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基于平均核苷酸相似度和16S rDNA技术对全球沙门氏菌的鉴定比对分析
1
作者 华苗苗 曹小利 +1 位作者 胡金曹 沈瀚 《临床检验杂志》 CAS 2024年第5期363-369,共7页
目的评估平均核苷酸相似度(average nucleotide identity,ANI)和16S rDNA技术对沙门氏菌的鉴定能力。方法从GenBank数据库批量下载全球沙门氏菌基因组和相应血清型,以沙门氏菌典型菌株的基因组作为分型菌株。利用fastANI软件,根据默认... 目的评估平均核苷酸相似度(average nucleotide identity,ANI)和16S rDNA技术对沙门氏菌的鉴定能力。方法从GenBank数据库批量下载全球沙门氏菌基因组和相应血清型,以沙门氏菌典型菌株的基因组作为分型菌株。利用fastANI软件,根据默认参数进行ANI分析。使用在线软件SpeciesFinder针对细菌的16S rDNA进行物种和血清型鉴定。结果在下载的2306个基因组中,1767株沙门氏菌存在178种血清型,以鼠伤寒沙门菌323株(18.3%)和肠炎沙门菌300株(17.0%)最为常见。ANI分析显示,以95%为界值时,仅有30株(1.3%)沙门氏菌被分配到1个特定的亚种,其余2276株(98.7%)沙门氏菌均可分配到2~5个亚种;以97%为界值时,2306株(100%)沙门氏菌均可被鉴定到唯一的亚种。基于16S rDNA的分析仅鉴定出1072株(46.5%)沙门氏菌,其中95.2%(1021/1072)的沙门氏菌鉴定的亚种结果与ANI(≥97%)分析鉴定的结果完全一致;与已知的血清型相比,仅有2.4%(19/784)的沙门氏菌与已知的血清型结果一致。结论ANI更适合沙门氏菌的种及亚种鉴定,ANI≥97%可作为沙门氏菌亚种的鉴定标准。16S rDNA技术对于沙门氏菌鉴定的敏感性尚有待提高。 展开更多
关键词 沙门氏菌 鉴定 亚种 血清型 平均核苷酸相似度 16S rDNA
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Sysmex XE-2100全自动血细胞分析仪血小板聚集报警信息可靠性分析 被引量：7
2
作者 张黎蕾 张葵 《临床输血与检验》 CAS 2012年第1期60-61,共2页
目的探讨Sysmex XE-2100全自动血细胞分析仪(简称XE-2100血细胞分析仪)血小板聚集报警信息(Clumps)的可靠性分析。方法对XE-2100血细胞分析仪检测到血小板聚集阳性报警的61份标本和未报警的阴性60份标本分别制作血涂片,经瑞氏-吉姆萨染... 目的探讨Sysmex XE-2100全自动血细胞分析仪(简称XE-2100血细胞分析仪)血小板聚集报警信息(Clumps)的可靠性分析。方法对XE-2100血细胞分析仪检测到血小板聚集阳性报警的61份标本和未报警的阴性60份标本分别制作血涂片,经瑞氏-吉姆萨染色后,人工镜检确认是否存在血小板聚集,最后计算出XE-2100血细胞分析仪检测血小板聚集的敏感性、特异度、准确性。结果以人工显微镜检查为金标准,XE-2100血细胞分析仪血小板聚集报警的敏感度(即真阳性率)为78.3%,特异性(即真阴性率)为56.1%,准确度为60.3%。结论先进的仪器无法准确替代人工显微镜检查,XE-2100全自动血液分析仪血小板聚集报警信息可以作为血常规分析中出现血小板聚集的参考,对于可疑标本都应进行人工复检。 展开更多
关键词 SYSMEX XE-2100 血细胞分析仪 血小板聚集 显微镜检查
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合格献血者血浆HBV残留情况分析 被引量：4
3
作者 李平 刘勇 +3 位作者 李翠萍 毕永春 张葵 周乙华 《临床输血与检验》 CAS 2008年第4期293-296,共4页
目的调查合格献血者血浆残留HBV的阳性率,评估输血后HBV感染风险。方法收集945份合格献血者的血浆,采用ELISA法检测HBV核心抗体(抗-HBc);提取血浆DNA,采用巢式PCR方法检测HBV DNA。结果血浆标本以1∶5稀释后抗-HBc阳性率为19.68%,而1∶5... 目的调查合格献血者血浆残留HBV的阳性率,评估输血后HBV感染风险。方法收集945份合格献血者的血浆,采用ELISA法检测HBV核心抗体(抗-HBc);提取血浆DNA,采用巢式PCR方法检测HBV DNA。结果血浆标本以1∶5稀释后抗-HBc阳性率为19.68%,而1∶50稀释后阳性率则为2.33%。共检测出HBV DNA阳性标本3例,其中1例抗-HBc阳性,另外2例抗-HBc为阴性。合格献血者中隐匿性HBV感染率约为0.32%。结论我国合格献血者标本中仍有部分血浆有HBV残留,抗-HBc阳性标本中HBV DNA阳性率较抗-HBc阴性标本高,应引起重视。 展开更多
