒的谷氨酰胺以避免氨在体内过量积累。本研究结果可为锦绣龙虾氨解毒代谢机制的深入研究提供理论依据。 展开更多

关键词 锦绣龙虾 氨氮胁迫 抗氧化 氨代谢酶

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夜光藻高效培养方法建立及其有性繁殖发生机制的初步研究

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作者 王君玥 徐名扬 +4 位作者 张慧敏 张珍珍 申欣 顾海峰 姬南京 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期89-96,共8页

夜光藻(Noctiluca scintillans)是典型的赤潮生物,在世界多个海域形成过大面积赤潮,对海洋生态系统构成一定的威胁。夜光藻赤潮的发生不仅受外界环境因子的影响,其有性繁殖的方式在赤潮发生过程中也起着重要作用。本研究从连云港海域分... 夜光藻(Noctiluca scintillans)是典型的赤潮生物,在世界多个海域形成过大面积赤潮,对海洋生态系统构成一定的威胁。夜光藻赤潮的发生不仅受外界环境因子的影响,其有性繁殖的方式在赤潮发生过程中也起着重要作用。本研究从连云港海域分离获得一株夜光藻,利用自行设计的饵料藻投喂装置,以天然海水为培养基,在温度20~25℃范围内实现了夜光藻的室内长期培养,并观察记录了夜光藻配子发生全过程。研究结果表明,夜光藻不同生长阶段培养体系中配子母细胞与营养细胞密度变化趋势基本一致,显示夜光藻的有性繁殖发生与种群丰度存在一定的相关性,但它们之间的因果关系还有待进一步探讨。本研究结果加深了对夜光藻有性繁殖的认识,有助于阐明其种群增长模式,并深入理解其赤潮暴发机制。 展开更多

关键词 赤潮 夜光藻 有性繁殖 配子母细胞

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深海囊螂蛤铁蛋白的环境选择压力分析

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作者 孔雪 王玮 +4 位作者 蔡月凤 李亚男 张驰乐 张海滨 申欣 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期533-544,共12页

深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种,拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析,以... 深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种,拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析,以期解析其适应深海特殊生境(高铁环境、高静水压)的机制。通过本地比对的方式获得了囊螂蛤和其近缘种铁蛋白的核苷酸和氨基酸序列,其均有ferritin保守功能域和相应的保守位点。其中,囊螂蛤铁蛋白Cmfer-2、Cmagfer-3、Pofer-3属于M型铁蛋白,其他归属为H型铁蛋白。Cmagfer-4和Pofer-4可初步判断为分泌型铁蛋白,而其他囊螂蛤铁蛋白与胞质型铁蛋白聚为一支。为了探索环境因素对深海贝类铁蛋白的影响,运用PAML软件对深浅海铁蛋白进行了选择压力分析。结果显示总共鉴定到8个正选择位点,其后验概率大于95%。其中,在含有嗜压氨基酸的对应组中,约50%浅海位点置换为嗜压的氨基酸,进一步证明了17A、55R、171S氨基酸置换是铁蛋白适应深海压力变化的一种策略。更进一步研究发现69K→I/T/M和171E/K→S由带电荷的极性氨基酸置换为不带电荷的氨基酸,并且大部分受到选择的位点位于蛋白的N端和C端,深海囊螂蛤铁蛋白可能通过特定氨基酸极性的转变和分布区域的改变来适应深海特殊环境。本文通过深浅海贝类铁蛋白的分析来为深海生物对极端环境的适应研究提供一些信息和见解。 展开更多

关键词 铁蛋白 冷泉热液区 正选择 囊螂蛤

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脊尾白虾Dnmt2启动子克隆及其转录调控分析

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作者 宋崇阳 张思勉 +6 位作者 李永闯 张攀 赖晓芳 王攀攀 于飞 高焕 阎斌伦 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期95-103,共9页

为探明脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)Dnmt2(DNA methyltransf-erase2,Dnmt2)启动子对Dnmt2转录的调控作用,本研究利用染色体步移技术克隆得到脊尾白虾Dnmt2启动子,使用在线软件预测该基因启动子区域的转录调控元件及转录因子结合位... 为探明脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)Dnmt2(DNA methyltransf-erase2,Dnmt2)启动子对Dnmt2转录的调控作用,本研究利用染色体步移技术克隆得到脊尾白虾Dnmt2启动子,使用在线软件预测该基因启动子区域的转录调控元件及转录因子结合位点,通过构建一系列缺失表达载体,利用双荧光素酶报告基因检测技术鉴定了该基因核心启动子区,并对其启动子活性进行检测。结果表明,克隆的脊尾白虾Dnmt2启动子长度为1315 bp,转录起始位点“A”位于ATG上游236 bp,启动子区域含有多种转录因子结合位点,包括STAT3、SOX、NF-κB、E2F、GATA-1等,但缺乏CpG岛。双荧光素酶报告基因检测显示,Dnmt2核心启动子区位于-196~+81bp,对启动子区域进行活性检测发现,在该基因启动子-640~-452bp区域内可能存在促进基因表达的转录调控元件,而在-1160~-640bp区域可能存在抑制该基因表达的转录调控元件。本研究结果为进一步研究Dnmt2启动子的表达调控机制提供理论依据。 展开更多

关键词 脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda) Dnmt2 核心启动子 启动子活性 转录调控元件

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