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基于网络药理学与肠道菌群的柏子仁脂肪油改善Aβ_(25-35)诱导小鼠脑损伤的作用研究 被引量：3
1
作者 曾梦楠 曹兵 +5 位作者 冯敖梓 郭彭莉 刘萌 张宇涵 李孟 郑晓珂 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第15期4046-4059,共14页
研究柏子仁脂肪油(Platycladi Semen oil,SP)对Aβ_(25-35)诱导小鼠脑损伤的保护作用及其机制,为临床治疗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)提供理论依据。雄性昆明(KM)小鼠随机分为对照组、模型组(脑部注射200μmol·L-1Aβ_(... 研究柏子仁脂肪油(Platycladi Semen oil,SP)对Aβ_(25-35)诱导小鼠脑损伤的保护作用及其机制,为临床治疗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)提供理论依据。雄性昆明(KM)小鼠随机分为对照组、模型组(脑部注射200μmol·L-1Aβ_(25-35)溶液,0.15μL·g^(-1))、阳性药多奈哌齐组(10 mg·kg^(-1))及柏子仁脂肪油低、高剂量(0.5、1 mL·kg^(-1))组。探究各组小鼠的学习记忆功能、神经元损伤、Aβ1-42/Aβ1-40、p-Tau、细胞凋亡、氧化应激相关指标、免疫细胞及鞘氨醇激酶1(sphingosine kinase 1,SPHK1)/鞘氨醇-1-磷酸(sphingosine-1-phosphate,S1P)/鞘氨醇-1-磷酸受体5(sphingosine-1-phosphate receptor 5,S1PR5)通路相关蛋白或mRNA水平。接着利用气相色谱-质谱联用(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)分析SP中的成分,并通过网络药理学、肠道菌群(gut mircrobiota,GM)16S rDNA测序及分子对接技术探讨SP干预AD的作用机制。结果显示SP可改善Aβ_(25-35)诱导小鼠的学习记忆功能,减少海马神经元损伤,降低脑内Aβ1-42/Aβ1-40、p-Tau、细胞凋亡和氧化应激相关指标的水平,并维持小鼠机体免疫细胞和GM的稳态。网络药理学和GM测序分析显示,SP对AD的治疗作用与鞘脂通路相关。同时,(Z,Z,Z)-9,12,15-十八碳三烯酸和(Z,Z)-9,12-十八碳二烯酸是SP中含量最高的2种成分,与SPHK1和S1PR5有较好的结合活性。因此,推测SP通过调节肠道菌群,抑制SPHK1/S1P/S1PR5通路来发挥抗凋亡和抗氧化作用,从而改善Aβ_(25-35)诱导小鼠的脑损伤;并且(Z,Z,Z)-9,12,15-十八碳三烯酸和(Z,Z)-9,12-十八碳二烯酸可能是SP发挥抗AD作用的物质基础。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 柏子仁脂肪油 肠道菌群 网络药理学 SPHK1/S1P/S1PR5信号通路
原文传递
多变量选择方法在临床预测模型中的验证:基于MIMIC数据库
2
作者 郑帅 黄韬 +4 位作者 杨瑞 李莉 乔萌萌 陈冲 吕军 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第12期1463-1467,共5页
目的验证不同变量选择方法对临床预测模型性能的影响。方法从MIMIC数据库中提取了3组样本数据集(急性心肌梗塞组、脓毒症组和脑出血组),用COX回归的直接进入、逐步向前、逐步向后、LASSO、岭回归、基于随机森林的变量重要性六种方法,选... 目的验证不同变量选择方法对临床预测模型性能的影响。方法从MIMIC数据库中提取了3组样本数据集(急性心肌梗塞组、脓毒症组和脑出血组),用COX回归的直接进入、逐步向前、逐步向后、LASSO、岭回归、基于随机森林的变量重要性六种方法,选出的不同方法的最优变量集构建模型,通过C指数、受试者工作特征曲线下面积(AUC值)和校准曲线,比较组内和组间的结果差异。结果6种变量选择方法筛选的变量及数目各不相同,但不管是组内还是组间,并没有显示出哪种方法有明显提高模型性能的优势。结论在使用变量选择方法建立临床预测模型前应首先明确研究目的并判断数据的类型,结合医学知识选择合适的方法。 展开更多
关键词 变量选择 临床预测模型 MIMIC数据库 模型建立
原文传递
ncRI数据库介绍及数据获取方法
3
作者 郑帅 白利峰 +2 位作者 韩迪迪 许丰硕 吕军 《中国循证心血管医学杂志》 2021年第7期773-776,共4页
ncRI是一个手动管理的数据库,用于记录实验验证的炎性疾病中的ncRNA,主要通过ncRNA和相关疾病相结合的方式搜索数据。数据库中包含了炎症过程中有关ncRNA的全面描述,机制和证据。目前ncRI共有11 166条记录,每条记录均包含有关ncRNA的名... ncRI是一个手动管理的数据库,用于记录实验验证的炎性疾病中的ncRNA,主要通过ncRNA和相关疾病相结合的方式搜索数据。数据库中包含了炎症过程中有关ncRNA的全面描述,机制和证据。目前ncRI共有11 166条记录,每条记录均包含有关ncRNA的名称、炎性疾病、机制、实验技术(例如RNA-seq、qRT-PCR)、实验样品(细胞系和/或组织)、ncRNA表达模式的详细信息(上调或下调)、参考信息等,其中包括来自2000多篇文章的1976种miRNA,1377种lncRNA和107种其他ncRNA,涉及3个物种(人类、小鼠和大鼠)。所有这些数据都是免费的,用户可以搜索、浏览和下载,ncRI数据库的目的是提供有关ncRNA及其在炎症性疾病中作用的相对全面且可靠的信息。 展开更多
关键词 炎症 NCRNA ncRI数据库
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