关键词 合格献血者 乙型肝炎病毒核酸 抗-HBC 巢式PCR
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3-乙酰吲哚纸片法在呼吸道标本分离卡他莫拉菌中的应用 被引量：4
4
作者 张之烽 沈瀚 宁明哲 《临床输血与检验》 CAS 2009年第1期64-65,共2页
目的建立快速鉴定卡他莫拉菌(MC)的方法,并了解呼吸道感染患者中该菌的检出情况。方法采用3-乙酰吲哚纸片法检测MC,对呼吸道标本可疑菌落进行筛选,并用已知菌种进行测试比较。结果该方法检测MC敏感性为100.0%,与近缘菌比较特异性为100.0... 目的建立快速鉴定卡他莫拉菌(MC)的方法,并了解呼吸道感染患者中该菌的检出情况。方法采用3-乙酰吲哚纸片法检测MC,对呼吸道标本可疑菌落进行筛选,并用已知菌种进行测试比较。结果该方法检测MC敏感性为100.0%,与近缘菌比较特异性为100.0%。结论3-乙酰吲哚纸片法鉴定MC方法可靠,值得在临床实验室推广应用。 展开更多
关键词 卡他莫拉菌 细菌分离技术 吲哚类 Β内酰胺酶类 呼吸道感染
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荚膜多糖在肺炎克雷伯杆菌中的研究进展 被引量：3
5
作者 陈菲 沈瀚 曹小利 《临床输血与检验》 CAS 2018年第3期330-332,共3页
肺炎克雷伯杆菌(klebsiella pneumoniae,KP)是医院和社区获得性感染的病原体。近年来,耐碳青酶烯类肺炎克雷伯杆菌(carbapenem-resistant K.pneumoniae,CRKP)广泛播散。研究报道,荚膜多糖(capsular polysaccharide,CPS)在细菌的耐药进... 肺炎克雷伯杆菌(klebsiella pneumoniae,KP)是医院和社区获得性感染的病原体。近年来,耐碳青酶烯类肺炎克雷伯杆菌(carbapenem-resistant K.pneumoniae,CRKP)广泛播散。研究报道,荚膜多糖(capsular polysaccharide,CPS)在细菌的耐药进化发展中起到重要作用。CPS的研究对于由CRKP引起的感染控制意义重大。该文阐述了CPS的结构、生物学功能以及在KP的耐药性、致病性和适应性等方面的作用。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯杆菌 荚膜多糖 耐药
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头孢西丁不敏感大肠埃希菌的耐药性及质粒型AmpC酶基因分析 被引量：3
6
作者 徐学静 曹小利 +4 位作者 张之烽 沈翰 宁明哲 周万青 张葵 《临床输血与检验》 CAS 2015年第1期12-14,共3页
目的 对107株头孢西丁不敏感大肠埃希菌的耐药特点及质粒型AmpC酶基因的流行性进行分析。方法 使用WHONET5.6软件分析2012年4~9月头孢西丁不敏感大肠埃希菌的耐药性,并与同期分离的头孢西丁敏感大肠埃希菌的耐药性进行比对分析;PCR扩增... 目的 对107株头孢西丁不敏感大肠埃希菌的耐药特点及质粒型AmpC酶基因的流行性进行分析。方法 使用WHONET5.6软件分析2012年4~9月头孢西丁不敏感大肠埃希菌的耐药性,并与同期分离的头孢西丁敏感大肠埃希菌的耐药性进行比对分析;PCR扩增和DNA测序分析blaDHA、blaACT、blaCMY、blaFOX等质粒型AmpC酶基因的流行性。结果 头孢西丁不敏感大肠埃希菌对阿米卡星,第三、四代头孢菌素和氟喹诺酮类等药物均具有较高的耐药性（P〈0.05）。25株（23.3%）细菌携带质粒型ApmC酶基因。其中23株为blaCMY基因（17株为blaCMY-2,6株为blaCMY-42）,2株为blaDHA-1。结论 头孢西丁不敏感大肠埃希菌对多种抗菌药物具有较高的耐药性,且有质粒型AmpC酶基因的广泛流行,应加强监护,预防播散。 展开更多
关键词 AMPC酶 头孢西丁 耐药性 大肠埃希菌
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H7N9患者感染碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌的同源性分析 被引量：2
7
作者 张之烽 周万青 +4 位作者 宁明哲 沈瀚 沈黎 李阳 姜亦虹 《临床输血与检验》 CAS 2014年第2期118-121,共4页
