目的网络药理学是一门新兴的交叉学科,综合生物学、药学、数学和计算机科学等技术构建药物作用靶点与疾病间的复杂关系网络,从而分析药物作用机制。多组分、多靶点、组分间协同作用是中药的特点,因其成分复杂,系统庞大,研究人员开展药...目的网络药理学是一门新兴的交叉学科,综合生物学、药学、数学和计算机科学等技术构建药物作用靶点与疾病间的复杂关系网络,从而分析药物作用机制。多组分、多靶点、组分间协同作用是中药的特点,因其成分复杂,系统庞大,研究人员开展药物成分作用机制研究难度极大,基于此本文介绍一款分析中药有效成分、药物作用靶点以及与疾病相关药物作用靶点网络的综合数据库TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform),旨在帮助临床研究人员一站式实现中药复方网络药理学分析及其可视化,TCMSP数据库通过预测算法获得中药成分及其替代品作用疾病靶点间的关系,加深研究人员从基因层面对药理作用的认识,了解药物如何在特定途径、不同细胞类型以及不同患者中发挥作用,从而促进药物联合疗法的开发。展开更多
背景与目的有关口腔癌的发病率、病死率和其他负担及其长期趋势的数据是十分重要的,可以为决策者合理分配资源提供所需信息。本研究使用2017年全球疾病负担(Global Burden of Disease,GBD)报告,旨在评估1990年至2017年口腔癌的发病率、...背景与目的有关口腔癌的发病率、病死率和其他负担及其长期趋势的数据是十分重要的,可以为决策者合理分配资源提供所需信息。本研究使用2017年全球疾病负担(Global Burden of Disease,GBD)报告,旨在评估1990年至2017年口腔癌的发病率、病死率和伤残调整生命年(disability-adjusted life years,DALYs)。方法我们从2017年GBD报告中收集了1990年至2017年口腔癌的详细数据,计算了口腔癌的全球发病率、病死率、口腔癌所致的伤残调整生命年(DALYs)以及相应的年龄标准化率(age-standardized rates,ASRs);还根据地区和国家计算了口腔癌的年龄标准化发病率(ASRs of incidence,ASRI)、年龄标准化病死率(ASRs of mortality,ASRM)以及年龄标准化伤残调整生命年的年度百分比变化,以量化这些比率的长期趋势。结果我们对195个国家/地区超过28年的口腔癌的发病率、病死率和DALYs进行了追踪调查。1990年至2017年,全球口腔癌的发病率、病死率和DALYs增长了1.0倍。在此期间,口腔癌的ASRI也呈现类似的趋势,从4.41/100,000上升至4.84/100,000。1990年至2017年,ASRM大体保持稳定,为2.4/100,000;同样,年龄标准化的DALYs为64.0/100,000。巴基斯坦的ASRI最高(27.03/100,000,95%CI=22.13/100,000–32.75/100,000),其次是中国台湾,伊拉克则最低(0.96/100,000,95%CI=0.86/100,000-1.06/100,000)。巴基斯坦的ASRM最高(16.85/100,000,95%CI:13.92/100,000–20.17/100,000),科威特最低(0.51/100,000,95%CI:0.45/100,000–0.58/100,000)。结论全球口腔癌的ASRI略有增加,而ASRM和年龄标准化DALYs保持稳定。但是,各国之间的情况存在差异,提示应重新调整当前的预防策略,应在一些国家建立更有针对性的特殊策略,以防止口腔癌的增加。展开更多
随着分子生物学技术蓬勃发展,越来越多的肿瘤学者通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载高通量测序数据,运用生物信息学分析的方法,识别肿瘤免疫微环境中各种细胞的表达量,进行肿瘤浸润性免疫细胞的分析工作,但是肿瘤与免疫的相...随着分子生物学技术蓬勃发展,越来越多的肿瘤学者通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载高通量测序数据,运用生物信息学分析的方法,识别肿瘤免疫微环境中各种细胞的表达量,进行肿瘤浸润性免疫细胞的分析工作,但是肿瘤与免疫的相互作用往往十分复杂,临床工作人员面对庞大数据量展开分析工作仍然充满困难,基于此本文介绍一款全面分析肿瘤浸润性免疫细胞及其可视化的数据库TIMER2.0,旨在为临床研究人员轻松识别多种癌症类型与正常组织及免疫细胞浸润之间的基因组学关系,快速运用多种算法掌握肿瘤概况。展开更多
