目的利用荧光标记辅助的扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术,从基因组DNA水平上分析我国6个栽培生产区域52份枸杞Lycium chinense样本的遗传多样性。方法对提取的枸杞DNA样本进行酶切、连接、预扩增...目的利用荧光标记辅助的扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术,从基因组DNA水平上分析我国6个栽培生产区域52份枸杞Lycium chinense样本的遗传多样性。方法对提取的枸杞DNA样本进行酶切、连接、预扩增和选扩增等步骤,扩增产物经毛细管电泳系统分离和数据采集后,利用Popgene软件计算遗传多样性参数,利用GenAlex软件计算遗传距离并进行主坐标分析,利用MEGA-X软件根据遗传距离进行聚类分析,利用Structure软件进行群体遗传结构分析。结果共筛选得到10对AFLP选择性扩增引物组合,扩增得到328条扩增片段,其中多态性片段121条,且在不同产地枸杞居群间多态性位点分布不均匀。分析显示不同栽培产区枸杞的遗传多样性较低,等位基因数(observed number of alleles,Na)、有效等位基因数(effective number of alleles,Ne)、观测杂合度(Nei’s gene diversity,H)和香浓信息指数(Shannon information index,I)分别为1.4380、1.2316、0.1407和0.2152,Nei’s遗传相似性范围为0.8354~0.8902。结论不同栽培生产区域的枸杞居群间存在较为频繁的基因交流,遗传分化程度中等。居群内部遗传变异是枸杞遗传变异的主要来源,居群间遗传变异不显著,同时遗传距离与地理距离没有明显相关性。可为枸杞的遗传背景信息积累、引种栽培、种质资源保护、核心种质库构建以及可持续开发策略的制定和管理提供科学依据。展开更多
文摘目的利用荧光标记辅助的扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术,从基因组DNA水平上分析我国6个栽培生产区域52份枸杞Lycium chinense样本的遗传多样性。方法对提取的枸杞DNA样本进行酶切、连接、预扩增和选扩增等步骤,扩增产物经毛细管电泳系统分离和数据采集后,利用Popgene软件计算遗传多样性参数,利用GenAlex软件计算遗传距离并进行主坐标分析,利用MEGA-X软件根据遗传距离进行聚类分析,利用Structure软件进行群体遗传结构分析。结果共筛选得到10对AFLP选择性扩增引物组合,扩增得到328条扩增片段,其中多态性片段121条,且在不同产地枸杞居群间多态性位点分布不均匀。分析显示不同栽培产区枸杞的遗传多样性较低,等位基因数(observed number of alleles,Na)、有效等位基因数(effective number of alleles,Ne)、观测杂合度(Nei’s gene diversity,H)和香浓信息指数(Shannon information index,I)分别为1.4380、1.2316、0.1407和0.2152,Nei’s遗传相似性范围为0.8354~0.8902。结论不同栽培生产区域的枸杞居群间存在较为频繁的基因交流,遗传分化程度中等。居群内部遗传变异是枸杞遗传变异的主要来源,居群间遗传变异不显著,同时遗传距离与地理距离没有明显相关性。可为枸杞的遗传背景信息积累、引种栽培、种质资源保护、核心种质库构建以及可持续开发策略的制定和管理提供科学依据。
