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弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关基因与患者预后及肿瘤浸润性免疫细胞比例的相关性 被引量：3
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作者 郭佳丽 潘晨华 +3 位作者 李依 刘晓倩 蒋慧 常伟 《山东医药》 CAS 2023年第3期33-36,共4页
目的筛选出弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因,明确预后相关基因表达水平与DLBCL患者预后及肿瘤浸润性免疫细胞(TICs)比例的关系,为DLBCL治疗提供新的靶点。方法从GEO中获取GSE56315、GSE12453和GSE87371芯片数据,用R的“limma”包... 目的筛选出弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因,明确预后相关基因表达水平与DLBCL患者预后及肿瘤浸润性免疫细胞(TICs)比例的关系,为DLBCL治疗提供新的靶点。方法从GEO中获取GSE56315、GSE12453和GSE87371芯片数据,用R的“limma”包筛选出DLBCL预后相关基因。将GSE87371数据集中的预后相关基因根据表达量中位值分为高、低表达组,从R语言的“survival”包中提取高、低表达组5年OS率及95%CI,然后利用COX风险回归模型分析预后相关基因与预后的相关性,使用R语言的“for”循环分析预后不良相关基因与DLB-CL患者年龄、性别、临床分期等临床参数的关系。通过GSEA富集分析DLBCL预后相关基因在DLBCL中的相关信号通路。最后利用CIBERSORT算法计算DLBCL组织中TICs的比例,并分析预后相关基因表达水平与TICs比例的关系。结果对GSE12353及GSE56315进行合并后的MERGE基因集进行筛选后获得DLBCL组织与正常组织的差异表达基因445个(上调基因301个,下调基因143个),从GSE87371数据集获得DLBCL预后相关基因57个(负相关17个,正相关40个),将上调的301个差异表达基因与负相关的17个基因取交集,获得膜连蛋白1(ANXA1),即为DLBCL预后相关基因。ANXA1高表达组5年OS率3.56%,95%CI 1.17%~10.7%,低表达组5年OS率17.49%,95%CI为11.8%~29.9%,ANXA1高表达组DLBCL患者5年OS率低于低表达组(P<0.001);ANXA1为DLBCL独立预后影响因子(P<0.05);ANXA1表达水平与患者临床参数无相关性(P>0.05)。ANXA1在趋化因子信号通路、MAPK信号通路、ECM受体相互作用、JAK-STAT信号通路等通路上富集。DLBCL组织中T细胞和巨噬细胞比例较大,分别为49%、31%;ANXA1表达水平与巨噬细胞M2、浆细胞、活性CD4+记忆T细胞、CD8+T细胞、γδT细胞比例正相关(P均<0.001)。结论DLBCL预后相关基因为ANXA1,ANXA1表达水平高与DLBCL患者预后不良及肿瘤免疫浸润细胞比例相关,富集的信号通路主要有� 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 ANXA1 肿瘤免疫浸润细胞
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