目的系统评价莫诺拉韦治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的疗效与安全性。方法计算机检索CNKI、VIP、WanFang Data、PubMed、Web of Science、Cochrane Library和Epistemonikos COVID-19 L OVE数据库,搜集莫诺拉韦治疗COVID-19的随机对照...目的系统评价莫诺拉韦治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的疗效与安全性。方法计算机检索CNKI、VIP、WanFang Data、PubMed、Web of Science、Cochrane Library和Epistemonikos COVID-19 L OVE数据库,搜集莫诺拉韦治疗COVID-19的随机对照试验(RCT),检索时限均从建库至2023年7月。由2名研究者独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用RevMan 5.4软件进行Meta分析。结果共纳入9个RCT,包括30675例患者。Meta分析结果显示,两组患者的28~29天住院率、28~29天死亡率、14~15天PCR检测结果转阴率和不良事件发生率的差异均无统计学意义(P>0.05)。莫诺拉韦组显著增加4类系统性器官疾病的不良事件发生率。结论当前证据显示,莫诺拉韦的安全性和对伴有进展为重症高风险COVID-19患者的益处尚不明确。受纳入研究数量和质量的限制,上述结论尚待更多高质量研究予以验证。展开更多
目的 基于美国监测,流行病学和最终结果(Surveillance,Epidemiology,and End Results,SEER)数据库,建立并验证预测乳腺髓样癌(medullary carcinoma of breast,MCB)患者5年和10年生存率的列线图模型。方法 从SEER数据库中收集2000年至201...目的 基于美国监测,流行病学和最终结果(Surveillance,Epidemiology,and End Results,SEER)数据库,建立并验证预测乳腺髓样癌(medullary carcinoma of breast,MCB)患者5年和10年生存率的列线图模型。方法 从SEER数据库中收集2000年至2015年诊断为MCB的患者临床资料,将患者按7∶3的比例随机分配至训练集和验证集。通过单因素和多因素Cox回归分析确定MCB患者预后的独立危险因素,并构建列线图预测MCB患者的5年和10年生存率。采用一致性指数(C指数)、受试者工作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristic curve,AUC)、校准图和决策曲线分析(decision curve analysis,DCA),比较列线图模型和美国癌症联合委员会(The American Joint Committee on Cancer,AJCC)分期系统之间的预测性能。结果共纳入2 086例MCB患者,其中训练集1 460例、验证集626例。单因素和多因素Cox回归分析显示诊断年龄、婚姻状况、AJCC分期和手术是影响MCB患者生存的危险因素,将它们纳入列线图并进行验证,训练集中,列线图显示5年总体生存率AUC为0.698,10年总体生存率AUC为0.707;验证集中,列线图显示5年总体生存率AUC为0.748,10年总体生存率AUC为0.729。校准图显示列线图模型的预测结果与实际观察结果有较好的一致性,DCA结果显示列线图在训练集和验证集中产生了较好的净收益。结论 通过Cox回归分析构建了MCB患者5年和10年生存率的列线图预测模型,经验证列线图有较好的预测性能。该模型不仅为患者生存预后提供更加个性化的评估,也能为临床医生选择个性化治疗方案提供参考。展开更多
文摘目的网络药理学是一门新兴的交叉学科,综合生物学、药学、数学和计算机科学等技术构建药物作用靶点与疾病间的复杂关系网络,从而分析药物作用机制。多组分、多靶点、组分间协同作用是中药的特点,因其成分复杂,系统庞大,研究人员开展药物成分作用机制研究难度极大,基于此本文介绍一款分析中药有效成分、药物作用靶点以及与疾病相关药物作用靶点网络的综合数据库TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform),旨在帮助临床研究人员一站式实现中药复方网络药理学分析及其可视化,TCMSP数据库通过预测算法获得中药成分及其替代品作用疾病靶点间的关系,加深研究人员从基因层面对药理作用的认识,了解药物如何在特定途径、不同细胞类型以及不同患者中发挥作用,从而促进药物联合疗法的开发。
文摘背景与目的有关口腔癌的发病率、病死率和其他负担及其长期趋势的数据是十分重要的,可以为决策者合理分配资源提供所需信息。本研究使用2017年全球疾病负担(Global Burden of Disease,GBD)报告,旨在评估1990年至2017年口腔癌的发病率、病死率和伤残调整生命年(disability-adjusted life years,DALYs)。方法我们从2017年GBD报告中收集了1990年至2017年口腔癌的详细数据,计算了口腔癌的全球发病率、病死率、口腔癌所致的伤残调整生命年(DALYs)以及相应的年龄标准化率(age-standardized rates,ASRs);还根据地区和国家计算了口腔癌的年龄标准化发病率(ASRs of incidence,ASRI)、年龄标准化病死率(ASRs of mortality,ASRM)以及年龄标准化伤残调整生命年的年度百分比变化,以量化这些比率的长期趋势。