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新疆2018年食源性致病菌污染状况监测及分析 被引量：1
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作者 杜冬冬 殷月兰 +4 位作者 钱晶 王静 王国红 罗瑞峰 康立超 《新疆农垦科技》 2021年第6期60-62,共3页
通过调查新疆市售食品中食源性致病菌的污染情况,根据GB/T 4789《食品卫生微生物学检验》、《国家食品污染和有害因素风险工作手册》对新疆市售食品进行食源性致病菌检测,结果得出12类食品有7类检出致病菌,总检出率6.20%(41/661)。其中... 通过调查新疆市售食品中食源性致病菌的污染情况,根据GB/T 4789《食品卫生微生物学检验》、《国家食品污染和有害因素风险工作手册》对新疆市售食品进行食源性致病菌检测,结果得出12类食品有7类检出致病菌,总检出率6.20%(41/661)。其中水产及制品中食源性致病菌检出率最高(28.33%,17/60);其次为肉与肉制品(26.32%,5/19)。不同类别食品致病菌检出率比较,差异有统计学意义(χ^(2)=967.029,P<0.01)。检测的9项致病菌均有检出,共检出45株,其中弧菌检出率最高(25%,15/60)。新疆市售食品遭受不同程度的食源性致病菌污染,相关部门应进一步加强重点食品的监管力度,防止食源性疾病的暴发,为食源性疾病防控提供参考依据。 展开更多
关键词 食品安全 食源性致病菌 污染
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单核细胞增生李斯特菌LMXJ15全基因组测序及分析
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作者 杜冬冬 钱晶 +5 位作者 李思琪 刘雯菲 魏向利 刘长勇 罗瑞峰 康立超 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期298-306,共9页
为了解新疆地区单核细胞增生李斯特菌LMXJ15菌株的的基因组特征和进化关系。采用PacBio和Illumina HiSeq测序对LMXJ15菌株进行全基因组测序,使用相关软件对测序数据进行预测、注释,并进行多位点序列分型(mutilocus sequence typing,MLST... 为了解新疆地区单核细胞增生李斯特菌LMXJ15菌株的的基因组特征和进化关系。采用PacBio和Illumina HiSeq测序对LMXJ15菌株进行全基因组测序,使用相关软件对测序数据进行预测、注释,并进行多位点序列分型(mutilocus sequence typing,MLST)及共线性分析菌株间的同源性。结果显示单核细胞增生李斯特菌LMXJ15菌株基因组总长度为3017732 bp,平均GC含量为37.81%,预测到3154个编码基因,编码基因总长度为2734315 bp;包含6个rRNA操纵子和57个tRNA。编码基因通过CRT预测,发现一个CRISPR序列;通过GO数据库的对比分析,得到三类功能方面的2241个基因。预测到可能的毒力基因88个。MLST分析显示LMXJ15菌株为ST8型(sequence type,ST),属于CC8(clonal complex,CC)复合克隆系;进化分析显示其与意大利分离株IZSAM_Lm_15_17439_A144、瑞士分离株LmN1546和一株从熏鲑鱼分离菌株R479a在同一个进化分支上,具有相同的ST型和血清型(1/2a),并通过比较基因组分析显示4株LM的基因组之间的共线性较好。该研究初步分析了LMXJ15菌株基因组特征,毒力基因携带情况,为新疆地区单核细胞增生李斯特菌毒力和进化关系研究提供基础数据。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 全基因组 多位点序列分型
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