目的探讨H7N9患者感染碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌菌株的同源性及传播机制。方法收集自H7N9感染患者、同期ICU病房其他患者及环境中分离的多重耐药鲍曼不动杆菌;采用K-B纸片法测定菌株对常规药物的敏感性;脂稀释法测定其对多粘菌素B的MI... 目的探讨H7N9患者感染碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌菌株的同源性及传播机制。方法收集自H7N9感染患者、同期ICU病房其他患者及环境中分离的多重耐药鲍曼不动杆菌;采用K-B纸片法测定菌株对常规药物的敏感性;脂稀释法测定其对多粘菌素B的MIC;EDTA协同试验测定金属酶表型;采用PCR法测定耐药基因;PFGE法分析菌株的流行病学特征。结果临床分离株与环境分离株具有相似的药敏谱,均对阿米卡星和多粘菌素B敏感,对其他抗菌药物耐药,包括碳青霉烯类药物;金属酶表型试验为阴性;所有菌株均扩增出OXA-23和OXA-51基因;PFGE电泳分析显示H7N9患者分离株与其他患者分离株及环境分离株为同一克隆。结论 H7N9患者所感染的多重耐药鲍曼不动杆菌为院内感染菌株,对碳青霉烯类药物耐药主要由OXA-23基因介导。 展开更多
关键词 H7N9 碳青霉烯 鲍曼不动杆菌 耐药性 同源性
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临床标本酵母样真菌的检出分析
8
作者 张之烽 唐秀英 《宁夏医学杂志》 CAS 1998年第6期376-377,共2页
目的探讨临床标本酵母样真菌的检出。方法统计分析了两年来临床各类标本所检出的酵母样真菌分离株。结果各类标本检出的酵母样真菌达26种，其中来自呼吸道标本的酵母样真菌种类最多。念珠菌属仍处于绝对优势地位，占95．7％，检出最多... 目的探讨临床标本酵母样真菌的检出。方法统计分析了两年来临床各类标本所检出的酵母样真菌分离株。结果各类标本检出的酵母样真菌达26种，其中来自呼吸道标本的酵母样真菌种类最多。念珠菌属仍处于绝对优势地位，占95．7％，检出最多的是白色念珠菌（62．3％），其次为热带念珠菌（11．1％）。结论不同年龄组的统计结果表明，酵母样真菌的检出率随年龄的上升而增高，以老年人的检出率最高。 展开更多
关键词 感染 酵母样真菌 临床标本 检出率 老年人
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由伴放线凝聚杆菌引起的细菌性心内膜炎患者1例 被引量：1
9
作者 张之烽 周万青 《临床输血与检验》 CAS 2015年第5期467-468,共2页
苛养性细菌是一类生长需要特殊营养物质的细菌，与许多感染性疾病有关，其分离较为困难，在常规培养基生长困难或不生长，嗜CO2或微需氧，而且可能需要长时间的培养才能检测到其生长。目前由这类细菌引起的感染随着微生物实验室水平的... 苛养性细菌是一类生长需要特殊营养物质的细菌，与许多感染性疾病有关，其分离较为困难，在常规培养基生长困难或不生长，嗜CO2或微需氧，而且可能需要长时间的培养才能检测到其生长。目前由这类细菌引起的感染随着微生物实验室水平的提高，正越来越多地被发现。笔者发现1例心脏瓣膜病患者由苛养性细菌伴放线凝聚杆菌引发的细菌性心内膜炎，现报告如下。 展开更多
关键词 感染性心内膜炎 伴放线凝聚杆菌
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289株重症监护病房鲍曼不动杆菌耐药性分析
10
作者 朱宏 沈瀚 +3 位作者 周万青 宁明哲 张之烽 张葵 《临床输血与检验》 CAS 2012年第2期166-167,共2页
目的了解医院重症监护病房(ICU)鲍曼不动杆菌(ABA)对常用抗菌药物的耐药性,及耐药性的变化情况。方法采用纸片扩散(K-B)法检测本院ICU2008～2010年临床分离的289株鲍曼不动杆菌对11种抗菌药物的耐药性。结果 3年中11种抗菌药物中,头孢哌... 目的了解医院重症监护病房(ICU)鲍曼不动杆菌(ABA)对常用抗菌药物的耐药性,及耐药性的变化情况。方法采用纸片扩散(K-B)法检测本院ICU2008～2010年临床分离的289株鲍曼不动杆菌对11种抗菌药物的耐药性。结果 3年中11种抗菌药物中,头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南的耐药率分别从2008年的40.0%和46.7%上升到2010年的64.3%和82.6%。结论 ICU分离的ABA耐药性较高且呈上升趋势。 展开更多
关键词 重症监护病房 鲍曼不动杆菌 耐药性
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