结果我们对195个国家/地区超过28年的口腔癌的发病率、病死率和DALYs进行了追踪调查。1990年至2017年,全球口腔癌的发病率、病死率和DALYs增长了1.0倍。在此期间,口腔癌的ASRI也呈现类似的趋势,从4.41/100,000上升至4.84/100,000。1990年至2017年,ASRM大体保持稳定,为2.4/100,000;同样,年龄标准化的DALYs为64.0/100,000。巴基斯坦的ASRI最高(27.03/100,000,95%CI=22.13/100,000–32.75/100,000),其次是中国台湾,伊拉克则最低(0.96/100,000,95%CI=0.86/100,000-1.06/100,000)。巴基斯坦的ASRM最高(16.85/100,000,95%CI:13.92/100,000–20.17/100,000),科威特最低(0.51/100,000,95%CI:0.45/100,000–0.58/100,000)。结论全球口腔癌的ASRI略有增加,而ASRM和年龄标准化DALYs保持稳定。但是,各国之间的情况存在差异,提示应重新调整当前的预防策略,应在一些国家建立更有针对性的特殊策略,以防止口腔癌的增加。
文摘随着分子生物学技术蓬勃发展,越来越多的肿瘤学者通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载高通量测序数据,运用生物信息学分析的方法,识别肿瘤免疫微环境中各种细胞的表达量,进行肿瘤浸润性免疫细胞的分析工作,但是肿瘤与免疫的相互作用往往十分复杂,临床工作人员面对庞大数据量展开分析工作仍然充满困难,基于此本文介绍一款全面分析肿瘤浸润性免疫细胞及其可视化的数据库TIMER2.0,旨在为临床研究人员轻松识别多种癌症类型与正常组织及免疫细胞浸润之间的基因组学关系,快速运用多种算法掌握肿瘤概况。
文摘目的系统评价莫诺拉韦治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的疗效与安全性。方法计算机检索CNKI、VIP、WanFang Data、PubMed、Web of Science、Cochrane Library和Epistemonikos COVID-19 L OVE数据库,搜集莫诺拉韦治疗COVID-19的随机对照试验(RCT),检索时限均从建库至2023年7月。由2名研究者独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用RevMan 5.4软件进行Meta分析。结果共纳入9个RCT,包括30675例患者。Meta分析结果显示,两组患者的28~29天住院率、28~29天死亡率、14~15天PCR检测结果转阴率和不良事件发生率的差异均无统计学意义(P>0.05)。莫诺拉韦组显著增加4类系统性器官疾病的不良事件发生率。结论当前证据显示,莫诺拉韦的安全性和对伴有进展为重症高风险COVID-19患者的益处尚不明确。受纳入研究数量和质量的限制,上述结论尚待更多高质量研究予以验证。
文摘目的 基于美国监测,流行病学和最终结果(Surveillance,Epidemiology,and End Results,SEER)数据库,建立并验证预测乳腺髓样癌(medullary carcinoma of breast,MCB)患者5年和10年生存率的列线图模型。方法 从SEER数据库中收集2000年至2015年诊断为MCB的患者临床资料,将患者按7∶3的比例随机分配至训练集和验证集。通过单因素和多因素Cox回归分析确定MCB患者预后的独立危险因素,并构建列线图预测MCB患者的5年和10年生存率。采用一致性指数(C指数)、受试者工作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristic curve,AUC)、校准图和决策曲线分析(decision curve analysis,DCA),比较列线图模型和美国癌症联合委员会(The American Joint Committee on Cancer,AJCC)分期系统之间的预测性能。结果共纳入2 086例MCB患者,其中训练集1 460例、验证集626例。单因素和多因素Cox回归分析显示诊断年龄、婚姻状况、AJCC分期和手术是影响MCB患者生存的危险因素,将它们纳入列线图并进行验证,训练集中,列线图显示5年总体生存率AUC为0.698,10年总体生存率AUC为0.707;验证集中,列线图显示5年总体生存率AUC为0.748,10年总体生存率AUC为0.729。校准图显示列线图模型的预测结果与实际观察结果有较好的一致性,DCA结果显示列线图在训练集和验证集中产生了较好的净收益。结论 通过Cox回归分析构建了MCB患者5年和10年生存率的列线图预测模型,经验证列线图有较好的预测性能。该模型不仅为患者生存预后提供更加个性化的评估,也能为临床医生选择个性化治疗方案提供参考。
