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题名南方红豆杉bHLH基因克隆与序列分析
被引量：10
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作者
周华
朱祺
杨艳芳
刘洪伟
余发新
邱德有
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机构
江西省观赏植物遗传改良重点实验室、江西省科学院生物资源研究所
林木遗传育种国家重点实验室、中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室
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出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期52-59,共8页
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基金
江西省观赏植物遗传改良重点实验室开放课题基金(2011-KLB-02)
国家自然科学基金资助项目(31300567
31170628)资助
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文摘
以南方红豆杉为试材,利用RT-PCR方法从南方红豆杉c DNA中克隆了一个b HLH转录因子——Tc MYC,Gen Bank注册号为KC878013。通过生物信息学分析,发现该基因全长1 959 bp,编码一个650个氨基酸残基的亲水蛋白;Tc MYC相对分子量为71.4 k D,等电点p I为4.87。推测所克隆Tc MYC基因编码的蛋白定位于细胞核中,含有一个螺旋—环—螺旋结构,与东北红豆杉、葡萄和烟草的MYC基因编码的蛋白序列一致性分别为98%、45%和44%,进化树分析表明同科属植物的MYC转录因子归为一类,红豆杉的MYC与其他草本被子植物的MYC转录因子亲缘关系都较远。在茉莉酸甲酯诱导的红豆杉细胞中,Tc MYC基因表达呈现略微下降趋势,推测Tc MYC可能负向调控紫杉醇生物合成,为利用分子手段调控紫杉醇的生物合成提供了理论基础。
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关键词
红豆杉属
BHLH
基因克隆
序列分析
紫杉醇
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Keywords
Taxus
bHLH
gene cloning
bioinformatics
taxol
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分类号
Q781
[生物学—分子生物学]
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